Protein–RNA interactions for Protein: Q13242

SRSF9, Serine/arginine-rich splicing factor 9, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF9Q13242 NOP56-204ENST00000460258 837 ntTSL 47.75□□□□□ -1.171e-8■■□□□ 12
SRSF9Q13242 NOP56-214ENST00000484998 998 ntTSL 55.31□□□□□ -1.561e-8■■□□□ 12
SRSF9Q13242 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.542e-9■■□□□ 11.9
SRSF9Q13242 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.032e-9■■□□□ 11.9
SRSF9Q13242 AHSA2-204ENST00000463681 453 ntTSL 514.47□□□□□ -0.092e-9■■□□□ 11.9
SRSF9Q13242 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.82e-9■■□□□ 11.9
SRSF9Q13242 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.233e-9■■□□□ 11.9
SRSF9Q13242 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.473e-9■■□□□ 11.9
SRSF9Q13242 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.483e-9■■□□□ 11.9
SRSF9Q13242 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC11.98□□□□□ -0.493e-9■■□□□ 11.9
SRSF9Q13242 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.783e-9■■□□□ 11.9
SRSF9Q13242 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.181e-8■■□□□ 11.9
SRSF9Q13242 GOLGA3-201ENST00000204726 9252 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.71e-8■■□□□ 11.9
SRSF9Q13242 GOLGA3-202ENST00000450791 8870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.791e-8■■□□□ 11.9
SRSF9Q13242 GOLGA3-207ENST00000545875 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.041e-8■■□□□ 11.9
SRSF9Q13242 EEF1D-237ENST00000531281 813 ntTSL 210.63□□□□□ -0.716e-8■■□□□ 11.9
SRSF9Q13242 EEF1D-244ENST00000532543 791 ntTSL 310.03□□□□□ -0.86e-8■■□□□ 11.9
SRSF9Q13242 EEF1D-239ENST00000531670 926 ntTSL 39.58□□□□□ -0.886e-8■■□□□ 11.9
SRSF9Q13242 TWNK-205ENST00000476766 838 ntTSL 39.53□□□□□ -0.883e-6■■□□□ 11.9
SRSF9Q13242 TWNK-201ENST00000311916 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.013e-6■■□□□ 11.9
SRSF9Q13242 TWNK-202ENST00000370228 3175 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.043e-6■■□□□ 11.9
SRSF9Q13242 TWNK-204ENST00000473656 946 ntTSL 27.15□□□□□ -1.263e-6■■□□□ 11.9
SRSF9Q13242 TWNK-203ENST00000459764 327 ntTSL 34.96□□□□□ -1.623e-6■■□□□ 11.9
SRSF9Q13242 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.024e-7■■□□□ 11.9
SRSF9Q13242 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.12e-6■■□□□ 11.8
SRSF9Q13242 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.262e-6■■□□□ 11.8
SRSF9Q13242 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.292e-6■■□□□ 11.8
SRSF9Q13242 BRD2-216ENST00000581002 550 ntTSL 412.45□□□□□ -0.422e-6■■□□□ 11.8
SRSF9Q13242 BRD2-217ENST00000584808 547 ntTSL 412.45□□□□□ -0.422e-6■■□□□ 11.8
SRSF9Q13242 BRD2-213ENST00000495733 3404 ntTSL 211.85□□□□□ -0.512e-6■■□□□ 11.8
SRSF9Q13242 BRD2-212ENST00000482914 4834 ntTSL 1 (best)11.64□□□□□ -0.552e-6■■□□□ 11.8
SRSF9Q13242 BRD2-215ENST00000580234 718 ntTSL 411.41□□□□□ -0.582e-6■■□□□ 11.8
SRSF9Q13242 BRD2-206ENST00000456339 887 ntTSL 49.33□□□□□ -0.922e-6■■□□□ 11.8
