RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491240.5

RBM3-211, Transcript of RNA binding motif protein 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RBM3, Length 951 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM3-211ENST00000491240 NISCHQ9Y2I1 1504 aa40.52■■■■■ 4.08
RBM3-211ENST00000491240 ABCC9O60706 1549 aa36.29■■■■□ 3.4
RBM3-211ENST00000491240 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa36.2■■■■□ 3.39
RBM3-211ENST00000491240 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.45■■■■□ 3.1
RBM3-211ENST00000491240 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.39■■■■□ 3.1
RBM3-211ENST00000491240 NACADO15069 1562 aa34.22■■■■□ 3.07
RBM3-211ENST00000491240 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.93■■■■□ 3.02
RBM3-211ENST00000491240 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP33.87■■■■□ 3.01
RBM3-211ENST00000491240 UNC13AQ9UPW8 1703 aa33.72■■■□□ 2.99
RBM3-211ENST00000491240 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.69■■■□□ 2.98
RBM3-211ENST00000491240 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.6■■■□□ 2.97
RBM3-211ENST00000491240 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.47■■■□□ 2.95
RBM3-211ENST00000491240 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.35■■■□□ 2.93
RBM3-211ENST00000491240 SCRIBQ14160 1630 aa33.19■■■□□ 2.9
RBM3-211ENST00000491240 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.86■■■□□ 2.85
RBM3-211ENST00000491240 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.7■■■□□ 2.83
RBM3-211ENST00000491240 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.65■■■□□ 2.82
RBM3-211ENST00000491240 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.61■■■□□ 2.81
RBM3-211ENST00000491240 NCAPD3P42695 1498 aa31.6■■■□□ 2.65
RBM3-211ENST00000491240 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.59■■■□□ 2.65
RBM3-211ENST00000491240 SMARCA4P51532 1647 aa31.58■■■□□ 2.65
RBM3-211ENST00000491240 SMARCA2P51531 1590 aa31.46■■■□□ 2.63
RBM3-211ENST00000491240 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.42■■■□□ 2.62
RBM3-211ENST00000491240 HMGXB3Q12766 1538 aa31.36■■■□□ 2.61
RBM3-211ENST00000491240 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.31■■■□□ 2.6
RBM3-211ENST00000491240 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.29■■■□□ 2.6
RBM3-211ENST00000491240 ERCC6Q03468 1493 aa31.27■■■□□ 2.6
RBM3-211ENST00000491240 NESP48681 1621 aa31.21■■■□□ 2.59
RBM3-211ENST00000491240 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.17■■■□□ 2.58
RBM3-211ENST00000491240 CUX2O14529 1486 aa31.04■■■□□ 2.56
RBM3-211ENST00000491240 WIZO95785 1651 aa30.94■■■□□ 2.54
RBM3-211ENST00000491240 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa30.94■■■□□ 2.54
RBM3-211ENST00000491240 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.86■■■□□ 2.53
RBM3-211ENST00000491240 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.76■■■□□ 2.51
RBM3-211ENST00000491240 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.75■■■□□ 2.51
RBM3-211ENST00000491240 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.72■■■□□ 2.51
RBM3-211ENST00000491240 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.7■■■□□ 2.51
RBM3-211ENST00000491240 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.68■■■□□ 2.5
RBM3-211ENST00000491240 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.48■■■□□ 2.47
RBM3-211ENST00000491240 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.46■■■□□ 2.47
RBM3-211ENST00000491240 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.38■■■□□ 2.45
RBM3-211ENST00000491240 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.38■■■□□ 2.45
RBM3-211ENST00000491240 CFTRP13569 1480 aa30.36■■■□□ 2.45
RBM3-211ENST00000491240 WDR62O43379 1518 aa30.35■■■□□ 2.45
RBM3-211ENST00000491240 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.19■■■□□ 2.42
RBM3-211ENST00000491240 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.13■■■□□ 2.41
RBM3-211ENST00000491240 PRDM2Q13029 1718 aa30.02■■■□□ 2.4
