Protein–RNA interactions for Protein: Q13242

SRSF9, Serine/arginine-rich splicing factor 9, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF9Q13242 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.159e-18■■■■■ 56
SRSF9Q13242 SPATA20-206ENST00000504265 877 ntTSL 212.93□□□□□ -0.349e-18■■■■■ 56
SRSF9Q13242 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.419e-18■■■■■ 56
SRSF9Q13242 SPATA20-205ENST00000503127 2734 ntTSL 1 (best)12□□□□□ -0.499e-18■■■■■ 56
SRSF9Q13242 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.59e-18■■■■■ 56
SRSF9Q13242 SPATA20-207ENST00000504271 806 ntTSL 211.43□□□□□ -0.589e-18■■■■■ 56
SRSF9Q13242 SPATA20-228ENST00000635113 1706 ntTSL 1 (best)11.32□□□□□ -0.69e-18■■■■■ 56
SRSF9Q13242 SPATA20-223ENST00000513618 629 ntTSL 210.96□□□□□ -0.659e-18■■■■■ 56
SRSF9Q13242 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.759e-18■■■■■ 56
SRSF9Q13242 SPATA20-225ENST00000515619 818 ntTSL 59.97□□□□□ -0.819e-18■■■■■ 56
SRSF9Q13242 SPATA20-217ENST00000511347 1035 ntTSL 59.89□□□□□ -0.839e-18■■■■■ 56
SRSF9Q13242 SPATA20-204ENST00000503063 3232 ntTSL 29.82□□□□□ -0.849e-18■■■■■ 56
SRSF9Q13242 SPATA20-220ENST00000511937 2669 ntTSL 1 (best)9.72□□□□□ -0.859e-18■■■■■ 56
SRSF9Q13242 SPATA20-208ENST00000504334 3539 ntTSL 29.7□□□□□ -0.869e-18■■■■■ 56
SRSF9Q13242 SPATA20-214ENST00000508528 512 ntTSL 57.71□□□□□ -1.189e-18■■■■■ 56
SRSF9Q13242 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.289e-7■■■■■ 47.9
SRSF9Q13242 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.559e-7■■■■■ 47.9
SRSF9Q13242 FAM118A-201ENST00000216214 3458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.779e-7■■■■■ 47.9
SRSF9Q13242 ANP32B-201ENST00000339399 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.158e-8■■■■■ 47.2
SRSF9Q13242 TACC1-212ENST00000521050 491 ntTSL 1 (best)10.46□□□□□ -0.732e-14■■■■■ 45.5
SRSF9Q13242 TACC1-216ENST00000521642 493 ntTSL 1 (best)9.96□□□□□ -0.822e-14■■■■■ 45.5
SRSF9Q13242 TACC1-208ENST00000520340 1976 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.992e-14■■■■■ 45.5
SRSF9Q13242 TACC1-223ENST00000522904 1724 ntTSL 58.59□□□□□ -1.032e-14■■■■■ 45.5
SRSF9Q13242 TACC1-222ENST00000522752 944 ntTSL 1 (best)8.58□□□□□ -1.042e-14■■■■■ 45.5
SRSF9Q13242 TACC1-204ENST00000518415 3011 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.192e-14■■■■■ 45.5
SRSF9Q13242 TACC1-210ENST00000520615 5509 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.372e-14■■■■■ 45.5
SRSF9Q13242 TACC1-207ENST00000519416 5510 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.382e-14■■■■■ 45.5
SRSF9Q13242 TACC1-229ENST00000524354 476 ntTSL 56.31□□□□□ -1.42e-14■■■■■ 45.5
SRSF9Q13242 TACC1-226ENST00000523239 519 ntTSL 55.41□□□□□ -1.542e-14■■■■■ 45.5
SRSF9Q13242 TACC1-220ENST00000522544 372 ntTSL 54.13□□□□□ -1.752e-14■■■■■ 45.5
SRSF9Q13242 EXOC3L4-207ENST00000560925 2341 ntTSL 217.46■□□□□ 0.397e-14■■■■■ 44.2
SRSF9Q13242 EXOC3L4-205ENST00000560102 563 ntTSL 313.3□□□□□ -0.287e-14■■■■■ 44.2
SRSF9Q13242 EXOC3L4-203ENST00000559661 665 ntTSL 511.06□□□□□ -0.647e-14■■■■■ 44.2