SRSF9Q13242 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.064e-6■■□□□ 11.8
SRSF9Q13242 GPI-208ENST00000588991 2021 ntTSL 214.53□□□□□ -0.084e-6■■□□□ 11.8
SRSF9Q13242 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.614e-6■■□□□ 11.8
SRSF9Q13242 GPI-202ENST00000415930 4000 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.484e-6■■□□□ 11.8
SRSF9Q13242 RBM3-210ENST00000491236 729 ntTSL 211.55□□□□□ -0.562e-8■■□□□ 11.8
SRSF9Q13242 RBM3-206ENST00000485213 947 ntTSL 211.45□□□□□ -0.582e-8■■□□□ 11.8
SRSF9Q13242 RBM3-204ENST00000466764 1375 ntTSL 310.27□□□□□ -0.762e-8■■□□□ 11.8
SRSF9Q13242 RBM3-211ENST00000491240 951 ntTSL 1 (best)10.06□□□□□ -0.82e-8■■□□□ 11.8
SRSF9Q13242 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.832e-8■■□□□ 11.8
SRSF9Q13242 RBM3-207ENST00000488216 835 ntTSL 39.68□□□□□ -0.862e-8■■□□□ 11.8
SRSF9Q13242 RBM3-205ENST00000472897 501 ntTSL 59.66□□□□□ -0.862e-8■■□□□ 11.8
SRSF9Q13242 RBM3-203ENST00000376759 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.042e-8■■□□□ 11.8
SRSF9Q13242 RBM3-208ENST00000489344 724 ntTSL 28.54□□□□□ -1.042e-8■■□□□ 11.8
SRSF9Q13242 RBM3-209ENST00000490127 567 ntTSL 56.94□□□□□ -1.32e-8■■□□□ 11.8
SRSF9Q13242 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.233e-6■■□□□ 11.7
SRSF9Q13242 TOX3-205ENST00000568436 548 ntTSL 311.97□□□□□ -0.495e-9■■□□□ 11.7
SRSF9Q13242 DQX1-205ENST00000473508 2136 ntTSL 211.54□□□□□ -0.563e-6■■□□□ 11.7
SRSF9Q13242 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.655e-9■■□□□ 11.7
SRSF9Q13242 ZNF44-205ENST00000397742 2372 ntTSL 210.45□□□□□ -0.743e-6■■□□□ 11.7
SRSF9Q13242 DQX1-202ENST00000404568 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.823e-6■■□□□ 11.7
SRSF9Q13242 WDR55-203ENST00000506393 2477 ntTSL 29.73□□□□□ -0.853e-6■■□□□ 11.7
SRSF9Q13242 DQX1-204ENST00000451518 555 ntTSL 49.53□□□□□ -0.883e-6■■□□□ 11.7
SRSF9Q13242 DQX1-201ENST00000393951 2540 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.93e-6■■□□□ 11.7
SRSF9Q13242 ZNF44-202ENST00000355684 2119 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.913e-6■■□□□ 11.7
SRSF9Q13242 ZNF44-208ENST00000600003 2051 ntTSL 29.06□□□□□ -0.963e-6■■□□□ 11.7
SRSF9Q13242 ZNF44-206ENST00000483826 556 ntTSL 28.79□□□□□ -13e-6■■□□□ 11.7
SRSF9Q13242 DQX1-208ENST00000498552 100 ntTSL 38.22□□□□□ -1.093e-6■■□□□ 11.7
SRSF9Q13242 ZNF44-203ENST00000356109 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.16□□□□□ -1.13e-6■■□□□ 11.7
SRSF9Q13242 WDR55-201ENST00000358337 4080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.143e-6■■□□□ 11.7
SRSF9Q13242 TRIM65-205ENST00000591668 644 ntTSL 27.7□□□□□ -1.183e-6■■□□□ 11.7
SRSF9Q13242 ZNF44-204ENST00000393337 3236 ntTSL 1 (best)7.3□□□□□ -1.243e-6■■□□□ 11.7
SRSF9Q13242 ZNF44-201ENST00000354656 517 ntTSL 37.16□□□□□ -1.263e-6■■□□□ 11.7
SRSF9Q13242 TOX3-203ENST00000563091 572 ntTSL 45.56□□□□□ -1.525e-9■■□□□ 11.7
SRSF9Q13242 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.725e-9■■□□□ 11.7
