Protein–RNA interactions for Protein: P35914

HMGCL, Hydroxymethylglutaryl-CoA lyase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGCLP35914 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGCLP35914 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGCLP35914 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGCLP35914 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGCLP35914 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGCLP35914 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGCLP35914 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGCLP35914 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGCLP35914 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGCLP35914 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGCLP35914 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGCLP35914 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGCLP35914 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGCLP35914 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGCLP35914 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGCLP35914 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGCLP35914 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGCLP35914 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGCLP35914 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGCLP35914 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGCLP35914 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGCLP35914 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGCLP35914 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGCLP35914 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGCLP35914 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGCLP35914 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGCLP35914 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGCLP35914 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMGCLP35914 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMGCLP35914 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMGCLP35914 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMGCLP35914 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMGCLP35914 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMGCLP35914 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HMGCLP35914 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMGCLP35914 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMGCLP35914 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMGCLP35914 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGCLP35914 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGCLP35914 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGCLP35914 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGCLP35914 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGCLP35914 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGCLP35914 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGCLP35914 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGCLP35914 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGCLP35914 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGCLP35914 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMGCLP35914 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMGCLP35914 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMGCLP35914 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMGCLP35914 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMGCLP35914 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMGCLP35914 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMGCLP35914 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMGCLP35914 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMGCLP35914 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMGCLP35914 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMGCLP35914 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMGCLP35914 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMGCLP35914 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMGCLP35914 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMGCLP35914 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMGCLP35914 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMGCLP35914 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMGCLP35914 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMGCLP35914 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGCLP35914 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGCLP35914 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGCLP35914 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGCLP35914 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGCLP35914 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGCLP35914 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGCLP35914 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGCLP35914 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGCLP35914 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGCLP35914 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HMGCLP35914 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
HMGCLP35914 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HMGCLP35914 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMGCLP35914 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMGCLP35914 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMGCLP35914 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMGCLP35914 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMGCLP35914 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMGCLP35914 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMGCLP35914 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HMGCLP35914 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMGCLP35914 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMGCLP35914 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMGCLP35914 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMGCLP35914 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMGCLP35914 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMGCLP35914 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMGCLP35914 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMGCLP35914 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGCLP35914 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGCLP35914 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGCLP35914 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGCLP35914 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms