RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540080.5

CLTA-210, Transcript of clathrin light chain A, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CLTA, Length 989 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTA-210ENST00000540080 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.85■■■■■ 6.53
CLTA-210ENST00000540080 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.56■■■■■ 5.52
CLTA-210ENST00000540080 ABCC9O60706 1549 aa48.66■■■■■ 5.38
CLTA-210ENST00000540080 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.87■■■■■ 5.09
CLTA-210ENST00000540080 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.71■■■■■ 5.07
CLTA-210ENST00000540080 NACADO15069 1562 aa46.64■■■■■ 5.06
CLTA-210ENST00000540080 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.5■■■■■ 5.03
CLTA-210ENST00000540080 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.31■■■■■ 5
CLTA-210ENST00000540080 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.13■■■■■ 4.98
CLTA-210ENST00000540080 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.63■■■■■ 4.89
CLTA-210ENST00000540080 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.54■■■■■ 4.88
CLTA-210ENST00000540080 SCRIBQ14160 1630 aa45.34■■■■■ 4.85
CLTA-210ENST00000540080 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.3■■■■■ 4.84
CLTA-210ENST00000540080 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.72■■■■■ 4.75
CLTA-210ENST00000540080 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.7■■■■■ 4.75
CLTA-210ENST00000540080 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.11■■■■■ 4.65
CLTA-210ENST00000540080 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.95■■■■■ 4.63
CLTA-210ENST00000540080 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.69■■■■■ 4.58
CLTA-210ENST00000540080 SMARCA4P51532 1647 aa43.32■■■■■ 4.53
CLTA-210ENST00000540080 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.27■■■■■ 4.52
CLTA-210ENST00000540080 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.12■■■■■ 4.49
CLTA-210ENST00000540080 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.07■■■■■ 4.49
CLTA-210ENST00000540080 NCAPD3P42695 1498 aa43.06■■■■■ 4.48
CLTA-210ENST00000540080 SMARCA2P51531 1590 aa43.02■■■■■ 4.48
CLTA-210ENST00000540080 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.85■■■■■ 4.45
CLTA-210ENST00000540080 HMGXB3Q12766 1538 aa42.81■■■■■ 4.44
CLTA-210ENST00000540080 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.76■■■■■ 4.44
CLTA-210ENST00000540080 WIZO95785 1651 aa42.61■■■■■ 4.41
CLTA-210ENST00000540080 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.59■■■■■ 4.41
CLTA-210ENST00000540080 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.11■■■■■ 4.33
CLTA-210ENST00000540080 NESP48681 1621 aa42.1■■■■■ 4.33
CLTA-210ENST00000540080 ERCC6Q03468 1493 aa41.92■■■■■ 4.3
CLTA-210ENST00000540080 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.9■■■■■ 4.3
CLTA-210ENST00000540080 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.85■■■■■ 4.29
CLTA-210ENST00000540080 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.68■■■■■ 4.26
CLTA-210ENST00000540080 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.68■■■■■ 4.26
CLTA-210ENST00000540080 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.65■■■■■ 4.26
CLTA-210ENST00000540080 CFTRP13569 1480 aa41.57■■■■■ 4.25
CLTA-210ENST00000540080 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.54■■■■■ 4.24
CLTA-210ENST00000540080 CUX2O14529 1486 aa41.4■■■■■ 4.22
CLTA-210ENST00000540080 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.37■■■■■ 4.21
CLTA-210ENST00000540080 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.37■■■■■ 4.21
CLTA-210ENST00000540080 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.3■■■■■ 4.2
CLTA-210ENST00000540080 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.24■■■■■ 4.19
CLTA-210ENST00000540080 PRDM2Q13029 1718 aa41.17■■■■■ 4.18
CLTA-210ENST00000540080 WDR62O43379 1518 aa41.07■■■■■ 4.16
CLTA-210ENST00000540080 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.95■■■■■ 4.15