SRSF9Q13242 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC2.49□□□□□ -2.013e-6■■□□□ 11.7
SRSF9Q13242 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.169e-8■■□□□ 11.7
SRSF9Q13242 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.168e-6■■□□□ 11.7
SRSF9Q13242 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.918e-6■■□□□ 11.7
SRSF9Q13242 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.778e-6■■□□□ 11.7
SRSF9Q13242 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.398e-6■■□□□ 11.7
SRSF9Q13242 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.348e-6■■□□□ 11.7
SRSF9Q13242 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.48e-6■■□□□ 11.7
SRSF9Q13242 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.568e-6■■□□□ 11.7
SRSF9Q13242 AGAP1-214ENST00000635100 2478 ntTSL 511.38□□□□□ -0.598e-6■■□□□ 11.7
SRSF9Q13242 ZFC3H1-207ENST00000549407 852 ntTSL 311.36□□□□□ -0.598e-6■■□□□ 11.7
SRSF9Q13242 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.648e-6■■□□□ 11.7
SRSF9Q13242 ZNF548-204ENST00000594693 552 ntTSL 410.84□□□□□ -0.678e-6■■□□□ 11.7
SRSF9Q13242 ZFC3H1-212ENST00000552994 7597 ntTSL 1 (best)10.81□□□□□ -0.688e-6■■□□□ 11.7
SRSF9Q13242 ZFC3H1-201ENST00000378743 7285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.688e-6■■□□□ 11.7
SRSF9Q13242 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.728e-6■■□□□ 11.7
SRSF9Q13242 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.738e-6■■□□□ 11.7
SRSF9Q13242 AGAP1-212ENST00000614409 9932 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.818e-6■■□□□ 11.7
SRSF9Q13242 LONP2-208ENST00000566755 2514 ntTSL 59.66□□□□□ -0.868e-6■■□□□ 11.7
SRSF9Q13242 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.888e-6■■□□□ 11.7
SRSF9Q13242 ZNF548-212ENST00000602086 567 ntTSL 49.56□□□□□ -0.888e-6■■□□□ 11.7
SRSF9Q13242 AC003002.4-202ENST00000600421 579 ntTSL 49.56□□□□□ -0.888e-6■■□□□ 11.7
SRSF9Q13242 CALD1-215ENST00000472096 651 ntTSL 29.26□□□□□ -0.938e-6■■□□□ 11.7
SRSF9Q13242 LONP2-203ENST00000535754 2580 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.948e-6■■□□□ 11.7
SRSF9Q13242 AGAP1-207ENST00000428334 10090 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.948e-6■■□□□ 11.7
SRSF9Q13242 LONP2-201ENST00000285737 8199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.978e-6■■□□□ 11.7
SRSF9Q13242 ZNF548-202ENST00000366197 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.018e-6■■□□□ 11.7
SRSF9Q13242 LONP2-202ENST00000416006 2056 ntTSL 28.65□□□□□ -1.028e-6■■□□□ 11.7
SRSF9Q13242 ZNF548-210ENST00000600442 535 ntTSL 48.64□□□□□ -1.038e-6■■□□□ 11.7
SRSF9Q13242 ZNF548-201ENST00000336128 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.038e-6■■□□□ 11.7
SRSF9Q13242 ZNF548-209ENST00000598895 571 ntTSL 4 BASIC8.35□□□□□ -1.078e-6■■□□□ 11.7
SRSF9Q13242 AIG1-203ENST00000367596 559 ntTSL 2 BASIC8.1□□□□□ -1.118e-6■■□□□ 11.7
SRSF9Q13242 ANP32B-202ENST00000473205 687 ntTSL 37.85□□□□□ -1.153e-11■■□□□ 11.7
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