Protein–RNA interactions for Protein: Q13242

SRSF9, Serine/arginine-rich splicing factor 9, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF9Q13242 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.227e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.237e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 AKAP8L-202ENST00000593845 2749 ntTSL 213.35□□□□□ -0.277e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.287e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.287e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.297e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.317e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 STK25-213ENST00000436402 600 ntTSL 512.62□□□□□ -0.397e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 REPIN1-213ENST00000488943 1262 ntTSL 512.6□□□□□ -0.397e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.47e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.47e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 REPIN1-208ENST00000475514 1192 ntTSL 512.49□□□□□ -0.417e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 REPIN1-207ENST00000473391 1064 ntTSL 212.48□□□□□ -0.417e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 STK25-229ENST00000492127 1153 ntTSL 212.47□□□□□ -0.417e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 CTTN-205ENST00000415461 1021 ntTSL 312.41□□□□□ -0.427e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 STK25-217ENST00000442307 923 ntTSL 212.29□□□□□ -0.447e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.467e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.527e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.527e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.557e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.567e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 AKAP8L-209ENST00000595879 790 ntTSL 311.44□□□□□ -0.587e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 STK25-211ENST00000429279 580 ntTSL 411.27□□□□□ -0.617e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 STK25-218ENST00000450497 882 ntTSL 511.24□□□□□ -0.617e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.637e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 REPIN1-216ENST00000518462 621 ntTSL 411.08□□□□□ -0.647e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 AKAP8L-212ENST00000596750 906 ntTSL 310.94□□□□□ -0.667e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 EXOC7-217ENST00000589507 820 ntTSL 510.87□□□□□ -0.677e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 AXIN2-204ENST00000577278 976 ntTSL 510.62□□□□□ -0.717e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 EXOC7-216ENST00000589210 4751 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.717e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.727e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.777e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.787e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 EXOC7-207ENST00000411744 2031 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.887e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 REPIN1-218ENST00000519397 583 ntTSL 49.57□□□□□ -0.887e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 EXOC7-201ENST00000332065 4596 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.927e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 STK25-216ENST00000440109 935 ntTSL 39.16□□□□□ -0.947e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC9.13□□□□□ -0.957e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 EXOC7-204ENST00000405068 2958 ntTSL 28.8□□□□□ -17e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 STK25-226ENST00000479442 511 ntTSL 28.77□□□□□ -1.017e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 EXOC7-221ENST00000634349 2124 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.067e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 EXOC7-205ENST00000405575 2208 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.067e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 EXOC7-202ENST00000335146 3519 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.17e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 REPIN1-211ENST00000486714 824 ntTSL 58.01□□□□□ -1.137e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 STK25-233ENST00000496159 463 ntTSL 27.37□□□□□ -1.237e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 STK25-220ENST00000461760 644 ntTSL 37.34□□□□□ -1.237e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 EXOC7-206ENST00000406660 718 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.267e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 EXOC7-220ENST00000607838 3353 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.327e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 STK25-206ENST00000413760 801 ntTSL 36.42□□□□□ -1.387e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 REPIN1-212ENST00000487455 464 ntTSL 45.79□□□□□ -1.487e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 STK25-212ENST00000435225 570 ntTSL 45.51□□□□□ -1.537e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 MST1-210ENST00000484673 1307 ntTSL 212.64□□□□□ -0.394e-14■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 MST1-211ENST00000488350 4152 ntTSL 511.6□□□□□ -0.554e-14■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 MST1-216ENST00000492370 1374 ntTSL 1 (best)11.34□□□□□ -0.594e-14■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 MST1-209ENST00000484269 1518 ntTSL 511.25□□□□□ -0.614e-14■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.744e-14■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 MST1-219ENST00000494828 621 ntTSL 48.81□□□□□ -14e-14■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 MST1-213ENST00000490966 829 ntTSL 58.41□□□□□ -1.064e-14■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 WDR6-214ENST00000488572 610 ntTSL 412.4□□□□□ -0.421e-7■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 WDR6-213ENST00000473238 568 ntTSL 311.9□□□□□ -0.51e-7■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 WDR6-206ENST00000438660 852 ntTSL 511.11□□□□□ -0.631e-7■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 WDR6-210ENST00000462064 589 ntTSL 510.57□□□□□ -0.721e-7■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 WDR6-216ENST00000489684 1155 ntTSL 210.03□□□□□ -0.81e-7■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 BCL2L1-205ENST00000422920 1157 ntTSL 215.73■□□□□ 0.113e-10■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 BCL2L1-208ENST00000450273 894 ntTSL 311.21□□□□□ -0.613e-10■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 BCL2L1-209ENST00000456404 914 ntTSL 210.98□□□□□ -0.653e-10■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.783e-10■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.793e-10■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 BCL2L1-203ENST00000376062 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.843e-10■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 BCL2L1-207ENST00000439267 781 ntTSL 27.26□□□□□ -1.253e-10■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 BCL2L1-204ENST00000420488 820 ntTSL 26.63□□□□□ -1.353e-10■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 ERH-201ENST00000216520 668 ntTSL 39.1□□□□□ -0.952e-7■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.992e-7■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 SLC17A9-204ENST00000459704 2015 ntTSL 312.58□□□□□ -0.44e-19■□□□□ 8.1
SRSF9Q13242 RAB17-207ENST00000416106 587 ntTSL 39.05□□□□□ -0.962e-7■□□□□ 8.1
SRSF9Q13242 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.132e-7■□□□□ 8.1
SRSF9Q13242 RHOT2-219ENST00000568950 1343 ntTSL 513.81□□□□□ -0.22e-7■□□□□ 8.1
SRSF9Q13242 RHOT2-202ENST00000561711 644 ntTSL 313.62□□□□□ -0.232e-7■□□□□ 8.1
SRSF9Q13242 RHOT2-222ENST00000569675 2559 ntTSL 213.26□□□□□ -0.292e-7■□□□□ 8.1
SRSF9Q13242 RHOT2-218ENST00000568636 3098 ntTSL 212.53□□□□□ -0.42e-7■□□□□ 8.1
SRSF9Q13242 RHOT2-221ENST00000569358 1273 ntTSL 512.38□□□□□ -0.432e-7■□□□□ 8.1
SRSF9Q13242 RHOT2-227ENST00000602564 3695 ntTSL 511.36□□□□□ -0.592e-7■□□□□ 8.1
SRSF9Q13242 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.612e-7■□□□□ 8.1
SRSF9Q13242 WDR6-205ENST00000429900 563 ntTSL 510.57□□□□□ -0.722e-7■□□□□ 8.1
SRSF9Q13242 RHOT2-213ENST00000565004 1014 ntTSL 59.82□□□□□ -0.842e-7■□□□□ 8.1
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