Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SGIP1Q9BQI5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SGIP1Q9BQI5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SGIP1Q9BQI5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SGIP1Q9BQI5 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SGIP1Q9BQI5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SGIP1Q9BQI5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SGIP1Q9BQI5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SGIP1Q9BQI5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SGIP1Q9BQI5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SGIP1Q9BQI5 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SGIP1Q9BQI5 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SGIP1Q9BQI5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SGIP1Q9BQI5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SGIP1Q9BQI5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SGIP1Q9BQI5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SGIP1Q9BQI5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SGIP1Q9BQI5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SGIP1Q9BQI5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SGIP1Q9BQI5 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
SGIP1Q9BQI5 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SGIP1Q9BQI5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SGIP1Q9BQI5 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SGIP1Q9BQI5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SGIP1Q9BQI5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
SGIP1Q9BQI5 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SGIP1Q9BQI5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SGIP1Q9BQI5 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SGIP1Q9BQI5 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SGIP1Q9BQI5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
SGIP1Q9BQI5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SGIP1Q9BQI5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SGIP1Q9BQI5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SGIP1Q9BQI5 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SGIP1Q9BQI5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SGIP1Q9BQI5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SGIP1Q9BQI5 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SGIP1Q9BQI5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SGIP1Q9BQI5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
SGIP1Q9BQI5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SGIP1Q9BQI5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SGIP1Q9BQI5 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SGIP1Q9BQI5 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SGIP1Q9BQI5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SGIP1Q9BQI5 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SGIP1Q9BQI5 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SGIP1Q9BQI5 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SGIP1Q9BQI5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SGIP1Q9BQI5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SGIP1Q9BQI5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SGIP1Q9BQI5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SGIP1Q9BQI5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SGIP1Q9BQI5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SGIP1Q9BQI5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SGIP1Q9BQI5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SGIP1Q9BQI5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SGIP1Q9BQI5 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SGIP1Q9BQI5 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SGIP1Q9BQI5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SGIP1Q9BQI5 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SGIP1Q9BQI5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SGIP1Q9BQI5 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
SGIP1Q9BQI5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SGIP1Q9BQI5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
SGIP1Q9BQI5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SGIP1Q9BQI5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SGIP1Q9BQI5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SGIP1Q9BQI5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SGIP1Q9BQI5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SGIP1Q9BQI5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SGIP1Q9BQI5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SGIP1Q9BQI5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
SGIP1Q9BQI5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
SGIP1Q9BQI5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SGIP1Q9BQI5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SGIP1Q9BQI5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SGIP1Q9BQI5 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SGIP1Q9BQI5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SGIP1Q9BQI5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SGIP1Q9BQI5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SGIP1Q9BQI5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SGIP1Q9BQI5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SGIP1Q9BQI5 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SGIP1Q9BQI5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SGIP1Q9BQI5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SGIP1Q9BQI5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SGIP1Q9BQI5 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SGIP1Q9BQI5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SGIP1Q9BQI5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SGIP1Q9BQI5 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SGIP1Q9BQI5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SGIP1Q9BQI5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SGIP1Q9BQI5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SGIP1Q9BQI5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SGIP1Q9BQI5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SGIP1Q9BQI5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SGIP1Q9BQI5 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SGIP1Q9BQI5 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SGIP1Q9BQI5 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SGIP1Q9BQI5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms