RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608262.2

AC092028.1-203, humanhuman

BASIC

Gene AC092028.1, Length 953 nt, Biotype transcribed unprocessed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC092028.1-203ENST00000608262 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.66■■■■■ 6.66
AC092028.1-203ENST00000608262 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.46■■■■■ 5.67
AC092028.1-203ENST00000608262 ABCC9O60706 1549 aa49.7■■■■■ 5.55
AC092028.1-203ENST00000608262 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.68■■■■■ 5.22
AC092028.1-203ENST00000608262 NACADO15069 1562 aa47.56■■■■■ 5.2
AC092028.1-203ENST00000608262 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.54■■■■■ 5.2
AC092028.1-203ENST00000608262 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.18■■■■■ 5.14
AC092028.1-203ENST00000608262 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.11■■■■■ 5.13
AC092028.1-203ENST00000608262 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.86■■■■■ 5.09
AC092028.1-203ENST00000608262 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.55■■■■■ 5.04
AC092028.1-203ENST00000608262 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.44■■■■■ 5.02
AC092028.1-203ENST00000608262 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.23■■■■■ 4.99
AC092028.1-203ENST00000608262 SCRIBQ14160 1630 aa46.02■■■■■ 4.96
AC092028.1-203ENST00000608262 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.95■■■■■ 4.95
AC092028.1-203ENST00000608262 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.73■■■■■ 4.91
AC092028.1-203ENST00000608262 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.03■■■■■ 4.8
AC092028.1-203ENST00000608262 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.93■■■■■ 4.78
AC092028.1-203ENST00000608262 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.71■■■■■ 4.75
AC092028.1-203ENST00000608262 SMARCA4P51532 1647 aa44■■■■■ 4.63
AC092028.1-203ENST00000608262 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.92■■■■■ 4.62
AC092028.1-203ENST00000608262 NCAPD3P42695 1498 aa43.91■■■■■ 4.62
AC092028.1-203ENST00000608262 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.87■■■■■ 4.61
AC092028.1-203ENST00000608262 SMARCA2P51531 1590 aa43.8■■■■■ 4.6
AC092028.1-203ENST00000608262 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.65■■■■■ 4.58
AC092028.1-203ENST00000608262 HMGXB3Q12766 1538 aa43.62■■■■■ 4.57
AC092028.1-203ENST00000608262 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.59■■■■■ 4.57
AC092028.1-203ENST00000608262 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.48■■■■■ 4.55
AC092028.1-203ENST00000608262 WIZO95785 1651 aa43.16■■■■■ 4.5
AC092028.1-203ENST00000608262 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.06■■■■■ 4.48
AC092028.1-203ENST00000608262 NESP48681 1621 aa42.92■■■■■ 4.46
AC092028.1-203ENST00000608262 ERCC6Q03468 1493 aa42.87■■■■■ 4.45
AC092028.1-203ENST00000608262 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.77■■■■■ 4.44
AC092028.1-203ENST00000608262 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.68■■■■■ 4.42
AC092028.1-203ENST00000608262 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.62■■■■■ 4.41
AC092028.1-203ENST00000608262 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.53■■■■■ 4.4
AC092028.1-203ENST00000608262 CUX2O14529 1486 aa42.52■■■■■ 4.4
AC092028.1-203ENST00000608262 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.37■■■■■ 4.37
AC092028.1-203ENST00000608262 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.3■■■■■ 4.36
AC092028.1-203ENST00000608262 CFTRP13569 1480 aa42.29■■■■■ 4.36
AC092028.1-203ENST00000608262 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.22■■■■■ 4.35
AC092028.1-203ENST00000608262 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.11■■■■■ 4.33
AC092028.1-203ENST00000608262 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.07■■■■■ 4.33
AC092028.1-203ENST00000608262 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.07■■■■■ 4.33
AC092028.1-203ENST00000608262 WDR62O43379 1518 aa41.93■■■■■ 4.3
AC092028.1-203ENST00000608262 PRDM2Q13029 1718 aa41.88■■■■■ 4.29
AC092028.1-203ENST00000608262 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.79■■■■■ 4.28
AC092028.1-203ENST00000608262 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.69■■■■■ 4.27
