Protein–RNA interactions for Protein: Q13242

SRSF9, Serine/arginine-rich splicing factor 9, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF9Q13242 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.159e-18■■■■■ 56
SRSF9Q13242 SPATA20-206ENST00000504265 877 ntTSL 212.93□□□□□ -0.349e-18■■■■■ 56
SRSF9Q13242 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.419e-18■■■■■ 56
SRSF9Q13242 SPATA20-205ENST00000503127 2734 ntTSL 1 (best)12□□□□□ -0.499e-18■■■■■ 56
SRSF9Q13242 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.59e-18■■■■■ 56
SRSF9Q13242 SPATA20-207ENST00000504271 806 ntTSL 211.43□□□□□ -0.589e-18■■■■■ 56
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SRSF9Q13242 SPATA20-223ENST00000513618 629 ntTSL 210.96□□□□□ -0.659e-18■■■■■ 56
SRSF9Q13242 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.759e-18■■■■■ 56
SRSF9Q13242 SPATA20-225ENST00000515619 818 ntTSL 59.97□□□□□ -0.819e-18■■■■■ 56
SRSF9Q13242 SPATA20-217ENST00000511347 1035 ntTSL 59.89□□□□□ -0.839e-18■■■■■ 56
SRSF9Q13242 SPATA20-204ENST00000503063 3232 ntTSL 29.82□□□□□ -0.849e-18■■■■■ 56
SRSF9Q13242 SPATA20-220ENST00000511937 2669 ntTSL 1 (best)9.72□□□□□ -0.859e-18■■■■■ 56
SRSF9Q13242 SPATA20-208ENST00000504334 3539 ntTSL 29.7□□□□□ -0.869e-18■■■■■ 56
SRSF9Q13242 SPATA20-214ENST00000508528 512 ntTSL 57.71□□□□□ -1.189e-18■■■■■ 56
SRSF9Q13242 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.289e-7■■■■■ 47.9
SRSF9Q13242 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.559e-7■■■■■ 47.9
SRSF9Q13242 FAM118A-201ENST00000216214 3458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.779e-7■■■■■ 47.9
SRSF9Q13242 ANP32B-201ENST00000339399 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.158e-8■■■■■ 47.2
SRSF9Q13242 TACC1-212ENST00000521050 491 ntTSL 1 (best)10.46□□□□□ -0.732e-14■■■■■ 45.5
SRSF9Q13242 TACC1-216ENST00000521642 493 ntTSL 1 (best)9.96□□□□□ -0.822e-14■■■■■ 45.5
SRSF9Q13242 TACC1-208ENST00000520340 1976 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.992e-14■■■■■ 45.5
SRSF9Q13242 TACC1-223ENST00000522904 1724 ntTSL 58.59□□□□□ -1.032e-14■■■■■ 45.5
SRSF9Q13242 TACC1-222ENST00000522752 944 ntTSL 1 (best)8.58□□□□□ -1.042e-14■■■■■ 45.5
SRSF9Q13242 TACC1-204ENST00000518415 3011 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.192e-14■■■■■ 45.5
SRSF9Q13242 TACC1-210ENST00000520615 5509 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.372e-14■■■■■ 45.5
SRSF9Q13242 TACC1-207ENST00000519416 5510 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.382e-14■■■■■ 45.5
SRSF9Q13242 TACC1-229ENST00000524354 476 ntTSL 56.31□□□□□ -1.42e-14■■■■■ 45.5
SRSF9Q13242 TACC1-226ENST00000523239 519 ntTSL 55.41□□□□□ -1.542e-14■■■■■ 45.5
SRSF9Q13242 TACC1-220ENST00000522544 372 ntTSL 54.13□□□□□ -1.752e-14■■■■■ 45.5
SRSF9Q13242 EXOC3L4-207ENST00000560925 2341 ntTSL 217.46■□□□□ 0.397e-14■■■■■ 44.2
SRSF9Q13242 EXOC3L4-205ENST00000560102 563 ntTSL 313.3□□□□□ -0.287e-14■■■■■ 44.2
SRSF9Q13242 EXOC3L4-203ENST00000559661 665 ntTSL 511.06□□□□□ -0.647e-14■■■■■ 44.2
