RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491236.1

RBM3-210, Transcript of RNA binding motif protein 3, humanhuman

TSL 2

Gene RBM3, Length 729 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM3-210ENST00000491236 NISCHQ9Y2I1 1504 aa45.87■■■■■ 4.93
RBM3-210ENST00000491236 ABCC9O60706 1549 aa40.87■■■■■ 4.13
RBM3-210ENST00000491236 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa40.82■■■■■ 4.13
RBM3-210ENST00000491236 DCAF8L2P0C7V8 631 aa38.99■■■■□ 3.83
RBM3-210ENST00000491236 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa38.91■■■■□ 3.82
RBM3-210ENST00000491236 NACADO15069 1562 aa38.71■■■■□ 3.79
RBM3-210ENST00000491236 MYO15BQ96JP2 1530 aa38.24■■■■□ 3.71
RBM3-210ENST00000491236 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP38.24■■■■□ 3.71
RBM3-210ENST00000491236 DNAJC5BQ9UF47 199 aa38.14■■■■□ 3.7
RBM3-210ENST00000491236 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP38.03■■■■□ 3.68
RBM3-210ENST00000491236 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa37.85■■■■□ 3.65
RBM3-210ENST00000491236 UNC13AQ9UPW8 1703 aa37.67■■■■□ 3.62
RBM3-210ENST00000491236 BICRAQ9NZM4 1560 aa37.65■■■■□ 3.62
RBM3-210ENST00000491236 SCRIBQ14160 1630 aa37.37■■■■□ 3.57
RBM3-210ENST00000491236 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa37.27■■■■□ 3.56
RBM3-210ENST00000491236 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP36.79■■■■□ 3.48
RBM3-210ENST00000491236 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.79■■■■□ 3.48
RBM3-210ENST00000491236 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.78■■■■□ 3.48
RBM3-210ENST00000491236 NCAPD3P42695 1498 aa35.81■■■■□ 3.32
RBM3-210ENST00000491236 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.73■■■■□ 3.31
RBM3-210ENST00000491236 SMARCA4P51532 1647 aa35.63■■■■□ 3.29
RBM3-210ENST00000491236 SMARCA2P51531 1590 aa35.6■■■■□ 3.29
RBM3-210ENST00000491236 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP35.59■■■■□ 3.29
RBM3-210ENST00000491236 HMGXB3Q12766 1538 aa35.45■■■■□ 3.27
RBM3-210ENST00000491236 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.42■■■■□ 3.26
RBM3-210ENST00000491236 MROH2BQ7Z745 1585 aa35.34■■■■□ 3.25
RBM3-210ENST00000491236 ERCC6Q03468 1493 aa35.33■■■■□ 3.25
RBM3-210ENST00000491236 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.25■■■■□ 3.23
RBM3-210ENST00000491236 NESP48681 1621 aa35.12■■■■□ 3.21
RBM3-210ENST00000491236 CUX2O14529 1486 aa35.06■■■■□ 3.2
RBM3-210ENST00000491236 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa34.89■■■■□ 3.18
RBM3-210ENST00000491236 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.86■■■■□ 3.17
RBM3-210ENST00000491236 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.84■■■■□ 3.17
RBM3-210ENST00000491236 WIZO95785 1651 aa34.83■■■■□ 3.17
RBM3-210ENST00000491236 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.82■■■■□ 3.16
RBM3-210ENST00000491236 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP34.8■■■■□ 3.16
RBM3-210ENST00000491236 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.54■■■■□ 3.12
RBM3-210ENST00000491236 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP34.48■■■■□ 3.11
RBM3-210ENST00000491236 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.45■■■■□ 3.11
RBM3-210ENST00000491236 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.43■■■■□ 3.1
RBM3-210ENST00000491236 CFTRP13569 1480 aa34.39■■■■□ 3.1
RBM3-210ENST00000491236 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.36■■■■□ 3.09
RBM3-210ENST00000491236 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.35■■■■□ 3.09
RBM3-210ENST00000491236 WDR62O43379 1518 aa34.23■■■■□ 3.07
RBM3-210ENST00000491236 CCDC88BA6NC98 1476 aa34.18■■■■□ 3.06
RBM3-210ENST00000491236 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP33.99■■■■□ 3.03
RBM3-210ENST00000491236 OSCARQ8IYS5 282 aa33.73■■■□□ 2.99
RBM3-210ENST00000491236 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP33.7■■■□□ 2.99
