Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.041e-11■■■■■ 48
PCBP2Q15366 COMMD4-212ENST00000565517 536 ntTSL 414.6□□□□□ -0.071e-11■■■■■ 48
PCBP2Q15366 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.071e-11■■■■■ 48
PCBP2Q15366 COMMD4-219ENST00000567399 976 ntTSL 514.45□□□□□ -0.11e-11■■■■■ 48
PCBP2Q15366 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.111e-11■■■■■ 48
PCBP2Q15366 COMMD4-223ENST00000568301 666 ntTSL 513.78□□□□□ -0.21e-11■■■■■ 48
PCBP2Q15366 CCHCR1-229ENST00000512418 565 ntTSL 413.56□□□□□ -0.241e-11■■■■■ 48
PCBP2Q15366 CCHCR1-222ENST00000507459 582 ntTSL 513.31□□□□□ -0.281e-11■■■■■ 48
PCBP2Q15366 COMMD4-216ENST00000567023 926 ntTSL 213.22□□□□□ -0.291e-11■■■■■ 48
PCBP2Q15366 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.331e-11■■■■■ 48
PCBP2Q15366 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.331e-11■■■■■ 48
PCBP2Q15366 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.331e-11■■■■■ 48
PCBP2Q15366 CCHCR1-227ENST00000508852 589 ntTSL 412.6□□□□□ -0.391e-11■■■■■ 48
PCBP2Q15366 CCHCR1-205ENST00000428174 470 ntTSL 312.37□□□□□ -0.431e-11■■■■■ 48
PCBP2Q15366 COMMD4-214ENST00000566230 490 ntTSL 312.35□□□□□ -0.431e-11■■■■■ 48
PCBP2Q15366 COMMD4-209ENST00000564068 4204 nt12.16□□□□□ -0.461e-11■■■■■ 48
PCBP2Q15366 DCUN1D2-206ENST00000465710 460 ntTSL 311.86□□□□□ -0.511e-11■■■■■ 48
PCBP2Q15366 DCUN1D2-202ENST00000375403 3164 ntTSL 211.2□□□□□ -0.621e-11■■■■■ 48
PCBP2Q15366 CCHCR1-219ENST00000505392 547 ntTSL 410.74□□□□□ -0.691e-11■■■■■ 48
PCBP2Q15366 CCHCR1-213ENST00000480060 601 ntTSL 310.3□□□□□ -0.761e-11■■■■■ 48
PCBP2Q15366 COMMD4-203ENST00000480484 3225 ntTSL 1 (best)10.1□□□□□ -0.791e-11■■■■■ 48
PCBP2Q15366 CCHCR1-212ENST00000475684 786 ntTSL 59.53□□□□□ -0.881e-11■■■■■ 48
PCBP2Q15366 DCUN1D2-204ENST00000439909 562 ntTSL 58.75□□□□□ -1.011e-11■■■■■ 48
PCBP2Q15366 TAF1-201ENST00000276072 5692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.051e-11■■■■■ 48
PCBP2Q15366 UTP4-211ENST00000567460 595 ntTSL 420.92■□□□□ 0.943e-12■■■■■ 48
PCBP2Q15366 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.73e-12■■■■■ 48
PCBP2Q15366 UTP4-203ENST00000562237 2186 ntTSL 1 (best)19.42■□□□□ 0.73e-12■■■■■ 48
PCBP2Q15366 UTP4-215ENST00000569615 574 ntTSL 311.93□□□□□ -0.53e-12■■■■■ 48
PCBP2Q15366 UTP4-214ENST00000569014 568 ntTSL 411.52□□□□□ -0.573e-12■■■■■ 48
PCBP2Q15366 UTP4-208ENST00000567015 690 ntTSL 211.16□□□□□ -0.623e-12■■■■■ 48
PCBP2Q15366 UTP4-207ENST00000566227 747 ntTSL 39.92□□□□□ -0.823e-12■■■■■ 48
PCBP2Q15366 UTP4-202ENST00000352319 1841 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.893e-12■■■■■ 48
PCBP2Q15366 UTP4-206ENST00000564408 553 ntTSL 38.23□□□□□ -1.093e-12■■■■■ 48
PCBP2Q15366 UTP4-204ENST00000563094 4183 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.33e-12■■■■■ 48
PCBP2Q15366 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.222e-7■■■■■ 47.9
PCBP2Q15366 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.052e-7■■■■■ 47.9