CLTA-210ENST00000540080 TOPBP1Q92547 1522 aa40.7■■■■■ 4.11
CLTA-210ENST00000540080 ABCC8Q09428 1581 aa40.65■■■■■ 4.1
CLTA-210ENST00000540080 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.62■■■■■ 4.09
CLTA-210ENST00000540080 IFT140Q96RY7 1462 aa40.42■■■■■ 4.06
CLTA-210ENST00000540080 CUX1P39880 1505 aa40.4■■■■■ 4.06
CLTA-210ENST00000540080 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.35■■■■■ 4.05
CLTA-210ENST00000540080 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.29■■■■■ 4.04
CLTA-210ENST00000540080 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.27■■■■■ 4.04
CLTA-210ENST00000540080 SOGA1O94964 1423 aa40.24■■■■■ 4.03
CLTA-210ENST00000540080 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.23■■■■■ 4.03
CLTA-210ENST00000540080 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.22■■■■■ 4.03
CLTA-210ENST00000540080 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.21■■■■■ 4.03
CLTA-210ENST00000540080 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.16■■■■■ 4.02
CLTA-210ENST00000540080 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.09■■■■■ 4.01
CLTA-210ENST00000540080 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.07■■■■■ 4.01
CLTA-210ENST00000540080 SYNJ1O43426 1573 aa40.04■■■■■ 4
CLTA-210ENST00000540080 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.03■■■■■ 4
CLTA-210ENST00000540080 TOP2BQ02880 1626 aa40.02■■■■■ 4
CLTA-210ENST00000540080 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.99■■■■□ 3.99
CLTA-210ENST00000540080 WDR97A6NE52 1622 aa39.85■■■■□ 3.97
CLTA-210ENST00000540080 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.84■■■■□ 3.97
CLTA-210ENST00000540080 OSCARQ8IYS5 282 aa39.79■■■■□ 3.96
CLTA-210ENST00000540080 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.74■■■■□ 3.95
CLTA-210ENST00000540080 GRIN2BQ13224 1484 aa39.72■■■■□ 3.95
CLTA-210ENST00000540080 FBLN2P98095 1184 aa39.68■■■■□ 3.94
CLTA-210ENST00000540080 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.68■■■■□ 3.94
CLTA-210ENST00000540080 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.66■■■■□ 3.94
CLTA-210ENST00000540080 PBRM1Q86U86 1689 aa39.6■■■■□ 3.93
CLTA-210ENST00000540080 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.58■■■■□ 3.93
CLTA-210ENST00000540080 CHD1O14646 1710 aa39.57■■■■□ 3.93
CLTA-210ENST00000540080 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.53■■■■□ 3.92
CLTA-210ENST00000540080 SYNJ2O15056 1496 aa39.45■■■■□ 3.91
CLTA-210ENST00000540080 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.35■■■■□ 3.89
CLTA-210ENST00000540080 KIF27Q86VH2 1401 aa39.31■■■■□ 3.88
CLTA-210ENST00000540080 TRIM41Q8WV44 630 aa39.3■■■■□ 3.88
CLTA-210ENST00000540080 ADAMTS12P58397 1594 aa39.29■■■■□ 3.88
CLTA-210ENST00000540080 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.26■■■■□ 3.88
CLTA-210ENST00000540080 GRIN2AQ12879 1464 aa39.2■■■■□ 3.87
CLTA-210ENST00000540080 IGF1RP08069 1367 aa39.18■■■■□ 3.86
CLTA-210ENST00000540080 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.13■■■■□ 3.85
CLTA-210ENST00000540080 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.08■■■■□ 3.85
CLTA-210ENST00000540080 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.08■■■■□ 3.85
CLTA-210ENST00000540080 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.08■■■■□ 3.85
CLTA-210ENST00000540080 ARHGEF11O15085 1522 aa39.08■■■■□ 3.85
CLTA-210ENST00000540080 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.02■■■■□ 3.84
CLTA-210ENST00000540080 CEP170Q5SW79 1584 aa39.01■■■■□ 3.84
CLTA-210ENST00000540080 NUP160Q12769 1436 aa39.01■■■■□ 3.84
CLTA-210ENST00000540080 CUL7Q14999 1698 aa38.99■■■■□ 3.83
CLTA-210ENST00000540080 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.95■■■■□ 3.83
CLTA-210ENST00000540080 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.83■■■■□ 3.81
CLTA-210ENST00000540080 CHIC1Q5VXU3 224 aa38.82■■■■□ 3.8
CLTA-210ENST00000540080 ARAP1Q96P48 1450 aa38.78■■■■□ 3.8
CLTA-210ENST00000540080 JPH4Q96JJ6 628 aa38.7■■■■□ 3.79
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