RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218230.5

PCSK1N-201, Transcript of proprotein convertase subtilisin/kexin type 1 inhibitor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PCSK1N, Length 1,050 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1N-201ENST00000218230 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.12■■■■■ 5.93
PCSK1N-201ENST00000218230 ABCC9O60706 1549 aa46.88■■■■■ 5.09
PCSK1N-201ENST00000218230 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa46.49■■■■■ 5.03
PCSK1N-201ENST00000218230 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.4■■■■■ 4.7
PCSK1N-201ENST00000218230 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.09■■■■■ 4.65
PCSK1N-201ENST00000218230 NACADO15069 1562 aa43.99■■■■■ 4.63
PCSK1N-201ENST00000218230 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.95■■■■■ 4.63
PCSK1N-201ENST00000218230 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.62■■■■■ 4.57
PCSK1N-201ENST00000218230 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.45■■■■■ 4.55
PCSK1N-201ENST00000218230 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.43■■■■■ 4.54
PCSK1N-201ENST00000218230 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.43■■■■■ 4.54
PCSK1N-201ENST00000218230 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.27■■■■■ 4.52
PCSK1N-201ENST00000218230 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.12■■■■■ 4.49
PCSK1N-201ENST00000218230 SCRIBQ14160 1630 aa42.53■■■■■ 4.4
PCSK1N-201ENST00000218230 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.4■■■■■ 4.38
PCSK1N-201ENST00000218230 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.27■■■■■ 4.36
PCSK1N-201ENST00000218230 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.19■■■■■ 4.34
PCSK1N-201ENST00000218230 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.1■■■■■ 4.33
PCSK1N-201ENST00000218230 NCAPD3P42695 1498 aa40.59■■■■■ 4.09
PCSK1N-201ENST00000218230 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.58■■■■■ 4.09
PCSK1N-201ENST00000218230 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.51■■■■■ 4.07
PCSK1N-201ENST00000218230 ERCC6Q03468 1493 aa40.5■■■■■ 4.07
PCSK1N-201ENST00000218230 SMARCA4P51532 1647 aa40.45■■■■■ 4.07
PCSK1N-201ENST00000218230 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.43■■■■■ 4.06
PCSK1N-201ENST00000218230 SMARCA2P51531 1590 aa40.38■■■■■ 4.05
PCSK1N-201ENST00000218230 CUX2O14529 1486 aa40.36■■■■■ 4.05
PCSK1N-201ENST00000218230 HMGXB3Q12766 1538 aa40.32■■■■■ 4.04
PCSK1N-201ENST00000218230 NESP48681 1621 aa40.2■■■■■ 4.03
PCSK1N-201ENST00000218230 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.16■■■■■ 4.02
PCSK1N-201ENST00000218230 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.09■■■■■ 4.01
PCSK1N-201ENST00000218230 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.08■■■■■ 4.01
PCSK1N-201ENST00000218230 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.78■■■■□ 3.96
PCSK1N-201ENST00000218230 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.76■■■■□ 3.96
PCSK1N-201ENST00000218230 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.74■■■■□ 3.95
PCSK1N-201ENST00000218230 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.66■■■■□ 3.94
PCSK1N-201ENST00000218230 WIZO95785 1651 aa39.64■■■■□ 3.94
PCSK1N-201ENST00000218230 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.56■■■■□ 3.92
PCSK1N-201ENST00000218230 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.39■■■■□ 3.9
PCSK1N-201ENST00000218230 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.34■■■■□ 3.89
PCSK1N-201ENST00000218230 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.28■■■■□ 3.88
PCSK1N-201ENST00000218230 WDR62O43379 1518 aa39.15■■■■□ 3.86
PCSK1N-201ENST00000218230 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.1■■■■□ 3.85
PCSK1N-201ENST00000218230 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.02■■■■□ 3.84
PCSK1N-201ENST00000218230 TRIM41Q8WV44 630 aa38.92■■■■□ 3.82
PCSK1N-201ENST00000218230 CFTRP13569 1480 aa38.89■■■■□ 3.82
PCSK1N-201ENST00000218230 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.82■■■■□ 3.81
PCSK1N-201ENST00000218230 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.75■■■■□ 3.79
