RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000396777.7

ARFIP2-202, Transcript of ADP ribosylation factor interacting protein 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ARFIP2, Length 1,868 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2-202ENST00000396777 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.49■■■■■ 5.83
ARFIP2-202ENST00000396777 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.81■■■■■ 4.76
ARFIP2-202ENST00000396777 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.32■■■■■ 4.53
ARFIP2-202ENST00000396777 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.65■■■■■ 4.42
ARFIP2-202ENST00000396777 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.28■■■■■ 4.36
ARFIP2-202ENST00000396777 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.06■■■■■ 4.32
ARFIP2-202ENST00000396777 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.05■■■■■ 4.32
ARFIP2-202ENST00000396777 ABCC9O60706 1549 aa42■■■■■ 4.31
ARFIP2-202ENST00000396777 NACADO15069 1562 aa41.66■■■■■ 4.26
ARFIP2-202ENST00000396777 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.21■■■■■ 4.19
ARFIP2-202ENST00000396777 SCRIBQ14160 1630 aa41.15■■■■■ 4.18
ARFIP2-202ENST00000396777 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.61■■■■■ 4.09
ARFIP2-202ENST00000396777 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.4■■■■■ 4.06
ARFIP2-202ENST00000396777 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.03■■■■■ 4
ARFIP2-202ENST00000396777 BICRAQ9NZM4 1560 aa39.96■■■■□ 3.99
ARFIP2-202ENST00000396777 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.93■■■■□ 3.98
ARFIP2-202ENST00000396777 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.75■■■■□ 3.95
ARFIP2-202ENST00000396777 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.74■■■■□ 3.95
ARFIP2-202ENST00000396777 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP39.64■■■■□ 3.94
ARFIP2-202ENST00000396777 SMARCA4P51532 1647 aa39.52■■■■□ 3.92
ARFIP2-202ENST00000396777 WIZO95785 1651 aa39.44■■■■□ 3.9
ARFIP2-202ENST00000396777 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.09■■■■□ 3.85
ARFIP2-202ENST00000396777 CHIC1Q5VXU3 224 aa39.08■■■■□ 3.85
ARFIP2-202ENST00000396777 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.07■■■■□ 3.84
ARFIP2-202ENST00000396777 SMARCA2P51531 1590 aa38.81■■■■□ 3.8
ARFIP2-202ENST00000396777 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.79■■■■□ 3.8
ARFIP2-202ENST00000396777 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.73■■■■□ 3.79
ARFIP2-202ENST00000396777 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.65■■■■□ 3.78
ARFIP2-202ENST00000396777 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.58■■■■□ 3.77
ARFIP2-202ENST00000396777 NCAPD3P42695 1498 aa38.44■■■■□ 3.74
ARFIP2-202ENST00000396777 HMGXB3Q12766 1538 aa38.43■■■■□ 3.74
ARFIP2-202ENST00000396777 TRIM41Q8WV44 630 aa38.22■■■■□ 3.71
ARFIP2-202ENST00000396777 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.08■■■■□ 3.69
ARFIP2-202ENST00000396777 ABCC8Q09428 1581 aa37.89■■■■□ 3.66
ARFIP2-202ENST00000396777 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.67■■■■□ 3.62
ARFIP2-202ENST00000396777 CFTRP13569 1480 aa37.66■■■■□ 3.62
ARFIP2-202ENST00000396777 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa37.54■■■■□ 3.6
ARFIP2-202ENST00000396777 PRDM2Q13029 1718 aa37.52■■■■□ 3.6
ARFIP2-202ENST00000396777 SYNJ1O43426 1573 aa37.49■■■■□ 3.59
ARFIP2-202ENST00000396777 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.45■■■■□ 3.59
ARFIP2-202ENST00000396777 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP37.43■■■■□ 3.58
ARFIP2-202ENST00000396777 TOP2BQ02880 1626 aa37.36■■■■□ 3.57
ARFIP2-202ENST00000396777 EEA1Q15075 1411 aa37.33■■■■□ 3.57
ARFIP2-202ENST00000396777 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.33■■■■□ 3.57
ARFIP2-202ENST00000396777 SOGA1O94964 1423 aa37.24■■■■□ 3.55
ARFIP2-202ENST00000396777 CUX1P39880 1505 aa37.16■■■■□ 3.54
ARFIP2-202ENST00000396777 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.1■■■■□ 3.53
ARFIP2-202ENST00000396777 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.07■■■■□ 3.53
