RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000594693.5

ZNF548-204, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

TSL 4

Gene ZNF548, Length 552 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-204ENST00000594693 NISCHQ9Y2I1 1504 aa42.17■■■■■ 4.34
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ZNF548-204ENST00000594693 DCAF8L2P0C7V8 631 aa35.16■■■■□ 3.22
ZNF548-204ENST00000594693 NACADO15069 1562 aa34.99■■■■□ 3.19
ZNF548-204ENST00000594693 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.94■■■■□ 3.18
ZNF548-204ENST00000594693 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.91■■■■□ 3.18
ZNF548-204ENST00000594693 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.9■■■■□ 3.18
ZNF548-204ENST00000594693 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.03■■■■□ 3.04
ZNF548-204ENST00000594693 SCRIBQ14160 1630 aa34■■■■□ 3.03
ZNF548-204ENST00000594693 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP33.94■■■■□ 3.02
ZNF548-204ENST00000594693 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.85■■■■□ 3.01
ZNF548-204ENST00000594693 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.55■■■□□ 2.96
ZNF548-204ENST00000594693 DNAJC5BQ9UF47 199 aa32.99■■■□□ 2.87
ZNF548-204ENST00000594693 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.92■■■□□ 2.86
ZNF548-204ENST00000594693 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.84■■■□□ 2.85
ZNF548-204ENST00000594693 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.69■■■□□ 2.82
ZNF548-204ENST00000594693 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.62■■■□□ 2.81
ZNF548-204ENST00000594693 SMARCA4P51532 1647 aa32.58■■■□□ 2.81
ZNF548-204ENST00000594693 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.5■■■□□ 2.79
ZNF548-204ENST00000594693 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.4■■■□□ 2.78
ZNF548-204ENST00000594693 NCAPD3P42695 1498 aa32.35■■■□□ 2.77
ZNF548-204ENST00000594693 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.32■■■□□ 2.76
ZNF548-204ENST00000594693 SMARCA2P51531 1590 aa32.32■■■□□ 2.76
ZNF548-204ENST00000594693 PEG3Q9GZU2 1588 aa32.29■■■□□ 2.76
ZNF548-204ENST00000594693 HMGXB3Q12766 1538 aa32.12■■■□□ 2.73
ZNF548-204ENST00000594693 WIZO95785 1651 aa32.11■■■□□ 2.73
ZNF548-204ENST00000594693 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP32.1■■■□□ 2.73
ZNF548-204ENST00000594693 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.8■■■□□ 2.68
ZNF548-204ENST00000594693 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.79■■■□□ 2.68
ZNF548-204ENST00000594693 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.52■■■□□ 2.64
ZNF548-204ENST00000594693 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.43■■■□□ 2.62
ZNF548-204ENST00000594693 NESP48681 1621 aa31.4■■■□□ 2.62
ZNF548-204ENST00000594693 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.34■■■□□ 2.61
ZNF548-204ENST00000594693 CFTRP13569 1480 aa31.3■■■□□ 2.6
ZNF548-204ENST00000594693 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.19■■■□□ 2.58
ZNF548-204ENST00000594693 ERCC6Q03468 1493 aa31.11■■■□□ 2.57
ZNF548-204ENST00000594693 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.01■■■□□ 2.56
ZNF548-204ENST00000594693 PRDM2Q13029 1718 aa31.01■■■□□ 2.55
ZNF548-204ENST00000594693 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.92■■■□□ 2.54
ZNF548-204ENST00000594693 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.9■■■□□ 2.54
ZNF548-204ENST00000594693 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.8■■■□□ 2.52
ZNF548-204ENST00000594693 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.76■■■□□ 2.52
ZNF548-204ENST00000594693 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.68■■■□□ 2.5
ZNF548-204ENST00000594693 CUX2O14529 1486 aa30.67■■■□□ 2.5
ZNF548-204ENST00000594693 WDR62O43379 1518 aa30.67■■■□□ 2.5
ZNF548-204ENST00000594693 ABCC8Q09428 1581 aa30.59■■■□□ 2.49
ZNF548-204ENST00000594693 TOPBP1Q92547 1522 aa30.55■■■□□ 2.48
