RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000352260.11

SPNS1-204, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 1,948 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-204ENST00000352260 NISCHQ9Y2I1 1504 aa40.86■■■■■ 4.13
SPNS1-204ENST00000352260 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa35.4■■■■□ 3.26
SPNS1-204ENST00000352260 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.41■■■■□ 3.1
SPNS1-204ENST00000352260 ABCC9O60706 1549 aa34.25■■■■□ 3.07
SPNS1-204ENST00000352260 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.73■■■□□ 2.99
SPNS1-204ENST00000352260 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.69■■■□□ 2.98
SPNS1-204ENST00000352260 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.67■■■□□ 2.98
SPNS1-204ENST00000352260 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.17■■■□□ 2.9
SPNS1-204ENST00000352260 NACADO15069 1562 aa32.91■■■□□ 2.86
SPNS1-204ENST00000352260 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.89■■■□□ 2.86
SPNS1-204ENST00000352260 SCRIBQ14160 1630 aa32.7■■■□□ 2.83
SPNS1-204ENST00000352260 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.58■■■□□ 2.81
SPNS1-204ENST00000352260 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.13■■■□□ 2.73
SPNS1-204ENST00000352260 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP32.13■■■□□ 2.73
SPNS1-204ENST00000352260 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.98■■■□□ 2.71
SPNS1-204ENST00000352260 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.87■■■□□ 2.69
SPNS1-204ENST00000352260 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.78■■■□□ 2.68
SPNS1-204ENST00000352260 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.62■■■□□ 2.65
SPNS1-204ENST00000352260 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.5■■■□□ 2.63
SPNS1-204ENST00000352260 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.47■■■□□ 2.63
SPNS1-204ENST00000352260 WIZO95785 1651 aa31.38■■■□□ 2.61
SPNS1-204ENST00000352260 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.37■■■□□ 2.61
SPNS1-204ENST00000352260 SMARCA4P51532 1647 aa31.33■■■□□ 2.61
SPNS1-204ENST00000352260 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.1■■■□□ 2.57
SPNS1-204ENST00000352260 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.03■■■□□ 2.56
SPNS1-204ENST00000352260 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.93■■■□□ 2.54
SPNS1-204ENST00000352260 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.9■■■□□ 2.54
SPNS1-204ENST00000352260 SMARCA2P51531 1590 aa30.78■■■□□ 2.52
SPNS1-204ENST00000352260 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.75■■■□□ 2.51
SPNS1-204ENST00000352260 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.73■■■□□ 2.51
SPNS1-204ENST00000352260 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.57■■■□□ 2.48
SPNS1-204ENST00000352260 TRIM41Q8WV44 630 aa30.56■■■□□ 2.48
SPNS1-204ENST00000352260 HRCP23327 699 aa30.46■■■□□ 2.47
SPNS1-204ENST00000352260 NCAPD3P42695 1498 aa30.45■■■□□ 2.47
SPNS1-204ENST00000352260 HMGXB3Q12766 1538 aa30.36■■■□□ 2.45
SPNS1-204ENST00000352260 ABCC8Q09428 1581 aa30.25■■■□□ 2.43
SPNS1-204ENST00000352260 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa30.23■■■□□ 2.43
SPNS1-204ENST00000352260 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP30.08■■■□□ 2.41
SPNS1-204ENST00000352260 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.97■■■□□ 2.39
SPNS1-204ENST00000352260 SYNJ1O43426 1573 aa29.86■■■□□ 2.37
SPNS1-204ENST00000352260 CFTRP13569 1480 aa29.82■■■□□ 2.36
SPNS1-204ENST00000352260 SOGA1O94964 1423 aa29.77■■■□□ 2.36
SPNS1-204ENST00000352260 NESP48681 1621 aa29.71■■■□□ 2.35
SPNS1-204ENST00000352260 EEA1Q15075 1411 aa29.7■■■□□ 2.34
SPNS1-204ENST00000352260 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.68■■■□□ 2.34
SPNS1-204ENST00000352260 TOP2BQ02880 1626 aa29.67■■■□□ 2.34
SPNS1-204ENST00000352260 PRDM2Q13029 1718 aa29.65■■■□□ 2.34
SPNS1-204ENST00000352260 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.65■■■□□ 2.34
