RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563261.5

SNAI3-AS1-201, SNAI3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SNAI3-AS1, Length 998 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.84■■■■■ 6.21
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SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ABCC9O60706 1549 aa46.69■■■■■ 5.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.02■■■■■ 4.8
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NACADO15069 1562 aa44.99■■■■■ 4.79
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.9■■■■■ 4.78
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.8■■■■■ 4.76
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.78■■■■■ 4.76
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.6■■■■■ 4.73
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.98■■■■■ 4.63
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SCRIBQ14160 1630 aa43.65■■■■■ 4.58
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.63■■■■■ 4.57
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.57■■■■■ 4.575e-8■■□□□ 11.5
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.27■■■■■ 4.52
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.69■■■■■ 4.42
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.48■■■■■ 4.39
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.28■■■■■ 4.36
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.97■■■■■ 4.31
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SMARCA4P51532 1647 aa41.79■■■■■ 4.28
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.76■■■■■ 4.27
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SMARCA2P51531 1590 aa41.51■■■■■ 4.24
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.5■■■■■ 4.23
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NCAPD3P42695 1498 aa41.48■■■■■ 4.23
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.47■■■■■ 4.23
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.4■■■■■ 4.22
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HMGXB3Q12766 1538 aa41.34■■■■■ 4.21
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.18■■■■■ 4.18
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 WIZO95785 1651 aa41.03■■■■■ 4.16
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.01■■■■■ 4.16
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.65■■■■■ 4.1
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NESP48681 1621 aa40.42■■■■■ 4.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.41■■■■■ 4.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ERCC6Q03468 1493 aa40.27■■■■■ 4.04
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.25■■■■■ 4.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.11■■■■■ 4.01
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.1■■■■■ 4.01
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CFTRP13569 1480 aa40.06■■■■■ 4
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.99■■■■□ 3.99
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.95■■■■□ 3.99
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.87■■■■□ 3.97
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CUX2O14529 1486 aa39.86■■■■□ 3.97
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PRDM2Q13029 1718 aa39.83■■■■□ 3.97
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.81■■■■□ 3.96
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.78■■■■□ 3.96
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.7■■■■□ 3.95
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 WDR62O43379 1518 aa39.59■■■■□ 3.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.4■■■■□ 3.9
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ABCC8Q09428 1581 aa39.22■■■■□ 3.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TOPBP1Q92547 1522 aa39.19■■■■□ 3.86
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.18■■■■□ 3.86
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 IFT140Q96RY7 1462 aa38.94■■■■□ 3.82
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CUX1P39880 1505 aa38.91■■■■□ 3.82
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.86■■■■□ 3.81
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.78■■■■□ 3.8
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.77■■■■□ 3.8
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.7■■■■□ 3.79
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.7■■■■□ 3.796e-7■■■■■ 33.4
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SOGA1O94964 1423 aa38.67■■■■□ 3.78
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.65■■■■□ 3.78
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.64■■■■□ 3.78
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TOP2BQ02880 1626 aa38.63■■■■□ 3.78
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SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SYNJ1O43426 1573 aa38.6■■■■□ 3.77
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 WDR97A6NE52 1622 aa38.54■■■■□ 3.76
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SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.44■■■■□ 3.74
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.43■■■■□ 3.74
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.42■■■■□ 3.74
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.29■■■■□ 3.72
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GRIN2BQ13224 1484 aa38.26■■■■□ 3.72
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.25■■■■□ 3.71
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PBRM1Q86U86 1689 aa38.2■■■■□ 3.71
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.18■■■■□ 3.7
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.17■■■■□ 3.7
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 OSCARQ8IYS5 282 aa38.13■■■■□ 3.69
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CHD1O14646 1710 aa38.11■■■■□ 3.69
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SYNJ2O15056 1496 aa38■■■■□ 3.67
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.98■■■■□ 3.67
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FBLN2P98095 1184 aa37.97■■■■□ 3.67
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ADAMTS12P58397 1594 aa37.92■■■■□ 3.66
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.91■■■■□ 3.66
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KIF27Q86VH2 1401 aa37.89■■■■□ 3.66
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.83■■■■□ 3.65
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TRIM41Q8WV44 630 aa37.76■■■■□ 3.64
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GRIN2AQ12879 1464 aa37.76■■■■□ 3.63
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.71■■■■□ 3.63
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CUL7Q14999 1698 aa37.67■■■■□ 3.62
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 IGF1RP08069 1367 aa37.67■■■■□ 3.62
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NUP160Q12769 1436 aa37.6■■■■□ 3.61
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ARHGEF11O15085 1522 aa37.57■■■■□ 3.61
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CEP170Q5SW79 1584 aa37.57■■■■□ 3.6
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.57■■■■□ 3.6
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.57■■■■□ 3.6
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.57■■■■□ 3.6
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.5■■■■□ 3.59
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa37.47■■■■□ 3.59
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.34■■■■□ 3.57
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SHROOM2Q13796 1616 aa37.32■■■■□ 3.57
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa37.28■■■■□ 3.56
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ARAP1Q96P48 1450 aa37.27■■■■□ 3.56
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