SRSF9Q13242 METTL17-219ENST00000555902 868 ntTSL 35.75□□□□□ -1.497e-14■■■■■ 44.2
SRSF9Q13242 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.162e-12■■■■■ 42.9
SRSF9Q13242 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.392e-12■■■■■ 42.9
SRSF9Q13242 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.52e-12■■■■■ 42.9
SRSF9Q13242 MIR941-1-201ENST00000636396 72 ntBASIC7.48□□□□□ -1.211e-12■■■■■ 42.5
SRSF9Q13242 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.742e-12■■■■■ 41.8
SRSF9Q13242 ANP32E-210ENST00000629042 3054 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.872e-12■■■■■ 41.8
SRSF9Q13242 ANP32E-208ENST00000583931 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.162e-12■■■■■ 41.8
SRSF9Q13242 ANP32E-203ENST00000436748 1339 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.52e-12■■■■■ 41.8
SRSF9Q13242 ANP32E-205ENST00000533654 908 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.532e-12■■■■■ 41.8
SRSF9Q13242 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -22e-12■■■■■ 41.8
SRSF9Q13242 ANP32E-207ENST00000534437 616 ntTSL 32.17□□□□□ -2.062e-12■■■■■ 41.8
SRSF9Q13242 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.112e-12■■■■■ 41.8
SRSF9Q13242 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.612e-8■■■■■ 41.5
SRSF9Q13242 CCDC183-204ENST00000479371 1786 ntTSL 1 (best)11.08□□□□□ -0.642e-8■■■■■ 41.5
SRSF9Q13242 CCDC183-203ENST00000430612 2321 ntTSL 210.97□□□□□ -0.652e-8■■■■■ 41.5
SRSF9Q13242 CCDC183-205ENST00000481601 1556 ntTSL 29.97□□□□□ -0.812e-8■■■■■ 41.5
SRSF9Q13242 CCDC183-202ENST00000371682 1437 ntTSL 59.79□□□□□ -0.842e-8■■■■■ 41.5
SRSF9Q13242 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.834e-8■■■■■ 41.2
SRSF9Q13242 FAM118A-211ENST00000477714 756 ntTSL 28.35□□□□□ -1.071e-6■■■■■ 41.1
SRSF9Q13242 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.572e-11■■■■■ 40.2
SRSF9Q13242 VWCE-201ENST00000301770 3368 ntTSL 1 (best)10.97□□□□□ -0.652e-11■■■■■ 40.2
SRSF9Q13242 VWCE-206ENST00000538438 1076 ntTSL 39.86□□□□□ -0.832e-11■■■■■ 40.2
SRSF9Q13242 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.92e-11■■■■■ 40.2
SRSF9Q13242 VWCE-208ENST00000613271 3032 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.922e-11■■■■■ 40.2
SRSF9Q13242 C1GALT1-203ENST00000419721 591 ntTSL 312.84□□□□□ -0.357e-12■■■■■ 38.4
SRSF9Q13242 C1GALT1-206ENST00000467716 458 ntTSL 510.74□□□□□ -0.697e-12■■■■■ 38.4
SRSF9Q13242 C1GALT1-205ENST00000436587 6235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.777e-12■■■■■ 38.4
SRSF9Q13242 C1GALT1-204ENST00000429911 802 ntTSL 58.36□□□□□ -1.077e-12■■■■■ 38.4
SRSF9Q13242 C1GALT1-207ENST00000476068 1186 ntTSL 1 (best)7.89□□□□□ -1.157e-12■■■■■ 38.4
SRSF9Q13242 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.661e-10■■■■■ 35.9
SRSF9Q13242 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.661e-10■■■■■ 35.9
SRSF9Q13242 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.031e-10■■■■■ 35.9
SRSF9Q13242 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.11e-10■■■■■ 35.9
