RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447676.6

PNCK-215, Transcript of pregnancy up-regulated nonubiquitous CaM kinase, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PNCK, Length 1,585 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNCK-215ENST00000447676 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.08■■■■■ 6.41
PNCK-215ENST00000447676 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa48.7■■■■■ 5.39
PNCK-215ENST00000447676 ABCC9O60706 1549 aa47.08■■■■■ 5.13
PNCK-215ENST00000447676 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.04■■■■■ 4.96
PNCK-215ENST00000447676 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.73■■■■■ 4.91
PNCK-215ENST00000447676 NACADO15069 1562 aa45.56■■■■■ 4.88
PNCK-215ENST00000447676 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.53■■■■■ 4.88
PNCK-215ENST00000447676 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.48■■■■■ 4.87
PNCK-215ENST00000447676 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.45■■■■■ 4.87
PNCK-215ENST00000447676 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.67■■■■■ 4.74
PNCK-215ENST00000447676 SCRIBQ14160 1630 aa44.58■■■■■ 4.73
PNCK-215ENST00000447676 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.21■■■■■ 4.67
PNCK-215ENST00000447676 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.08■■■■■ 4.651e-6■■■■□ 19.8
PNCK-215ENST00000447676 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44■■■■■ 4.63
PNCK-215ENST00000447676 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.94■■■■■ 4.46
PNCK-215ENST00000447676 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.92■■■■■ 4.46
PNCK-215ENST00000447676 SMARCA4P51532 1647 aa42.65■■■■■ 4.42
PNCK-215ENST00000447676 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.64■■■■■ 4.42
PNCK-215ENST00000447676 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.62■■■■■ 4.41
PNCK-215ENST00000447676 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.62■■■■■ 4.41
PNCK-215ENST00000447676 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.53■■■■■ 4.4
PNCK-215ENST00000447676 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.21■■■■■ 4.35
PNCK-215ENST00000447676 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.2■■■■■ 4.35
PNCK-215ENST00000447676 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.17■■■■■ 4.34
PNCK-215ENST00000447676 WIZO95785 1651 aa42.16■■■■■ 4.34
PNCK-215ENST00000447676 SMARCA2P51531 1590 aa42.14■■■■■ 4.34
PNCK-215ENST00000447676 NCAPD3P42695 1498 aa42.03■■■■■ 4.32
PNCK-215ENST00000447676 HMGXB3Q12766 1538 aa41.92■■■■■ 4.3
PNCK-215ENST00000447676 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.88■■■■■ 4.29
PNCK-215ENST00000447676 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.64■■■■■ 4.26
PNCK-215ENST00000447676 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.63■■■■■ 4.26
PNCK-215ENST00000447676 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.16■■■■■ 4.18
PNCK-215ENST00000447676 NESP48681 1621 aa40.98■■■■■ 4.15
PNCK-215ENST00000447676 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.85■■■■■ 4.13
PNCK-215ENST00000447676 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.83■■■■■ 4.13
PNCK-215ENST00000447676 CFTRP13569 1480 aa40.76■■■■■ 4.12
PNCK-215ENST00000447676 PRDM2Q13029 1718 aa40.63■■■■■ 4.09
PNCK-215ENST00000447676 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.55■■■■■ 4.08
PNCK-215ENST00000447676 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.47■■■■■ 4.07
PNCK-215ENST00000447676 ERCC6Q03468 1493 aa40.45■■■■■ 4.07
PNCK-215ENST00000447676 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.42■■■■■ 4.06
PNCK-215ENST00000447676 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.3■■■■■ 4.04
PNCK-215ENST00000447676 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.21■■■■■ 4.03
PNCK-215ENST00000447676 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.1■■■■■ 4.01
PNCK-215ENST00000447676 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.03■■■■■ 4
PNCK-215ENST00000447676 WDR62O43379 1518 aa39.98■■■■□ 3.99
