RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412227.6

CROT-202, Transcript of carnitine O-octanoyltransferase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CROT, Length 1,213 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROT-202ENST00000412227 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.89■■■■■ 6.38
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CROT-202ENST00000412227 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.85■■■■■ 5.09
CROT-202ENST00000412227 NACADO15069 1562 aa46.52■■■■■ 5.04
CROT-202ENST00000412227 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.38■■■■■ 5.02
CROT-202ENST00000412227 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.02■■■■■ 4.96
CROT-202ENST00000412227 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.87■■■■■ 4.93
CROT-202ENST00000412227 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.86■■■■■ 4.93
CROT-202ENST00000412227 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.79■■■■■ 4.92
CROT-202ENST00000412227 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.49■■■■■ 4.87
CROT-202ENST00000412227 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.45■■■■■ 4.87
CROT-202ENST00000412227 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.33■■■■■ 4.85
CROT-202ENST00000412227 SCRIBQ14160 1630 aa44.89■■■■■ 4.78
CROT-202ENST00000412227 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.82■■■■■ 4.77
CROT-202ENST00000412227 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.42■■■■■ 4.7
CROT-202ENST00000412227 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.34■■■■■ 4.69
CROT-202ENST00000412227 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.27■■■■■ 4.68
CROT-202ENST00000412227 NCAPD3P42695 1498 aa42.93■■■■■ 4.46
CROT-202ENST00000412227 SMARCA4P51532 1647 aa42.82■■■■■ 4.45
CROT-202ENST00000412227 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.81■■■■■ 4.44
CROT-202ENST00000412227 SMARCA2P51531 1590 aa42.73■■■■■ 4.43
CROT-202ENST00000412227 HMGXB3Q12766 1538 aa42.63■■■■■ 4.42
CROT-202ENST00000412227 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.62■■■■■ 4.41
CROT-202ENST00000412227 ERCC6Q03468 1493 aa42.46■■■■■ 4.39
CROT-202ENST00000412227 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.43■■■■■ 4.38
CROT-202ENST00000412227 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.38■■■■■ 4.37
CROT-202ENST00000412227 CUX2O14529 1486 aa42.33■■■■■ 4.37
CROT-202ENST00000412227 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.3■■■■■ 4.36
CROT-202ENST00000412227 NESP48681 1621 aa42.25■■■■■ 4.35
CROT-202ENST00000412227 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.22■■■■■ 4.35
CROT-202ENST00000412227 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.99■■■■■ 4.31
CROT-202ENST00000412227 WIZO95785 1651 aa41.84■■■■■ 4.29
CROT-202ENST00000412227 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.8■■■■■ 4.28
CROT-202ENST00000412227 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.77■■■■■ 4.28
CROT-202ENST00000412227 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.73■■■■■ 4.27
CROT-202ENST00000412227 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.64■■■■■ 4.26
CROT-202ENST00000412227 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.44■■■■■ 4.22
CROT-202ENST00000412227 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.35■■■■■ 4.21
CROT-202ENST00000412227 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.28■■■■■ 4.2
CROT-202ENST00000412227 WDR62O43379 1518 aa41.24■■■■■ 4.19
CROT-202ENST00000412227 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.22■■■■■ 4.19
CROT-202ENST00000412227 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.18■■■■■ 4.18
CROT-202ENST00000412227 CFTRP13569 1480 aa41.17■■■■■ 4.18
CROT-202ENST00000412227 PRDM2Q13029 1718 aa40.88■■■■■ 4.13
CROT-202ENST00000412227 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.83■■■■■ 4.13
CROT-202ENST00000412227 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.81■■■■■ 4.12
CROT-202ENST00000412227 TRIM41Q8WV44 630 aa40.45■■■■■ 4.07