SRSF9Q13242 RELN-201ENST00000343529 11565 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.931e-10■■■■■ 35.9
SRSF9Q13242 RELN-202ENST00000424685 11571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.931e-10■■■■■ 35.9
SRSF9Q13242 RELN-203ENST00000428762 11571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.931e-10■■■■■ 35.9
SRSF9Q13242 RBM25-205ENST00000527432 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.261e-10■■■■■ 35.9
SRSF9Q13242 RBM25-201ENST00000261973 6910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.311e-10■■■■■ 35.9
SRSF9Q13242 RBM25-212ENST00000532683 6848 ntTSL 1 (best)5□□□□□ -1.611e-10■■■■■ 35.9
SRSF9Q13242 RBM25-207ENST00000528081 3008 ntTSL 24.36□□□□□ -1.711e-10■■■■■ 35.9
SRSF9Q13242 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.881e-323■■■■■ 34.7
SRSF9Q13242 MALAT1-217ENST00000620902 352 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.581e-323■■■■■ 34.7
SRSF9Q13242 ARIH1-206ENST00000564062 612 ntTSL 319.51■□□□□ 0.714e-10■■■■■ 34.2
SRSF9Q13242 ARIH1-210ENST00000570085 807 ntTSL 318.23■□□□□ 0.514e-10■■■■■ 34.2
SRSF9Q13242 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.544e-10■■■■■ 34.2
SRSF9Q13242 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.143e-8■■■■■ 33.2
SRSF9Q13242 PELP1-214ENST00000575329 3280 ntTSL 212□□□□□ -0.493e-8■■■■■ 33.2
SRSF9Q13242 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.623e-8■■■■■ 33.2
SRSF9Q13242 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.653e-8■■■■■ 33.2
SRSF9Q13242 PELP1-211ENST00000573523 3878 ntTSL 210.78□□□□□ -0.683e-8■■■■■ 33.2
SRSF9Q13242 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.73e-8■■■■■ 33.2
SRSF9Q13242 HDLBP-218ENST00000441124 708 ntTSL 211.47□□□□□ -0.573e-10■■■■■ 32.5
SRSF9Q13242 HDLBP-214ENST00000427183 6238 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.63e-10■■■■■ 32.5
SRSF9Q13242 HDLBP-244ENST00000490697 581 ntTSL 411.02□□□□□ -0.653e-10■■■■■ 32.5
SRSF9Q13242 HDLBP-212ENST00000426343 594 ntTSL 411.02□□□□□ -0.653e-10■■■■■ 32.5
SRSF9Q13242 HDLBP-208ENST00000422080 578 ntTSL 311.02□□□□□ -0.653e-10■■■■■ 32.5
SRSF9Q13242 HDLBP-204ENST00000391976 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.683e-10■■■■■ 32.5
SRSF9Q13242 HDLBP-203ENST00000391975 6372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.753e-10■■■■■ 32.5
SRSF9Q13242 HDLBP-223ENST00000449864 529 ntTSL 59.73□□□□□ -0.853e-10■■■■■ 32.5
SRSF9Q13242 HDLBP-201ENST00000310931 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.073e-10■■■■■ 32.5
SRSF9Q13242 HDLBP-210ENST00000423693 544 ntTSL 57.97□□□□□ -1.133e-10■■■■■ 32.5
SRSF9Q13242 HDLBP-246ENST00000496569 374 ntTSL 47.5□□□□□ -1.213e-10■■■■■ 32.5
SRSF9Q13242 HDLBP-224ENST00000452065 996 ntTSL 56.85□□□□□ -1.313e-10■■■■■ 32.5
SRSF9Q13242 HDLBP-207ENST00000420451 559 ntTSL 46.62□□□□□ -1.353e-10■■■■■ 32.5
SRSF9Q13242 HDLBP-227ENST00000458564 420 ntTSL 36.48□□□□□ -1.373e-10■■■■■ 32.5
SRSF9Q13242 HDLBP-211ENST00000425989 530 ntTSL 56.47□□□□□ -1.373e-10■■■■■ 32.5
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