RBM3-211ENST00000491240 TRIM41Q8WV44 630 aa29.83■■■□□ 2.37
RBM3-211ENST00000491240 TOPBP1Q92547 1522 aa29.81■■■□□ 2.36
RBM3-211ENST00000491240 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.78■■■□□ 2.36
RBM3-211ENST00000491240 OSCARQ8IYS5 282 aa29.75■■■□□ 2.35
RBM3-211ENST00000491240 IFT140Q96RY7 1462 aa29.74■■■□□ 2.35
RBM3-211ENST00000491240 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.69■■■□□ 2.34
RBM3-211ENST00000491240 ABCC8Q09428 1581 aa29.66■■■□□ 2.34
RBM3-211ENST00000491240 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.63■■■□□ 2.33
RBM3-211ENST00000491240 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.56■■■□□ 2.32
RBM3-211ENST00000491240 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.54■■■□□ 2.322e-11■■■■■ 31.4
RBM3-211ENST00000491240 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
RBM3-211ENST00000491240 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.5■■■□□ 2.31
RBM3-211ENST00000491240 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.49■■■□□ 2.31
RBM3-211ENST00000491240 SOGA1O94964 1423 aa29.41■■■□□ 2.3
RBM3-211ENST00000491240 FBLN2P98095 1184 aa29.4■■■□□ 2.3
RBM3-211ENST00000491240 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
RBM3-211ENST00000491240 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.39■■■□□ 2.3
RBM3-211ENST00000491240 CUX1P39880 1505 aa29.38■■■□□ 2.29
RBM3-211ENST00000491240 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.34■■■□□ 2.29
RBM3-211ENST00000491240 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.34■■■□□ 2.29
RBM3-211ENST00000491240 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.34■■■□□ 2.29
RBM3-211ENST00000491240 CHD1O14646 1710 aa29.34■■■□□ 2.29
RBM3-211ENST00000491240 ARHGEF11O15085 1522 aa29.25■■■□□ 2.27
RBM3-211ENST00000491240 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.21■■■□□ 2.27
RBM3-211ENST00000491240 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.14■■■□□ 2.26
RBM3-211ENST00000491240 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.12■■■□□ 2.25
RBM3-211ENST00000491240 GRIN2BQ13224 1484 aa29.1■■■□□ 2.25
RBM3-211ENST00000491240 WDR97A6NE52 1622 aa29.09■■■□□ 2.25
RBM3-211ENST00000491240 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.04■■■□□ 2.24
RBM3-211ENST00000491240 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
RBM3-211ENST00000491240 PBRM1Q86U86 1689 aa29.01■■■□□ 2.23
RBM3-211ENST00000491240 ARAP1Q96P48 1450 aa29■■■□□ 2.23
RBM3-211ENST00000491240 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.99■■■□□ 2.23
RBM3-211ENST00000491240 SYNJ2O15056 1496 aa28.97■■■□□ 2.23
RBM3-211ENST00000491240 SYNJ1O43426 1573 aa28.95■■■□□ 2.22
RBM3-211ENST00000491240 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.94■■■□□ 2.22
RBM3-211ENST00000491240 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.94■■■□□ 2.22
RBM3-211ENST00000491240 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.94■■■□□ 2.22
RBM3-211ENST00000491240 TOP2BQ02880 1626 aa28.89■■■□□ 2.22
RBM3-211ENST00000491240 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.87■■■□□ 2.21
RBM3-211ENST00000491240 TRHP20396 242 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
RBM3-211ENST00000491240 GRIN2AQ12879 1464 aa28.73■■■□□ 2.19
RBM3-211ENST00000491240 ADAMTS12P58397 1594 aa28.73■■■□□ 2.19
RBM3-211ENST00000491240 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.65■■■□□ 2.18
RBM3-211ENST00000491240 CEP170Q5SW79 1584 aa28.65■■■□□ 2.18
RBM3-211ENST00000491240 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.62■■■□□ 2.17
RBM3-211ENST00000491240 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.61■■■□□ 2.17
RBM3-211ENST00000491240 NUP160Q12769 1436 aa28.6■■■□□ 2.17
RBM3-211ENST00000491240 SHROOM2Q13796 1616 aa28.43■■■□□ 2.14
RBM3-211ENST00000491240 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.14
RBM3-211ENST00000491240 JPH4Q96JJ6 628 aa28.39■■■□□ 2.14
RBM3-211ENST00000491240 KIF27Q86VH2 1401 aa28.36■■■□□ 2.13
RBM3-211ENST00000491240 IGF1RP08069 1367 aa28.36■■■□□ 2.13
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