RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297533.8

TMUB1-201, Transcript of transmembrane and ubiquitin like domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMUB1, Length 1,353 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB1-201ENST00000297533 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.25■■■■■ 6.75
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TMUB1-201ENST00000297533 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.46■■■■■ 5.35
TMUB1-201ENST00000297533 NACADO15069 1562 aa48.27■■■■■ 5.32
TMUB1-201ENST00000297533 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48■■■■■ 5.28
TMUB1-201ENST00000297533 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.81■■■■■ 5.24
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TMUB1-201ENST00000297533 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.42■■■■■ 5.18
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TMUB1-201ENST00000297533 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.51■■■■■ 5.04
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TMUB1-201ENST00000297533 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.52■■■■■ 4.88
TMUB1-201ENST00000297533 SMARCA4P51532 1647 aa44.58■■■■■ 4.73
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TMUB1-201ENST00000297533 SMARCA2P51531 1590 aa44.41■■■■■ 4.7
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TMUB1-201ENST00000297533 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.21■■■■■ 4.67
TMUB1-201ENST00000297533 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.09■■■■■ 4.65
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TMUB1-201ENST00000297533 NESP48681 1621 aa43.57■■■■■ 4.56
TMUB1-201ENST00000297533 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.46■■■■■ 4.55
TMUB1-201ENST00000297533 CUX2O14529 1486 aa43.43■■■■■ 4.54
TMUB1-201ENST00000297533 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.37■■■■■ 4.53
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TMUB1-201ENST00000297533 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.76■■■■■ 4.44
TMUB1-201ENST00000297533 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.71■■■■■ 4.43
TMUB1-201ENST00000297533 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.69■■■■■ 4.42
TMUB1-201ENST00000297533 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.68■■■■■ 4.42
TMUB1-201ENST00000297533 WDR62O43379 1518 aa42.64■■■■■ 4.42
TMUB1-201ENST00000297533 PRDM2Q13029 1718 aa42.63■■■■■ 4.41
TMUB1-201ENST00000297533 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.58■■■■■ 4.41
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TMUB1-201ENST00000297533 TOPBP1Q92547 1522 aa41.94■■■■■ 4.3
TMUB1-201ENST00000297533 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.87■■■■■ 4.29
TMUB1-201ENST00000297533 IFT140Q96RY7 1462 aa41.83■■■■■ 4.29
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TMUB1-201ENST00000297533 SOGA1O94964 1423 aa41.36■■■■■ 4.21
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TMUB1-201ENST00000297533 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.03■■■■■ 4.16
TMUB1-201ENST00000297533 TRIM41Q8WV44 630 aa41.02■■■■■ 4.16
TMUB1-201ENST00000297533 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.97■■■■■ 4.15
TMUB1-201ENST00000297533 GRIN2BQ13224 1484 aa40.97■■■■■ 4.15
TMUB1-201ENST00000297533 TOP2BQ02880 1626 aa40.96■■■■■ 4.15
TMUB1-201ENST00000297533 FBLN2P98095 1184 aa40.96■■■■■ 4.15
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TMUB1-201ENST00000297533 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.95■■■■■ 4.15
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TMUB1-201ENST00000297533 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.91■■■■■ 4.14
TMUB1-201ENST00000297533 PBRM1Q86U86 1689 aa40.9■■■■■ 4.14
TMUB1-201ENST00000297533 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.9■■■■■ 4.14
TMUB1-201ENST00000297533 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.9■■■■■ 4.14
TMUB1-201ENST00000297533 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.9■■■■■ 4.14
TMUB1-201ENST00000297533 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.89■■■■■ 4.14
TMUB1-201ENST00000297533 ARHGEF11O15085 1522 aa40.83■■■■■ 4.13
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TMUB1-201ENST00000297533 SYNJ2O15056 1496 aa40.77■■■■■ 4.12
TMUB1-201ENST00000297533 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.64■■■■■ 4.1
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TMUB1-201ENST00000297533 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.47■■■■■ 4.07
TMUB1-201ENST00000297533 ARAP1Q96P48 1450 aa40.45■■■■■ 4.07
TMUB1-201ENST00000297533 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.44■■■■■ 4.06
TMUB1-201ENST00000297533 GRIN2AQ12879 1464 aa40.44■■■■■ 4.06
TMUB1-201ENST00000297533 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.4■■■■■ 4.06
TMUB1-201ENST00000297533 NUP160Q12769 1436 aa40.27■■■■■ 4.04
TMUB1-201ENST00000297533 CEP170Q5SW79 1584 aa40.25■■■■■ 4.03
TMUB1-201ENST00000297533 KIF27Q86VH2 1401 aa40.15■■■■■ 4.02
TMUB1-201ENST00000297533 SHROOM2Q13796 1616 aa40.1■■■■■ 4.01
TMUB1-201ENST00000297533 CUL7Q14999 1698 aa40.02■■■■■ 4
TMUB1-201ENST00000297533 IGF1RP08069 1367 aa40■■■■□ 3.99
TMUB1-201ENST00000297533 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.99■■■■□ 3.99
TMUB1-201ENST00000297533 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.96■■■■□ 3.99
TMUB1-201ENST00000297533 TRHP20396 242 aaPredicted RBP39.84■■■■□ 3.97
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