SRSF9Q13242 METTL17-219ENST00000555902 868 ntTSL 35.75□□□□□ -1.497e-14■■■■■ 44.2
SRSF9Q13242 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.162e-12■■■■■ 42.9
SRSF9Q13242 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.392e-12■■■■■ 42.9
SRSF9Q13242 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.52e-12■■■■■ 42.9
SRSF9Q13242 MIR941-1-201ENST00000636396 72 ntBASIC7.48□□□□□ -1.211e-12■■■■■ 42.5
SRSF9Q13242 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.742e-12■■■■■ 41.8
SRSF9Q13242 ANP32E-210ENST00000629042 3054 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.872e-12■■■■■ 41.8
SRSF9Q13242 ANP32E-208ENST00000583931 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.162e-12■■■■■ 41.8
SRSF9Q13242 ANP32E-203ENST00000436748 1339 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.52e-12■■■■■ 41.8
SRSF9Q13242 ANP32E-205ENST00000533654 908 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.532e-12■■■■■ 41.8
SRSF9Q13242 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -22e-12■■■■■ 41.8
SRSF9Q13242 ANP32E-207ENST00000534437 616 ntTSL 32.17□□□□□ -2.062e-12■■■■■ 41.8
SRSF9Q13242 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.112e-12■■■■■ 41.8
SRSF9Q13242 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.612e-8■■■■■ 41.5
SRSF9Q13242 CCDC183-204ENST00000479371 1786 ntTSL 1 (best)11.08□□□□□ -0.642e-8■■■■■ 41.5
SRSF9Q13242 CCDC183-203ENST00000430612 2321 ntTSL 210.97□□□□□ -0.652e-8■■■■■ 41.5
SRSF9Q13242 CCDC183-205ENST00000481601 1556 ntTSL 29.97□□□□□ -0.812e-8■■■■■ 41.5
SRSF9Q13242 CCDC183-202ENST00000371682 1437 ntTSL 59.79□□□□□ -0.842e-8■■■■■ 41.5
SRSF9Q13242 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.834e-8■■■■■ 41.2
SRSF9Q13242 FAM118A-211ENST00000477714 756 ntTSL 28.35□□□□□ -1.071e-6■■■■■ 41.1
SRSF9Q13242 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.572e-11■■■■■ 40.2
SRSF9Q13242 VWCE-201ENST00000301770 3368 ntTSL 1 (best)10.97□□□□□ -0.652e-11■■■■■ 40.2
SRSF9Q13242 VWCE-206ENST00000538438 1076 ntTSL 39.86□□□□□ -0.832e-11■■■■■ 40.2
SRSF9Q13242 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.92e-11■■■■■ 40.2
SRSF9Q13242 VWCE-208ENST00000613271 3032 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.922e-11■■■■■ 40.2
SRSF9Q13242 C1GALT1-203ENST00000419721 591 ntTSL 312.84□□□□□ -0.357e-12■■■■■ 38.4
SRSF9Q13242 C1GALT1-206ENST00000467716 458 ntTSL 510.74□□□□□ -0.697e-12■■■■■ 38.4
SRSF9Q13242 C1GALT1-205ENST00000436587 6235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.777e-12■■■■■ 38.4
SRSF9Q13242 C1GALT1-204ENST00000429911 802 ntTSL 58.36□□□□□ -1.077e-12■■■■■ 38.4
SRSF9Q13242 C1GALT1-207ENST00000476068 1186 ntTSL 1 (best)7.89□□□□□ -1.157e-12■■■■■ 38.4
SRSF9Q13242 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.661e-10■■■■■ 35.9
SRSF9Q13242 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.661e-10■■■■■ 35.9
SRSF9Q13242 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.031e-10■■■■■ 35.9
SRSF9Q13242 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.11e-10■■■■■ 35.9