PNCK-215ENST00000447676 ABCC8Q09428 1581 aa39.96■■■■□ 3.99
PNCK-215ENST00000447676 TOPBP1Q92547 1522 aa39.87■■■■□ 3.97
PNCK-215ENST00000447676 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.87■■■■□ 3.97
PNCK-215ENST00000447676 CUX1P39880 1505 aa39.85■■■■□ 3.97
PNCK-215ENST00000447676 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.76■■■■□ 3.96
PNCK-215ENST00000447676 CUX2O14529 1486 aa39.75■■■■□ 3.95
PNCK-215ENST00000447676 SYNJ1O43426 1573 aa39.75■■■■□ 3.95
PNCK-215ENST00000447676 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.67■■■■□ 3.94
PNCK-215ENST00000447676 TOP2BQ02880 1626 aa39.65■■■■□ 3.94
PNCK-215ENST00000447676 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.59■■■■□ 3.93
PNCK-215ENST00000447676 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.58■■■■□ 3.93
PNCK-215ENST00000447676 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.44■■■■□ 3.9
PNCK-215ENST00000447676 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.43■■■■□ 3.9
PNCK-215ENST00000447676 IFT140Q96RY7 1462 aa39.39■■■■□ 3.9
PNCK-215ENST00000447676 SOGA1O94964 1423 aa39.37■■■■□ 3.89
PNCK-215ENST00000447676 WDR97A6NE52 1622 aa39.31■■■■□ 3.88
PNCK-215ENST00000447676 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.28■■■■□ 3.88
PNCK-215ENST00000447676 CHIC1Q5VXU3 224 aa39.21■■■■□ 3.87
PNCK-215ENST00000447676 TRIM41Q8WV44 630 aa39.21■■■■□ 3.87
PNCK-215ENST00000447676 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.19■■■■□ 3.86
PNCK-215ENST00000447676 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.17■■■■□ 3.86
PNCK-215ENST00000447676 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.12■■■■□ 3.85
PNCK-215ENST00000447676 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.1■■■■□ 3.854e-8■■■■■ 27.4
PNCK-215ENST00000447676 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.06■■■■□ 3.84
PNCK-215ENST00000447676 PBRM1Q86U86 1689 aa38.95■■■■□ 3.83
PNCK-215ENST00000447676 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.94■■■■□ 3.82
PNCK-215ENST00000447676 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.86■■■■□ 3.81
PNCK-215ENST00000447676 KIF27Q86VH2 1401 aa38.82■■■■□ 3.81
PNCK-215ENST00000447676 GRIN2BQ13224 1484 aa38.82■■■■□ 3.81
PNCK-215ENST00000447676 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.76■■■■□ 3.8
PNCK-215ENST00000447676 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.71■■■■□ 3.79
PNCK-215ENST00000447676 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.65■■■■□ 3.78
PNCK-215ENST00000447676 ADAMTS12P58397 1594 aa38.63■■■■□ 3.77
PNCK-215ENST00000447676 IGF1RP08069 1367 aa38.62■■■■□ 3.77
PNCK-215ENST00000447676 CHD1O14646 1710 aa38.59■■■■□ 3.77
PNCK-215ENST00000447676 CUL7Q14999 1698 aa38.53■■■■□ 3.76
PNCK-215ENST00000447676 SYNJ2O15056 1496 aa38.51■■■■□ 3.75
PNCK-215ENST00000447676 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP38.5■■■■□ 3.75
PNCK-215ENST00000447676 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.48■■■■□ 3.75
PNCK-215ENST00000447676 EEA1Q15075 1411 aa38.46■■■■□ 3.75
PNCK-215ENST00000447676 FBLN2P98095 1184 aa38.44■■■■□ 3.74
PNCK-215ENST00000447676 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.4■■■■□ 3.74
PNCK-215ENST00000447676 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.38■■■■□ 3.73
PNCK-215ENST00000447676 GRIN2AQ12879 1464 aa38.37■■■■□ 3.73
PNCK-215ENST00000447676 CSRNP3Q8WYN3 585 aa38.36■■■■□ 3.73
PNCK-215ENST00000447676 PRXQ9BXM0 1461 aa38.3■■■■□ 3.72
PNCK-215ENST00000447676 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa38.25■■■■□ 3.71
PNCK-215ENST00000447676 CEP170Q5SW79 1584 aa38.23■■■■□ 3.71
PNCK-215ENST00000447676 OSCARQ8IYS5 282 aa38.17■■■■□ 3.7
PNCK-215ENST00000447676 NUP160Q12769 1436 aa38.16■■■■□ 3.7
PNCK-215ENST00000447676 KIF21BO75037 1637 aa38.15■■■■□ 3.7
PNCK-215ENST00000447676 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.1■■■■□ 3.69
PNCK-215ENST00000447676 EHMT2Q96KQ7 1210 aa38.02■■■■□ 3.68
PNCK-215ENST00000447676 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa37.98■■■■□ 3.67
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