CROT-202ENST00000412227 OSCARQ8IYS5 282 aa40.44■■■■■ 4.06
CROT-202ENST00000412227 TOPBP1Q92547 1522 aa40.41■■■■■ 4.06
CROT-202ENST00000412227 IFT140Q96RY7 1462 aa40.39■■■■■ 4.06
CROT-202ENST00000412227 ABCC8Q09428 1581 aa40.34■■■■■ 4.05
CROT-202ENST00000412227 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.31■■■■■ 4.04
CROT-202ENST00000412227 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.27■■■■■ 4.04
CROT-202ENST00000412227 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.11■■■■■ 4.01
CROT-202ENST00000412227 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.05■■■■■ 4
CROT-202ENST00000412227 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.99■■■■□ 3.99
CROT-202ENST00000412227 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.97■■■■□ 3.99
CROT-202ENST00000412227 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.91■■■■□ 3.98
CROT-202ENST00000412227 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.91■■■■□ 3.98
CROT-202ENST00000412227 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.91■■■■□ 3.98
CROT-202ENST00000412227 CHD1O14646 1710 aa39.86■■■■□ 3.97
CROT-202ENST00000412227 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.86■■■■□ 3.97
CROT-202ENST00000412227 SOGA1O94964 1423 aa39.83■■■■□ 3.97
CROT-202ENST00000412227 ARHGEF11O15085 1522 aa39.76■■■■□ 3.96
CROT-202ENST00000412227 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.76■■■■□ 3.96
CROT-202ENST00000412227 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.74■■■■□ 3.95
CROT-202ENST00000412227 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.74■■■■□ 3.95
CROT-202ENST00000412227 FBLN2P98095 1184 aa39.74■■■■□ 3.95
CROT-202ENST00000412227 CUX1P39880 1505 aa39.74■■■■□ 3.95
CROT-202ENST00000412227 WDR97A6NE52 1622 aa39.65■■■■□ 3.94
CROT-202ENST00000412227 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.56■■■■□ 3.92
CROT-202ENST00000412227 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.5■■■■□ 3.91
CROT-202ENST00000412227 GRIN2BQ13224 1484 aa39.47■■■■□ 3.91
CROT-202ENST00000412227 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.46■■■■□ 3.91
CROT-202ENST00000412227 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.44■■■■□ 3.9
CROT-202ENST00000412227 PBRM1Q86U86 1689 aa39.38■■■■□ 3.9
CROT-202ENST00000412227 ARAP1Q96P48 1450 aa39.37■■■■□ 3.89
CROT-202ENST00000412227 SYNJ1O43426 1573 aa39.35■■■■□ 3.89
CROT-202ENST00000412227 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.35■■■■□ 3.89
CROT-202ENST00000412227 SYNJ2O15056 1496 aa39.32■■■■□ 3.89
CROT-202ENST00000412227 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.32■■■■□ 3.89
CROT-202ENST00000412227 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.31■■■■□ 3.88
CROT-202ENST00000412227 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.25■■■■□ 3.87
CROT-202ENST00000412227 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.18■■■■□ 3.86
CROT-202ENST00000412227 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.15■■■■□ 3.86
CROT-202ENST00000412227 TOP2BQ02880 1626 aa39.14■■■■□ 3.86
CROT-202ENST00000412227 TRHP20396 242 aaPredicted RBP39.06■■■■□ 3.84
CROT-202ENST00000412227 GRIN2AQ12879 1464 aa38.96■■■■□ 3.83
CROT-202ENST00000412227 ADAMTS12P58397 1594 aa38.95■■■■□ 3.83
CROT-202ENST00000412227 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.84■■■■□ 3.81
CROT-202ENST00000412227 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.83■■■■□ 3.81
CROT-202ENST00000412227 CEP170Q5SW79 1584 aa38.82■■■■□ 3.81
CROT-202ENST00000412227 NUP160Q12769 1436 aa38.8■■■■□ 3.8
CROT-202ENST00000412227 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.73■■■■□ 3.79
CROT-202ENST00000412227 SHROOM2Q13796 1616 aa38.65■■■■□ 3.78
CROT-202ENST00000412227 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP38.46■■■■□ 3.75
CROT-202ENST00000412227 JPH4Q96JJ6 628 aa38.45■■■■□ 3.75
CROT-202ENST00000412227 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.39■■■■□ 3.74
CROT-202ENST00000412227 KIF27Q86VH2 1401 aa38.38■■■■□ 3.73
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