RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000432597.3

SYCE1-204, Transcript of synaptonemal complex central element protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYCE1, Length 1,254 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE1-204ENST00000432597 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.03■■■■■ 6.72
SYCE1-204ENST00000432597 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.87■■■■■ 5.73
SYCE1-204ENST00000432597 ABCC9O60706 1549 aa50.3■■■■■ 5.64
SYCE1-204ENST00000432597 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.13■■■■■ 5.3
SYCE1-204ENST00000432597 NACADO15069 1562 aa47.95■■■■■ 5.27
SYCE1-204ENST00000432597 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.92■■■■■ 5.26
SYCE1-204ENST00000432597 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.48■■■■■ 5.19
SYCE1-204ENST00000432597 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.4■■■■■ 5.18
SYCE1-204ENST00000432597 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.12■■■■■ 5.13
SYCE1-204ENST00000432597 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.04■■■■■ 5.12
SYCE1-204ENST00000432597 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.94■■■■■ 5.1
SYCE1-204ENST00000432597 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.69■■■■■ 5.07
SYCE1-204ENST00000432597 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.58■■■■■ 5.05
SYCE1-204ENST00000432597 SCRIBQ14160 1630 aa46.45■■■■■ 5.03
SYCE1-204ENST00000432597 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.12■■■■■ 4.97
SYCE1-204ENST00000432597 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.51■■■■■ 4.88
SYCE1-204ENST00000432597 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.45■■■■■ 4.87
SYCE1-204ENST00000432597 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.23■■■■■ 4.83
SYCE1-204ENST00000432597 SMARCA4P51532 1647 aa44.35■■■■■ 4.69
SYCE1-204ENST00000432597 NCAPD3P42695 1498 aa44.26■■■■■ 4.68
SYCE1-204ENST00000432597 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.23■■■■■ 4.67
SYCE1-204ENST00000432597 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.22■■■■■ 4.67
SYCE1-204ENST00000432597 SMARCA2P51531 1590 aa44.14■■■■■ 4.66
SYCE1-204ENST00000432597 HMGXB3Q12766 1538 aa43.99■■■■■ 4.63
SYCE1-204ENST00000432597 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.96■■■■■ 4.63
SYCE1-204ENST00000432597 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.89■■■■■ 4.62
SYCE1-204ENST00000432597 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.85■■■■■ 4.61
SYCE1-204ENST00000432597 WIZO95785 1651 aa43.47■■■■■ 4.55
SYCE1-204ENST00000432597 ERCC6Q03468 1493 aa43.38■■■■■ 4.54
SYCE1-204ENST00000432597 NESP48681 1621 aa43.38■■■■■ 4.54
SYCE1-204ENST00000432597 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.28■■■■■ 4.52
SYCE1-204ENST00000432597 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.16■■■■■ 4.5
SYCE1-204ENST00000432597 CUX2O14529 1486 aa43.05■■■■■ 4.48
SYCE1-204ENST00000432597 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.97■■■■■ 4.47
SYCE1-204ENST00000432597 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.96■■■■■ 4.47
SYCE1-204ENST00000432597 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.91■■■■■ 4.46
SYCE1-204ENST00000432597 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.84■■■■■ 4.45
SYCE1-204ENST00000432597 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.8■■■■■ 4.44
SYCE1-204ENST00000432597 CFTRP13569 1480 aa42.6■■■■■ 4.41
SYCE1-204ENST00000432597 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.5■■■■■ 4.39
SYCE1-204ENST00000432597 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.49■■■■■ 4.39
SYCE1-204ENST00000432597 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.48■■■■■ 4.39
SYCE1-204ENST00000432597 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.47■■■■■ 4.39
SYCE1-204ENST00000432597 WDR62O43379 1518 aa42.37■■■■■ 4.37
SYCE1-204ENST00000432597 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.29■■■■■ 4.36
SYCE1-204ENST00000432597 PRDM2Q13029 1718 aa42.23■■■■■ 4.35
SYCE1-204ENST00000432597 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.09■■■■■ 4.33
SYCE1-204ENST00000432597 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.9■■■■■ 4.3
SYCE1-204ENST00000432597 TOPBP1Q92547 1522 aa41.74■■■■■ 4.27
SYCE1-204ENST00000432597 ABCC8Q09428 1581 aa41.68■■■■■ 4.26
SYCE1-204ENST00000432597 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.65■■■■■ 4.26
SYCE1-204ENST00000432597 IFT140Q96RY7 1462 aa41.59■■■■■ 4.25
SYCE1-204ENST00000432597 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.47■■■■■ 4.23
SYCE1-204ENST00000432597 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.36■■■■■ 4.21
SYCE1-204ENST00000432597 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.31■■■■■ 4.2
SYCE1-204ENST00000432597 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.27■■■■■ 4.2
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SYCE1-204ENST00000432597 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.21■■■■■ 4.19
SYCE1-204ENST00000432597 OSCARQ8IYS5 282 aa41.21■■■■■ 4.19
SYCE1-204ENST00000432597 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.21■■■■■ 4.19
SYCE1-204ENST00000432597 SOGA1O94964 1423 aa41.19■■■■■ 4.18
SYCE1-204ENST00000432597 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.19■■■■■ 4.18
SYCE1-204ENST00000432597 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.03■■■■■ 4.16
SYCE1-204ENST00000432597 WDR97A6NE52 1622 aa40.93■■■■■ 4.14
SYCE1-204ENST00000432597 CHD1O14646 1710 aa40.84■■■■■ 4.13
SYCE1-204ENST00000432597 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.84■■■■■ 4.13
SYCE1-204ENST00000432597 FBLN2P98095 1184 aa40.81■■■■■ 4.12
SYCE1-204ENST00000432597 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.79■■■■■ 4.12
SYCE1-204ENST00000432597 TOP2BQ02880 1626 aa40.78■■■■■ 4.12
SYCE1-204ENST00000432597 TRIM41Q8WV44 630 aa40.77■■■■■ 4.12
SYCE1-204ENST00000432597 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.77■■■■■ 4.12
SYCE1-204ENST00000432597 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.76■■■■■ 4.12
SYCE1-204ENST00000432597 SYNJ1O43426 1573 aa40.76■■■■■ 4.12
SYCE1-204ENST00000432597 GRIN2BQ13224 1484 aa40.76■■■■■ 4.12
SYCE1-204ENST00000432597 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.7■■■■■ 4.11
SYCE1-204ENST00000432597 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.69■■■■■ 4.1
SYCE1-204ENST00000432597 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.64■■■■■ 4.1
SYCE1-204ENST00000432597 PBRM1Q86U86 1689 aa40.64■■■■■ 4.1
SYCE1-204ENST00000432597 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.6■■■■■ 4.09
SYCE1-204ENST00000432597 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.6■■■■■ 4.09
SYCE1-204ENST00000432597 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.6■■■■■ 4.09
SYCE1-204ENST00000432597 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.6■■■■■ 4.09
SYCE1-204ENST00000432597 ARHGEF11O15085 1522 aa40.55■■■■■ 4.08
SYCE1-204ENST00000432597 SYNJ2O15056 1496 aa40.54■■■■■ 4.08
SYCE1-204ENST00000432597 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.37■■■■■ 4.05
SYCE1-204ENST00000432597 ADAMTS12P58397 1594 aa40.3■■■■■ 4.04
SYCE1-204ENST00000432597 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.26■■■■■ 4.04
SYCE1-204ENST00000432597 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.23■■■■■ 4.03
SYCE1-204ENST00000432597 GRIN2AQ12879 1464 aa40.23■■■■■ 4.03
SYCE1-204ENST00000432597 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.21■■■■■ 4.03
SYCE1-204ENST00000432597 ARAP1Q96P48 1450 aa40.19■■■■■ 4.03
SYCE1-204ENST00000432597 NUP160Q12769 1436 aa40.07■■■■■ 4
SYCE1-204ENST00000432597 CEP170Q5SW79 1584 aa40.06■■■■■ 4
SYCE1-204ENST00000432597 KIF27Q86VH2 1401 aa40.01■■■■■ 4
SYCE1-204ENST00000432597 IGF1RP08069 1367 aa39.91■■■■□ 3.98
SYCE1-204ENST00000432597 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.81■■■■□ 3.96
SYCE1-204ENST00000432597 CUL7Q14999 1698 aa39.81■■■■□ 3.96
SYCE1-204ENST00000432597 SHROOM2Q13796 1616 aa39.8■■■■□ 3.96
SYCE1-204ENST00000432597 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.71■■■■□ 3.95
SYCE1-204ENST00000432597 JPH4Q96JJ6 628 aa39.67■■■■□ 3.94
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