RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567460.5

UTP4-211, Transcript of UTP4, small subunit processome component, humanhuman

TSL 4

Gene UTP4, Length 595 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4-211ENST00000567460 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.34■■■■■ 6.77
UTP4-211ENST00000567460 ABCC9O60706 1549 aa51.57■■■■■ 5.85
UTP4-211ENST00000567460 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.49■■■■■ 5.83
UTP4-211ENST00000567460 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.07■■■■■ 5.45
UTP4-211ENST00000567460 NACADO15069 1562 aa48.71■■■■■ 5.39
UTP4-211ENST00000567460 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.52■■■■■ 5.36
UTP4-211ENST00000567460 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.4■■■■■ 5.34
UTP4-211ENST00000567460 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.01■■■■■ 5.28
UTP4-211ENST00000567460 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.99■■■■■ 5.27
UTP4-211ENST00000567460 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.92■■■■■ 5.26
UTP4-211ENST00000567460 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.59■■■■■ 5.21
UTP4-211ENST00000567460 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.49■■■■■ 5.19
UTP4-211ENST00000567460 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.35■■■■■ 5.17
UTP4-211ENST00000567460 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.99■■■■■ 5.11
UTP4-211ENST00000567460 SCRIBQ14160 1630 aa46.92■■■■■ 5.1
UTP4-211ENST00000567460 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.57■■■■■ 5.05
UTP4-211ENST00000567460 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.47■■■■■ 5.03
UTP4-211ENST00000567460 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.45■■■■■ 5.03
UTP4-211ENST00000567460 NCAPD3P42695 1498 aa44.95■■■■■ 4.79
UTP4-211ENST00000567460 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.8■■■■■ 4.76
UTP4-211ENST00000567460 SMARCA4P51532 1647 aa44.75■■■■■ 4.75
UTP4-211ENST00000567460 SMARCA2P51531 1590 aa44.71■■■■■ 4.75
UTP4-211ENST00000567460 HMGXB3Q12766 1538 aa44.61■■■■■ 4.73
UTP4-211ENST00000567460 ERCC6Q03468 1493 aa44.58■■■■■ 4.73
UTP4-211ENST00000567460 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.54■■■■■ 4.72
UTP4-211ENST00000567460 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.53■■■■■ 4.72
UTP4-211ENST00000567460 CUX2O14529 1486 aa44.48■■■■■ 4.71
UTP4-211ENST00000567460 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.4■■■■■ 4.7
UTP4-211ENST00000567460 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.3■■■■■ 4.68
UTP4-211ENST00000567460 NESP48681 1621 aa44.26■■■■■ 4.68
UTP4-211ENST00000567460 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.17■■■■■ 4.66
UTP4-211ENST00000567460 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.97■■■■■ 4.63
UTP4-211ENST00000567460 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.82■■■■■ 4.61
UTP4-211ENST00000567460 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.74■■■■■ 4.59
UTP4-211ENST00000567460 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.7■■■■■ 4.59
UTP4-211ENST00000567460 WIZO95785 1651 aa43.64■■■■■ 4.58
UTP4-211ENST00000567460 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.6■■■■■ 4.57
UTP4-211ENST00000567460 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.34■■■■■ 4.53
UTP4-211ENST00000567460 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.23■■■■■ 4.51
UTP4-211ENST00000567460 WDR62O43379 1518 aa43.22■■■■■ 4.51
UTP4-211ENST00000567460 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.17■■■■■ 4.5
UTP4-211ENST00000567460 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.11■■■■■ 4.49
UTP4-211ENST00000567460 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.09■■■■■ 4.49
UTP4-211ENST00000567460 CFTRP13569 1480 aa43.07■■■■■ 4.49
UTP4-211ENST00000567460 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.73■■■■■ 4.43
UTP4-211ENST00000567460 PRDM2Q13029 1718 aa42.64■■■■■ 4.42
UTP4-211ENST00000567460 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.62■■■■■ 4.41
UTP4-211ENST00000567460 TRIM41Q8WV44 630 aa42.6■■■■■ 4.41