SRSF9Q13242 RELN-201ENST00000343529 11565 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.931e-10■■■■■ 35.9
SRSF9Q13242 RELN-202ENST00000424685 11571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.931e-10■■■■■ 35.9
SRSF9Q13242 RELN-203ENST00000428762 11571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.931e-10■■■■■ 35.9
SRSF9Q13242 RBM25-205ENST00000527432 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.261e-10■■■■■ 35.9
SRSF9Q13242 RBM25-201ENST00000261973 6910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.311e-10■■■■■ 35.9
SRSF9Q13242 RBM25-212ENST00000532683 6848 ntTSL 1 (best)5□□□□□ -1.611e-10■■■■■ 35.9
SRSF9Q13242 RBM25-207ENST00000528081 3008 ntTSL 24.36□□□□□ -1.711e-10■■■■■ 35.9
SRSF9Q13242 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.881e-323■■■■■ 34.7
SRSF9Q13242 MALAT1-217ENST00000620902 352 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.581e-323■■■■■ 34.7
SRSF9Q13242 ARIH1-206ENST00000564062 612 ntTSL 319.51■□□□□ 0.714e-10■■■■■ 34.2
SRSF9Q13242 ARIH1-210ENST00000570085 807 ntTSL 318.23■□□□□ 0.514e-10■■■■■ 34.2
SRSF9Q13242 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.544e-10■■■■■ 34.2
SRSF9Q13242 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.143e-8■■■■■ 33.2
SRSF9Q13242 PELP1-214ENST00000575329 3280 ntTSL 212□□□□□ -0.493e-8■■■■■ 33.2
SRSF9Q13242 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.623e-8■■■■■ 33.2
SRSF9Q13242 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.653e-8■■■■■ 33.2
SRSF9Q13242 PELP1-211ENST00000573523 3878 ntTSL 210.78□□□□□ -0.683e-8■■■■■ 33.2
SRSF9Q13242 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.73e-8■■■■■ 33.2
SRSF9Q13242 HDLBP-218ENST00000441124 708 ntTSL 211.47□□□□□ -0.573e-10■■■■■ 32.5
SRSF9Q13242 HDLBP-214ENST00000427183 6238 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.63e-10■■■■■ 32.5
SRSF9Q13242 HDLBP-244ENST00000490697 581 ntTSL 411.02□□□□□ -0.653e-10■■■■■ 32.5
SRSF9Q13242 HDLBP-212ENST00000426343 594 ntTSL 411.02□□□□□ -0.653e-10■■■■■ 32.5
SRSF9Q13242 HDLBP-208ENST00000422080 578 ntTSL 311.02□□□□□ -0.653e-10■■■■■ 32.5
SRSF9Q13242 HDLBP-204ENST00000391976 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.683e-10■■■■■ 32.5
SRSF9Q13242 HDLBP-203ENST00000391975 6372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.753e-10■■■■■ 32.5
SRSF9Q13242 HDLBP-223ENST00000449864 529 ntTSL 59.73□□□□□ -0.853e-10■■■■■ 32.5
SRSF9Q13242 HDLBP-201ENST00000310931 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.073e-10■■■■■ 32.5
SRSF9Q13242 HDLBP-210ENST00000423693 544 ntTSL 57.97□□□□□ -1.133e-10■■■■■ 32.5
SRSF9Q13242 HDLBP-246ENST00000496569 374 ntTSL 47.5□□□□□ -1.213e-10■■■■■ 32.5
SRSF9Q13242 HDLBP-224ENST00000452065 996 ntTSL 56.85□□□□□ -1.313e-10■■■■■ 32.5
SRSF9Q13242 HDLBP-207ENST00000420451 559 ntTSL 46.62□□□□□ -1.353e-10■■■■■ 32.5
SRSF9Q13242 HDLBP-227ENST00000458564 420 ntTSL 36.48□□□□□ -1.373e-10■■■■■ 32.5
SRSF9Q13242 HDLBP-211ENST00000425989 530 ntTSL 56.47□□□□□ -1.373e-10■■■■■ 32.5
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