PCBP2Q15366 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.136e-7■■■■■ 47.9
PCBP2Q15366 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.28e-7■■■■■ 47.9
PCBP2Q15366 SMS-202ENST00000404933 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.558e-7■■■■■ 47.9
PCBP2Q15366 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.219e-7■■■■■ 47.9
PCBP2Q15366 MACROD1-207ENST00000543422 403 ntTSL 313.99□□□□□ -0.174e-7■■■■■ 47.8
PCBP2Q15366 PKN2-205ENST00000449189 342 ntTSL 35.1□□□□□ -1.592e-6■■■■■ 47.8
PCBP2Q15366 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.221e-8■■■■■ 47.8
PCBP2Q15366 PTK2-255ENST00000524202 3014 ntTSL 1 (best)7.84□□□□□ -1.157e-7■■■■■ 47.7
PCBP2Q15366 DDR1-245ENST00000484556 1038 ntTSL 216.89■□□□□ 0.295e-60■■■■■ 47.7
PCBP2Q15366 ASB3-203ENST00000406053 2648 ntTSL 55.15□□□□□ -1.582e-8■■■■■ 47.7
PCBP2Q15366 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.282e-10■■■■■ 47.7
PCBP2Q15366 MCPH1-202ENST00000519221 539 ntTSL 311.93□□□□□ -0.57e-12■■■■■ 47.7
PCBP2Q15366 MCPH1-204ENST00000521129 540 ntTSL 210.56□□□□□ -0.727e-12■■■■■ 47.7
PCBP2Q15366 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.126e-7■■■■■ 47.6
PCBP2Q15366 KDM5B-205ENST00000467487 529 ntTSL 317.36■□□□□ 0.374e-7■■■■■ 47.6
PCBP2Q15366 KDM5B-201ENST00000235790 4418 ntTSL 213.74□□□□□ -0.214e-7■■■■■ 47.6
PCBP2Q15366 KDM5B-206ENST00000470573 535 ntTSL 46.46□□□□□ -1.384e-7■■■■■ 47.6
PCBP2Q15366 DCDC2-202ENST00000378454 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.374e-7■■■■■ 47.6
PCBP2Q15366 PCBP2-222ENST00000552296 1342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.113e-9■■■■■ 47.6
PCBP2Q15366 SRPK2-214ENST00000489828 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.048e-7■■■■■ 47.5
PCBP2Q15366 THRAP3-203ENST00000469141 3339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.499e-7■■■■■ 47.5
PCBP2Q15366 THRAP3-201ENST00000354618 4432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.629e-7■■■■■ 47.5
PCBP2Q15366 LIN54-208ENST00000509748 729 ntTSL 519.78■□□□□ 0.766e-23■■■■■ 47.5
PCBP2Q15366 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.66e-23■■■■■ 47.5
PCBP2Q15366 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.266e-23■■■■■ 47.5
PCBP2Q15366 LIN54-201ENST00000340417 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.426e-23■■■■■ 47.5
PCBP2Q15366 LIN54-206ENST00000506560 2757 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.496e-23■■■■■ 47.5
PCBP2Q15366 LIN54-210ENST00000510877 4507 ntTSL 1 (best)11.73□□□□□ -0.536e-23■■■■■ 47.5
PCBP2Q15366 LIN54-207ENST00000508171 2684 ntTSL 1 (best)10.76□□□□□ -0.696e-23■■■■■ 47.5
PCBP2Q15366 LIN54-203ENST00000446851 4083 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.846e-23■■■■■ 47.5
PCBP2Q15366 LIN54-202ENST00000442461 4254 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.856e-23■■■■■ 47.5
PCBP2Q15366 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.149e-11■■■■■ 47.5