UTP4-211ENST00000567460 OSCARQ8IYS5 282 aa42.48■■■■■ 4.39
UTP4-211ENST00000567460 IFT140Q96RY7 1462 aa42.3■■■■■ 4.36
UTP4-211ENST00000567460 TOPBP1Q92547 1522 aa42.27■■■■■ 4.36
UTP4-211ENST00000567460 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.22■■■■■ 4.35
UTP4-211ENST00000567460 ABCC8Q09428 1581 aa42.22■■■■■ 4.35
UTP4-211ENST00000567460 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.12■■■■■ 4.33
UTP4-211ENST00000567460 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.99■■■■■ 4.31
UTP4-211ENST00000567460 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.89■■■■■ 4.3
UTP4-211ENST00000567460 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.88■■■■■ 4.3
UTP4-211ENST00000567460 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.88■■■■■ 4.3
UTP4-211ENST00000567460 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.88■■■■■ 4.3
UTP4-211ENST00000567460 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.85■■■■■ 4.291e-10■■■■■ 30.1
UTP4-211ENST00000567460 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.83■■■■■ 4.29
UTP4-211ENST00000567460 ARHGEF11O15085 1522 aa41.74■■■■■ 4.27
UTP4-211ENST00000567460 CHD1O14646 1710 aa41.69■■■■■ 4.27
UTP4-211ENST00000567460 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.68■■■■■ 4.26
UTP4-211ENST00000567460 SOGA1O94964 1423 aa41.67■■■■■ 4.26
UTP4-211ENST00000567460 FBLN2P98095 1184 aa41.66■■■■■ 4.26
UTP4-211ENST00000567460 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.58■■■■■ 4.25
UTP4-211ENST00000567460 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.56■■■■■ 4.24
UTP4-211ENST00000567460 CUX1P39880 1505 aa41.51■■■■■ 4.24
UTP4-211ENST00000567460 WDR97A6NE52 1622 aa41.49■■■■■ 4.23
UTP4-211ENST00000567460 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.49■■■■■ 4.23
UTP4-211ENST00000567460 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.41■■■■■ 4.22
UTP4-211ENST00000567460 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.33■■■■■ 4.21
UTP4-211ENST00000567460 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.33■■■■■ 4.21
UTP4-211ENST00000567460 GRIN2BQ13224 1484 aa41.32■■■■■ 4.2
UTP4-211ENST00000567460 ARAP1Q96P48 1450 aa41.32■■■■■ 4.2
UTP4-211ENST00000567460 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.32■■■■■ 4.2
UTP4-211ENST00000567460 SYNJ1O43426 1573 aa41.21■■■■■ 4.19
UTP4-211ENST00000567460 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.2■■■■■ 4.19
UTP4-211ENST00000567460 SYNJ2O15056 1496 aa41.18■■■■■ 4.18
UTP4-211ENST00000567460 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.16■■■■■ 4.18
UTP4-211ENST00000567460 PBRM1Q86U86 1689 aa41.13■■■■■ 4.17
UTP4-211ENST00000567460 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.09■■■■■ 4.17
UTP4-211ENST00000567460 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.09■■■■■ 4.17
UTP4-211ENST00000567460 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.03■■■■■ 4.16
UTP4-211ENST00000567460 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.95■■■■■ 4.15
UTP4-211ENST00000567460 TOP2BQ02880 1626 aa40.84■■■■■ 4.13
UTP4-211ENST00000567460 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.83■■■■■ 4.13
UTP4-211ENST00000567460 GRIN2AQ12879 1464 aa40.77■■■■■ 4.12
UTP4-211ENST00000567460 ADAMTS12P58397 1594 aa40.73■■■■■ 4.11
UTP4-211ENST00000567460 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.63■■■■■ 4.09
UTP4-211ENST00000567460 NUP160Q12769 1436 aa40.61■■■■■ 4.09
UTP4-211ENST00000567460 CEP170Q5SW79 1584 aa40.61■■■■■ 4.09
UTP4-211ENST00000567460 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.58■■■■■ 4.09
UTP4-211ENST00000567460 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.54■■■■■ 4.08
UTP4-211ENST00000567460 SHROOM2Q13796 1616 aa40.44■■■■■ 4.06
UTP4-211ENST00000567460 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.27■■■■■ 4.04
UTP4-211ENST00000567460 JPH4Q96JJ6 628 aa40.25■■■■■ 4.03
UTP4-211ENST00000567460 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.15■■■■■ 4.02
UTP4-211ENST00000567460 KIF27Q86VH2 1401 aa40.07■■■■■ 4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.1 ms