RBM3-210ENST00000491236 ABCC8Q09428 1581 aa33.69■■■□□ 2.98
RBM3-210ENST00000491236 TOPBP1Q92547 1522 aa33.69■■■□□ 2.98
RBM3-210ENST00000491236 IFT140Q96RY7 1462 aa33.68■■■□□ 2.98
RBM3-210ENST00000491236 PRDM2Q13029 1718 aa33.67■■■□□ 2.98
RBM3-210ENST00000491236 TRIM41Q8WV44 630 aa33.57■■■□□ 2.96
RBM3-210ENST00000491236 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.56■■■□□ 2.96
RBM3-210ENST00000491236 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.54■■■□□ 2.96
RBM3-210ENST00000491236 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP33.37■■■□□ 2.933e-11■■■■■ 34
RBM3-210ENST00000491236 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.37■■■□□ 2.93
RBM3-210ENST00000491236 SOGA1O94964 1423 aa33.35■■■□□ 2.93
RBM3-210ENST00000491236 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.3■■■□□ 2.92
RBM3-210ENST00000491236 FBLN2P98095 1184 aa33.29■■■□□ 2.92
RBM3-210ENST00000491236 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.26■■■□□ 2.92
RBM3-210ENST00000491236 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP33.26■■■□□ 2.91
RBM3-210ENST00000491236 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP33.24■■■□□ 2.91
RBM3-210ENST00000491236 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.22■■■□□ 2.91
RBM3-210ENST00000491236 CUX1P39880 1505 aa33.18■■■□□ 2.9
RBM3-210ENST00000491236 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP33.06■■■□□ 2.88
RBM3-210ENST00000491236 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa32.98■■■□□ 2.87
RBM3-210ENST00000491236 GRIN2BQ13224 1484 aa32.97■■■□□ 2.87
RBM3-210ENST00000491236 ARHGEF11O15085 1522 aa32.95■■■□□ 2.87
RBM3-210ENST00000491236 WDR97A6NE52 1622 aa32.94■■■□□ 2.86
RBM3-210ENST00000491236 CYB5RLQ6IPT4 315 aa32.93■■■□□ 2.86
RBM3-210ENST00000491236 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa32.92■■■□□ 2.86
RBM3-210ENST00000491236 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa32.92■■■□□ 2.86
RBM3-210ENST00000491236 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa32.92■■■□□ 2.86
RBM3-210ENST00000491236 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP32.89■■■□□ 2.86
RBM3-210ENST00000491236 GAPVD1Q14C86 1478 aa32.88■■■□□ 2.85
RBM3-210ENST00000491236 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP32.87■■■□□ 2.85
RBM3-210ENST00000491236 CHD1O14646 1710 aa32.85■■■□□ 2.85
RBM3-210ENST00000491236 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa32.83■■■□□ 2.85
RBM3-210ENST00000491236 SYNJ2O15056 1496 aa32.8■■■□□ 2.84
RBM3-210ENST00000491236 SYNJ1O43426 1573 aa32.7■■■□□ 2.82
RBM3-210ENST00000491236 TOP2BQ02880 1626 aa32.66■■■□□ 2.82
RBM3-210ENST00000491236 ARAP1Q96P48 1450 aa32.64■■■□□ 2.82
RBM3-210ENST00000491236 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.62■■■□□ 2.81
RBM3-210ENST00000491236 CLASP1Q7Z460 1538 aa32.61■■■□□ 2.81
RBM3-210ENST00000491236 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa32.58■■■□□ 2.81
RBM3-210ENST00000491236 PBRM1Q86U86 1689 aa32.56■■■□□ 2.8
RBM3-210ENST00000491236 TRHP20396 242 aaPredicted RBP32.54■■■□□ 2.8
RBM3-210ENST00000491236 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32.51■■■□□ 2.79
RBM3-210ENST00000491236 GRIN2AQ12879 1464 aa32.49■■■□□ 2.79
RBM3-210ENST00000491236 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.41■■■□□ 2.78
RBM3-210ENST00000491236 ADAMTS12P58397 1594 aa32.4■■■□□ 2.78
RBM3-210ENST00000491236 NUP160Q12769 1436 aa32.37■■■□□ 2.77
RBM3-210ENST00000491236 CEP170Q5SW79 1584 aa32.27■■■□□ 2.76
RBM3-210ENST00000491236 KIF27Q86VH2 1401 aa32.26■■■□□ 2.75
RBM3-210ENST00000491236 JPH4Q96JJ6 628 aa32.24■■■□□ 2.75
RBM3-210ENST00000491236 IGF1RP08069 1367 aa32.2■■■□□ 2.75
RBM3-210ENST00000491236 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP32.14■■■□□ 2.74
RBM3-210ENST00000491236 ERCC6L2Q5T890 1561 aa32.14■■■□□ 2.74
RBM3-210ENST00000491236 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa32.03■■■□□ 2.72
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