ZNF548-204ENST00000594693 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.51■■■□□ 2.47
ZNF548-204ENST00000594693 CUX1P39880 1505 aa30.46■■■□□ 2.47
ZNF548-204ENST00000594693 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.42■■■□□ 2.46
ZNF548-204ENST00000594693 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.32■■■□□ 2.44
ZNF548-204ENST00000594693 FGD5Q6ZNL6 1462 aa30.29■■■□□ 2.44
ZNF548-204ENST00000594693 IFT140Q96RY7 1462 aa30.28■■■□□ 2.44
ZNF548-204ENST00000594693 SYNJ1O43426 1573 aa30.27■■■□□ 2.44
ZNF548-204ENST00000594693 TOP2BQ02880 1626 aa30.26■■■□□ 2.44
ZNF548-204ENST00000594693 SOGA1O94964 1423 aa30.26■■■□□ 2.43
ZNF548-204ENST00000594693 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.22■■■□□ 2.43
ZNF548-204ENST00000594693 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.21■■■□□ 2.43
ZNF548-204ENST00000594693 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30.16■■■□□ 2.42
ZNF548-204ENST00000594693 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.12■■■□□ 2.41
ZNF548-204ENST00000594693 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
ZNF548-204ENST00000594693 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.04■■■□□ 2.4
ZNF548-204ENST00000594693 TRIM41Q8WV44 630 aa30.03■■■□□ 2.4
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ZNF548-204ENST00000594693 WDR97A6NE52 1622 aa29.96■■■□□ 2.39
ZNF548-204ENST00000594693 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.93■■■□□ 2.38
ZNF548-204ENST00000594693 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
ZNF548-204ENST00000594693 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.87■■■□□ 2.37
ZNF548-204ENST00000594693 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.82■■■□□ 2.36
ZNF548-204ENST00000594693 GRIN2BQ13224 1484 aa29.81■■■□□ 2.36
ZNF548-204ENST00000594693 KIF27Q86VH2 1401 aa29.77■■■□□ 2.36
ZNF548-204ENST00000594693 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.69■■■□□ 2.34
ZNF548-204ENST00000594693 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.68■■■□□ 2.34
ZNF548-204ENST00000594693 IGF1RP08069 1367 aa29.68■■■□□ 2.34
ZNF548-204ENST00000594693 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.66■■■□□ 2.34
ZNF548-204ENST00000594693 PBRM1Q86U86 1689 aa29.66■■■□□ 2.34
ZNF548-204ENST00000594693 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.62■■■□□ 2.33
ZNF548-204ENST00000594693 FBLN2P98095 1184 aa29.6■■■□□ 2.33
ZNF548-204ENST00000594693 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.6■■■□□ 2.33
ZNF548-204ENST00000594693 OSCARQ8IYS5 282 aa29.58■■■□□ 2.33
ZNF548-204ENST00000594693 SYNJ2O15056 1496 aa29.57■■■□□ 2.32
ZNF548-204ENST00000594693 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.56■■■□□ 2.32
ZNF548-204ENST00000594693 ADAMTS12P58397 1594 aa29.49■■■□□ 2.31
ZNF548-204ENST00000594693 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa29.48■■■□□ 2.31
ZNF548-204ENST00000594693 EEA1Q15075 1411 aa29.44■■■□□ 2.3
ZNF548-204ENST00000594693 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29.43■■■□□ 2.3
ZNF548-204ENST00000594693 CHD1O14646 1710 aa29.42■■■□□ 2.3
ZNF548-204ENST00000594693 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.42■■■□□ 2.3
ZNF548-204ENST00000594693 GRIN2AQ12879 1464 aa29.42■■■□□ 2.3
ZNF548-204ENST00000594693 CUL7Q14999 1698 aa29.39■■■□□ 2.3
ZNF548-204ENST00000594693 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
ZNF548-204ENST00000594693 PRXQ9BXM0 1461 aa29.31■■■□□ 2.28
ZNF548-204ENST00000594693 NUP160Q12769 1436 aa29.3■■■□□ 2.28
ZNF548-204ENST00000594693 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.29■■■□□ 2.28
ZNF548-204ENST00000594693 CEP170Q5SW79 1584 aa29.22■■■□□ 2.27
ZNF548-204ENST00000594693 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.21■■■□□ 2.27
ZNF548-204ENST00000594693 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa29.13■■■□□ 2.25
ZNF548-204ENST00000594693 JPH4Q96JJ6 628 aa29.09■■■□□ 2.25
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