AC092028.1-203ENST00000608262 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.64■■■■■ 4.26
AC092028.1-203ENST00000608262 ABCC8Q09428 1581 aa41.41■■■■■ 4.22
AC092028.1-203ENST00000608262 TOPBP1Q92547 1522 aa41.39■■■■■ 4.22
AC092028.1-203ENST00000608262 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.3■■■■■ 4.2
AC092028.1-203ENST00000608262 IFT140Q96RY7 1462 aa41.21■■■■■ 4.19
AC092028.1-203ENST00000608262 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.04■■■■■ 4.16
AC092028.1-203ENST00000608262 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.02■■■■■ 4.16
AC092028.1-203ENST00000608262 CUX1P39880 1505 aa40.96■■■■■ 4.15
AC092028.1-203ENST00000608262 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.95■■■■■ 4.15
AC092028.1-203ENST00000608262 SOGA1O94964 1423 aa40.89■■■■■ 4.14
AC092028.1-203ENST00000608262 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.88■■■■■ 4.13
AC092028.1-203ENST00000608262 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.86■■■■■ 4.13
AC092028.1-203ENST00000608262 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.83■■■■■ 4.13
AC092028.1-203ENST00000608262 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.8■■■■■ 4.12
AC092028.1-203ENST00000608262 OSCARQ8IYS5 282 aa40.78■■■■■ 4.12
AC092028.1-203ENST00000608262 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.69■■■■■ 4.1
AC092028.1-203ENST00000608262 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.61■■■■■ 4.09
AC092028.1-203ENST00000608262 WDR97A6NE52 1622 aa40.61■■■■■ 4.09
AC092028.1-203ENST00000608262 TOP2BQ02880 1626 aa40.53■■■■■ 4.08
AC092028.1-203ENST00000608262 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.51■■■■■ 4.08
AC092028.1-203ENST00000608262 SYNJ1O43426 1573 aa40.49■■■■■ 4.07
AC092028.1-203ENST00000608262 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.47■■■■■ 4.07
AC092028.1-203ENST00000608262 GRIN2BQ13224 1484 aa40.42■■■■■ 4.06
AC092028.1-203ENST00000608262 FBLN2P98095 1184 aa40.41■■■■■ 4.06
AC092028.1-203ENST00000608262 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.39■■■■■ 4.06
AC092028.1-203ENST00000608262 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.39■■■■■ 4.06
AC092028.1-203ENST00000608262 CHD1O14646 1710 aa40.38■■■■■ 4.05
AC092028.1-203ENST00000608262 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.33■■■■■ 4.05
AC092028.1-203ENST00000608262 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.31■■■■■ 4.04
AC092028.1-203ENST00000608262 PBRM1Q86U86 1689 aa40.27■■■■■ 4.04
AC092028.1-203ENST00000608262 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.26■■■■■ 4.04
AC092028.1-203ENST00000608262 SYNJ2O15056 1496 aa40.19■■■■■ 4.03
AC092028.1-203ENST00000608262 TRIM41Q8WV44 630 aa40.12■■■■■ 4.01
AC092028.1-203ENST00000608262 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.07■■■■■ 4.01
AC092028.1-203ENST00000608262 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.07■■■■■ 4.01
AC092028.1-203ENST00000608262 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.07■■■■■ 4.01
AC092028.1-203ENST00000608262 ARHGEF11O15085 1522 aa40.04■■■■■ 4
AC092028.1-203ENST00000608262 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.98■■■■□ 3.99
AC092028.1-203ENST00000608262 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.96■■■■□ 3.99
AC092028.1-203ENST00000608262 ADAMTS12P58397 1594 aa39.93■■■■□ 3.98
AC092028.1-203ENST00000608262 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.91■■■■□ 3.98
AC092028.1-203ENST00000608262 GRIN2AQ12879 1464 aa39.89■■■■□ 3.98
AC092028.1-203ENST00000608262 KIF27Q86VH2 1401 aa39.8■■■■□ 3.96
AC092028.1-203ENST00000608262 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.76■■■■□ 3.96
AC092028.1-203ENST00000608262 NUP160Q12769 1436 aa39.73■■■■□ 3.95
AC092028.1-203ENST00000608262 IGF1RP08069 1367 aa39.7■■■■□ 3.95
AC092028.1-203ENST00000608262 ARAP1Q96P48 1450 aa39.69■■■■□ 3.94
AC092028.1-203ENST00000608262 CEP170Q5SW79 1584 aa39.68■■■■□ 3.94
AC092028.1-203ENST00000608262 CUL7Q14999 1698 aa39.54■■■■□ 3.92
AC092028.1-203ENST00000608262 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.45■■■■□ 3.91
AC092028.1-203ENST00000608262 SHROOM2Q13796 1616 aa39.44■■■■□ 3.9
AC092028.1-203ENST00000608262 JPH4Q96JJ6 628 aa39.39■■■■□ 3.9
AC092028.1-203ENST00000608262 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.38■■■■□ 3.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 81.3 ms