PCSK1N-201ENST00000218230 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.72■■■■□ 3.79
PCSK1N-201ENST00000218230 PRDM2Q13029 1718 aa38.52■■■■□ 3.76
PCSK1N-201ENST00000218230 OSCARQ8IYS5 282 aa38.5■■■■□ 3.75
PCSK1N-201ENST00000218230 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.3■■■■□ 3.72
PCSK1N-201ENST00000218230 IFT140Q96RY7 1462 aa38.27■■■■□ 3.72
PCSK1N-201ENST00000218230 TOPBP1Q92547 1522 aa38.24■■■■□ 3.71
PCSK1N-201ENST00000218230 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa38.09■■■■□ 3.69
PCSK1N-201ENST00000218230 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.09■■■■□ 3.69
PCSK1N-201ENST00000218230 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.09■■■■□ 3.69
PCSK1N-201ENST00000218230 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.09■■■■□ 3.69
PCSK1N-201ENST00000218230 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.07■■■■□ 3.69
PCSK1N-201ENST00000218230 ABCC8Q09428 1581 aa38.04■■■■□ 3.68
PCSK1N-201ENST00000218230 ARHGEF11O15085 1522 aa37.94■■■■□ 3.66
PCSK1N-201ENST00000218230 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.92■■■■□ 3.66
PCSK1N-201ENST00000218230 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.89■■■■□ 3.66
PCSK1N-201ENST00000218230 CHD1O14646 1710 aa37.86■■■■□ 3.65
PCSK1N-201ENST00000218230 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.84■■■■□ 3.65
PCSK1N-201ENST00000218230 FBLN2P98095 1184 aa37.8■■■■□ 3.64
PCSK1N-201ENST00000218230 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.76■■■■□ 3.63
PCSK1N-201ENST00000218230 CYB5RLQ6IPT4 315 aa37.7■■■■□ 3.63
PCSK1N-201ENST00000218230 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.67■■■■□ 3.62
PCSK1N-201ENST00000218230 SOGA1O94964 1423 aa37.65■■■■□ 3.62
PCSK1N-201ENST00000218230 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.61■■■■□ 3.61
PCSK1N-201ENST00000218230 CUX1P39880 1505 aa37.61■■■■□ 3.61
PCSK1N-201ENST00000218230 ARAP1Q96P48 1450 aa37.57■■■■□ 3.6
PCSK1N-201ENST00000218230 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.55■■■■□ 3.6
PCSK1N-201ENST00000218230 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.49■■■■□ 3.59
PCSK1N-201ENST00000218230 TRHP20396 242 aaPredicted RBP37.42■■■■□ 3.58
PCSK1N-201ENST00000218230 WDR97A6NE52 1622 aa37.4■■■■□ 3.58
PCSK1N-201ENST00000218230 TOP2BQ02880 1626 aa37.4■■■■□ 3.58
PCSK1N-201ENST00000218230 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.39■■■■□ 3.58
PCSK1N-201ENST00000218230 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.39■■■■□ 3.58
PCSK1N-201ENST00000218230 GRIN2BQ13224 1484 aa37.35■■■■□ 3.57
PCSK1N-201ENST00000218230 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.35■■■■□ 3.57
PCSK1N-201ENST00000218230 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.34■■■■□ 3.57
PCSK1N-201ENST00000218230 SYNJ1O43426 1573 aa37.33■■■■□ 3.57
PCSK1N-201ENST00000218230 SYNJ2O15056 1496 aa37.25■■■■□ 3.55
PCSK1N-201ENST00000218230 PBRM1Q86U86 1689 aa37.24■■■■□ 3.55
PCSK1N-201ENST00000218230 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.2■■■■□ 3.55
PCSK1N-201ENST00000218230 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.2■■■■□ 3.55
PCSK1N-201ENST00000218230 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.09■■■■□ 3.53
PCSK1N-201ENST00000218230 GRIN2AQ12879 1464 aa36.88■■■■□ 3.5
PCSK1N-201ENST00000218230 ADAMTS12P58397 1594 aa36.87■■■■□ 3.49
PCSK1N-201ENST00000218230 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.83■■■■□ 3.49
PCSK1N-201ENST00000218230 CEP170Q5SW79 1584 aa36.79■■■■□ 3.48
PCSK1N-201ENST00000218230 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.78■■■■□ 3.48
PCSK1N-201ENST00000218230 KIF27Q86VH2 1401 aa36.74■■■■□ 3.47
PCSK1N-201ENST00000218230 NUP160Q12769 1436 aa36.72■■■■□ 3.47
PCSK1N-201ENST00000218230 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.69■■■■□ 3.46
PCSK1N-201ENST00000218230 SHROOM2Q13796 1616 aa36.59■■■■□ 3.45
PCSK1N-201ENST00000218230 IGF1RP08069 1367 aa36.53■■■■□ 3.44
PCSK1N-201ENST00000218230 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP36.47■■■■□ 3.43
PCSK1N-201ENST00000218230 CUL7Q14999 1698 aa36.47■■■■□ 3.43
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