PCBP2Q15366 ANP32E-210ENST00000629042 3054 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.489e-11■■■■■ 47.5
PCBP2Q15366 ANP32E-208ENST00000583931 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.849e-11■■■■■ 47.5
PCBP2Q15366 ANP32E-203ENST00000436748 1339 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.039e-11■■■■■ 47.5
PCBP2Q15366 ANP32E-205ENST00000533654 908 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.189e-11■■■■■ 47.5
PCBP2Q15366 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.79e-11■■■■■ 47.5
PCBP2Q15366 ANP32E-207ENST00000534437 616 ntTSL 34.12□□□□□ -1.759e-11■■■■■ 47.5
PCBP2Q15366 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.939e-11■■■■■ 47.5
PCBP2Q15366 ZEB1-207ENST00000493835 683 ntTSL 56.83□□□□□ -1.321e-8■■■■■ 47.4
PCBP2Q15366 FREM1-202ENST00000380880 7324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.949e-7■■■■■ 47.4
PCBP2Q15366 FREM1-201ENST00000380875 6126 ntTSL 1 (best)9.09□□□□□ -0.959e-7■■■■■ 47.4
PCBP2Q15366 FREM1-204ENST00000422223 10086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.059e-7■■■■■ 47.4
PCBP2Q15366 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.943e-9■■■■■ 47.4
PCBP2Q15366 SGMS1-209ENST00000609445 594 ntTSL 414.77□□□□□ -0.053e-9■■■■■ 47.4
PCBP2Q15366 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.283e-9■■■■■ 47.4
PCBP2Q15366 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.293e-9■■■■■ 47.4
PCBP2Q15366 STAG3L3-202ENST00000428423 2137 ntTSL 313.29□□□□□ -0.285e-11■■■■■ 47.3
PCBP2Q15366 STAG3L3-203ENST00000436857 1033 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.55e-11■■■■■ 47.3
PCBP2Q15366 SPPL3-208ENST00000543854 508 ntTSL 517.95■□□□□ 0.461e-7■■■■■ 47.3
PCBP2Q15366 SPPL3-207ENST00000543608 636 ntTSL 315.04■□□□□ -01e-7■■■■■ 47.3
PCBP2Q15366 SPPL3-204ENST00000536996 763 ntTSL 513.84□□□□□ -0.191e-7■■■■■ 47.3
PCBP2Q15366 SPPL3-206ENST00000543181 663 ntTSL 36.1□□□□□ -1.431e-7■■■■■ 47.3
PCBP2Q15366 RAD23B-203ENST00000419616 716 ntTSL 317.75■□□□□ 0.438e-8■■■■■ 47.3
PCBP2Q15366 RAD23B-204ENST00000442587 456 ntTSL 26.47□□□□□ -1.378e-8■■■■■ 47.3
PCBP2Q15366 DTD1-202ENST00000494921 2384 ntTSL 216.63■□□□□ 0.251e-7■■■■■ 47.2
PCBP2Q15366 FUBP3-202ENST00000465949 676 ntTSL 55.62□□□□□ -1.512e-14■■■■■ 47.2
PCBP2Q15366 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.132e-12■■■■■ 47.2
PCBP2Q15366 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.82e-12■■■■■ 47.2
PCBP2Q15366 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.792e-12■■■■■ 47.2
PCBP2Q15366 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.692e-12■■■■■ 47.2
PCBP2Q15366 SPNS1-206ENST00000564476 890 ntTSL 318.24■□□□□ 0.512e-12■■■■■ 47.2
PCBP2Q15366 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.492e-12■■■■■ 47.2
PCBP2Q15366 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.372e-12■■■■■ 47.2
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