SPNS1-204ENST00000352260 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.64■■■□□ 2.34
SPNS1-204ENST00000352260 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.63■■■□□ 2.33
SPNS1-204ENST00000352260 PCGF6Q9BYE7 350 aa29.58■■■□□ 2.33
SPNS1-204ENST00000352260 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
SPNS1-204ENST00000352260 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29.54■■■□□ 2.32
SPNS1-204ENST00000352260 CUX1P39880 1505 aa29.54■■■□□ 2.32
SPNS1-204ENST00000352260 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.53■■■□□ 2.32
SPNS1-204ENST00000352260 ERCC6Q03468 1493 aa29.43■■■□□ 2.3
SPNS1-204ENST00000352260 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.38■■■□□ 2.29
SPNS1-204ENST00000352260 GOLGA3Q08378 1498 aa29.35■■■□□ 2.29
SPNS1-204ENST00000352260 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.33■■■□□ 2.29
SPNS1-204ENST00000352260 TNIKQ9UKE5 1360 aa29.33■■■□□ 2.29
SPNS1-204ENST00000352260 KIF21BO75037 1637 aa29.32■■■□□ 2.28
SPNS1-204ENST00000352260 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.3■■■□□ 2.28
SPNS1-204ENST00000352260 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
SPNS1-204ENST00000352260 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.23■■■□□ 2.27
SPNS1-204ENST00000352260 CEP162Q5TB80 1403 aa29.22■■■□□ 2.27
SPNS1-204ENST00000352260 UBTFP17480 764 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
SPNS1-204ENST00000352260 KIF27Q86VH2 1401 aa29.16■■■□□ 2.26
SPNS1-204ENST00000352260 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.15■■■□□ 2.26
SPNS1-204ENST00000352260 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.13■■■□□ 2.25
SPNS1-204ENST00000352260 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.12■■■□□ 2.25
SPNS1-204ENST00000352260 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
SPNS1-204ENST00000352260 PRXQ9BXM0 1461 aa29.08■■■□□ 2.25
SPNS1-204ENST00000352260 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
SPNS1-204ENST00000352260 TOPBP1Q92547 1522 aa29.06■■■□□ 2.24
SPNS1-204ENST00000352260 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
SPNS1-204ENST00000352260 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.04■■■□□ 2.24
SPNS1-204ENST00000352260 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.04■■■□□ 2.24
SPNS1-204ENST00000352260 CUX2O14529 1486 aa29.04■■■□□ 2.24
SPNS1-204ENST00000352260 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
SPNS1-204ENST00000352260 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.23
SPNS1-204ENST00000352260 WDR62O43379 1518 aa28.94■■■□□ 2.22
SPNS1-204ENST00000352260 CLIP1P30622 1438 aa28.9■■■□□ 2.22
SPNS1-204ENST00000352260 IGF1RP08069 1367 aa28.89■■■□□ 2.22
SPNS1-204ENST00000352260 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.89■■■□□ 2.22
SPNS1-204ENST00000352260 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.88■■■□□ 2.21
SPNS1-204ENST00000352260 WDR97A6NE52 1622 aa28.75■■■□□ 2.19
SPNS1-204ENST00000352260 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.74■■■□□ 2.19
SPNS1-204ENST00000352260 VPS8Q8N3P4 1428 aa28.69■■■□□ 2.18
SPNS1-204ENST00000352260 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP28.68■■■□□ 2.18
SPNS1-204ENST00000352260 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.62■■■□□ 2.17
SPNS1-204ENST00000352260 ARAP1Q96P48 1450 aa28.6■■■□□ 2.17
SPNS1-204ENST00000352260 CUL7Q14999 1698 aa28.6■■■□□ 2.17
SPNS1-204ENST00000352260 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
SPNS1-204ENST00000352260 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
SPNS1-204ENST00000352260 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.53■■■□□ 2.16
SPNS1-204ENST00000352260 MYT1Q01538 1121 aa28.53■■■□□ 2.16
SPNS1-204ENST00000352260 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa28.51■■■□□ 2.15
SPNS1-204ENST00000352260 IFT140Q96RY7 1462 aa28.51■■■□□ 2.15
SPNS1-204ENST00000352260 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.5■■■□□ 2.15
SPNS1-204ENST00000352260 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
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