ARFIP2-202ENST00000396777 CSRNP3Q8WYN3 585 aa37.03■■■■□ 3.52
ARFIP2-202ENST00000396777 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.03■■■■□ 3.52
ARFIP2-202ENST00000396777 NESP48681 1621 aa36.97■■■■□ 3.51
ARFIP2-202ENST00000396777 DNAJC5BQ9UF47 199 aa36.94■■■■□ 3.5
ARFIP2-202ENST00000396777 EHMT2Q96KQ7 1210 aa36.83■■■■□ 3.49
ARFIP2-202ENST00000396777 KIF21BO75037 1637 aa36.81■■■■□ 3.48
ARFIP2-202ENST00000396777 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.79■■■■□ 3.48
ARFIP2-202ENST00000396777 GOLGA3Q08378 1498 aa36.77■■■■□ 3.48
ARFIP2-202ENST00000396777 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.77■■■■□ 3.48
ARFIP2-202ENST00000396777 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.77■■■■□ 3.48
ARFIP2-202ENST00000396777 TNIKQ9UKE5 1360 aa36.72■■■■□ 3.47
ARFIP2-202ENST00000396777 KIF27Q86VH2 1401 aa36.71■■■■□ 3.47
ARFIP2-202ENST00000396777 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.7■■■■□ 3.47
ARFIP2-202ENST00000396777 TOPBP1Q92547 1522 aa36.66■■■■□ 3.46
ARFIP2-202ENST00000396777 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.57■■■■□ 3.45
ARFIP2-202ENST00000396777 PRXQ9BXM0 1461 aa36.54■■■■□ 3.44
ARFIP2-202ENST00000396777 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.54■■■■□ 3.44
ARFIP2-202ENST00000396777 UBTFP17480 764 aaKnown RBP36.54■■■■□ 3.44
ARFIP2-202ENST00000396777 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.53■■■■□ 3.44
ARFIP2-202ENST00000396777 CEP162Q5TB80 1403 aa36.52■■■■□ 3.44
ARFIP2-202ENST00000396777 CUX2O14529 1486 aa36.51■■■■□ 3.43
ARFIP2-202ENST00000396777 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.51■■■■□ 3.43
ARFIP2-202ENST00000396777 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa36.5■■■■□ 3.43
ARFIP2-202ENST00000396777 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.43■■■■□ 3.42
ARFIP2-202ENST00000396777 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.34■■■■□ 3.41
ARFIP2-202ENST00000396777 IGF1RP08069 1367 aa36.34■■■■□ 3.41
ARFIP2-202ENST00000396777 WDR97A6NE52 1622 aa36.29■■■■□ 3.4
ARFIP2-202ENST00000396777 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.27■■■■□ 3.4
ARFIP2-202ENST00000396777 CLIP1P30622 1438 aa36.17■■■■□ 3.38
ARFIP2-202ENST00000396777 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.16■■■■□ 3.38
ARFIP2-202ENST00000396777 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP36.12■■■■□ 3.37
ARFIP2-202ENST00000396777 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.12■■■■□ 3.37
ARFIP2-202ENST00000396777 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.11■■■■□ 3.37
ARFIP2-202ENST00000396777 PCGF6Q9BYE7 350 aa36.11■■■■□ 3.37
ARFIP2-202ENST00000396777 WDR62O43379 1518 aa36.1■■■■□ 3.37
ARFIP2-202ENST00000396777 CUL7Q14999 1698 aa36.08■■■■□ 3.37
ARFIP2-202ENST00000396777 ERCC6Q03468 1493 aa36.01■■■■□ 3.35
ARFIP2-202ENST00000396777 GAPVD1Q14C86 1478 aa36■■■■□ 3.35
ARFIP2-202ENST00000396777 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.96■■■■□ 3.35
ARFIP2-202ENST00000396777 VPS8Q8N3P4 1428 aa35.92■■■■□ 3.34
ARFIP2-202ENST00000396777 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.91■■■■□ 3.34
ARFIP2-202ENST00000396777 IFT140Q96RY7 1462 aa35.89■■■■□ 3.34
ARFIP2-202ENST00000396777 ARAP1Q96P48 1450 aa35.79■■■■□ 3.32
ARFIP2-202ENST00000396777 PBRM1Q86U86 1689 aa35.78■■■■□ 3.32
ARFIP2-202ENST00000396777 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP35.75■■■■□ 3.31
ARFIP2-202ENST00000396777 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa35.74■■■■□ 3.31
ARFIP2-202ENST00000396777 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa35.7■■■■□ 3.31
ARFIP2-202ENST00000396777 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.7■■■■□ 3.318e-7■■■■□ 21.3
ARFIP2-202ENST00000396777 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP35.68■■■■□ 3.3
ARFIP2-202ENST00000396777 GRIN2BQ13224 1484 aa35.68■■■■□ 3.3
ARFIP2-202ENST00000396777 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.63■■■■□ 3.29
ARFIP2-202ENST00000396777 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.62■■■■□ 3.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.7 ms