Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RBM42Q9BTD8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RBM42Q9BTD8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RBM42Q9BTD8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.1■■■□□ 2.41
RBM42Q9BTD8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
RBM42Q9BTD8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RBM42Q9BTD8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RBM42Q9BTD8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RBM42Q9BTD8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
RBM42Q9BTD8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
RBM42Q9BTD8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
RBM42Q9BTD8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
RBM42Q9BTD8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RBM42Q9BTD8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RBM42Q9BTD8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RBM42Q9BTD8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RBM42Q9BTD8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RBM42Q9BTD8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RBM42Q9BTD8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RBM42Q9BTD8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RBM42Q9BTD8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RBM42Q9BTD8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RBM42Q9BTD8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.41
RBM42Q9BTD8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RBM42Q9BTD8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RBM42Q9BTD8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RBM42Q9BTD8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RBM42Q9BTD8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
RBM42Q9BTD8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RBM42Q9BTD8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
RBM42Q9BTD8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
RBM42Q9BTD8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RBM42Q9BTD8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RBM42Q9BTD8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RBM42Q9BTD8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
RBM42Q9BTD8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RBM42Q9BTD8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RBM42Q9BTD8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
RBM42Q9BTD8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RBM42Q9BTD8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RBM42Q9BTD8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
RBM42Q9BTD8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RBM42Q9BTD8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RBM42Q9BTD8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RBM42Q9BTD8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RBM42Q9BTD8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RBM42Q9BTD8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RBM42Q9BTD8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RBM42Q9BTD8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RBM42Q9BTD8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RBM42Q9BTD8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
RBM42Q9BTD8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RBM42Q9BTD8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RBM42Q9BTD8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RBM42Q9BTD8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RBM42Q9BTD8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RBM42Q9BTD8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RBM42Q9BTD8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RBM42Q9BTD8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RBM42Q9BTD8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RBM42Q9BTD8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RBM42Q9BTD8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RBM42Q9BTD8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RBM42Q9BTD8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RBM42Q9BTD8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RBM42Q9BTD8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
RBM42Q9BTD8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
RBM42Q9BTD8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RBM42Q9BTD8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RBM42Q9BTD8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
RBM42Q9BTD8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RBM42Q9BTD8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
RBM42Q9BTD8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
RBM42Q9BTD8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RBM42Q9BTD8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RBM42Q9BTD8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RBM42Q9BTD8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
RBM42Q9BTD8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RBM42Q9BTD8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RBM42Q9BTD8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RBM42Q9BTD8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RBM42Q9BTD8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RBM42Q9BTD8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
RBM42Q9BTD8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RBM42Q9BTD8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RBM42Q9BTD8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RBM42Q9BTD8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RBM42Q9BTD8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
RBM42Q9BTD8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RBM42Q9BTD8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
RBM42Q9BTD8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RBM42Q9BTD8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RBM42Q9BTD8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RBM42Q9BTD8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RBM42Q9BTD8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RBM42Q9BTD8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RBM42Q9BTD8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
RBM42Q9BTD8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RBM42Q9BTD8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
RBM42Q9BTD8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms