RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532265.5

SERGEF-219, Transcript of secretion regulating guanine nucleotide exchange factor, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SERGEF, Length 1,124 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERGEF-219ENST00000532265 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.18■■■■■ 6.42
SERGEF-219ENST00000532265 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.34■■■■■ 5.49
SERGEF-219ENST00000532265 ABCC9O60706 1549 aa48.78■■■■■ 5.4
SERGEF-219ENST00000532265 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.65■■■■■ 5.06
SERGEF-219ENST00000532265 NACADO15069 1562 aa46.46■■■■■ 5.03
SERGEF-219ENST00000532265 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.17■■■■■ 4.98
SERGEF-219ENST00000532265 MYO15BQ96JP2 1530 aa46■■■■■ 4.95
SERGEF-219ENST00000532265 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.87■■■■■ 4.93
SERGEF-219ENST00000532265 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.76■■■■■ 4.92
SERGEF-219ENST00000532265 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.61■■■■■ 4.89
SERGEF-219ENST00000532265 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.45■■■■■ 4.87
SERGEF-219ENST00000532265 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.37■■■■■ 4.85
SERGEF-219ENST00000532265 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.3■■■■■ 4.84
SERGEF-219ENST00000532265 SCRIBQ14160 1630 aa44.99■■■■■ 4.79
SERGEF-219ENST00000532265 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.72■■■■■ 4.75
SERGEF-219ENST00000532265 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.18■■■■■ 4.66
SERGEF-219ENST00000532265 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.14■■■■■ 4.66
SERGEF-219ENST00000532265 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.87■■■■■ 4.61
SERGEF-219ENST00000532265 SMARCA4P51532 1647 aa42.97■■■■■ 4.47
SERGEF-219ENST00000532265 NCAPD3P42695 1498 aa42.87■■■■■ 4.45
SERGEF-219ENST00000532265 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.84■■■■■ 4.45
SERGEF-219ENST00000532265 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.78■■■■■ 4.44
SERGEF-219ENST00000532265 SMARCA2P51531 1590 aa42.72■■■■■ 4.43
SERGEF-219ENST00000532265 HMGXB3Q12766 1538 aa42.66■■■■■ 4.42
SERGEF-219ENST00000532265 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.56■■■■■ 4.4
SERGEF-219ENST00000532265 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.55■■■■■ 4.4
SERGEF-219ENST00000532265 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.43■■■■■ 4.38
SERGEF-219ENST00000532265 NESP48681 1621 aa42.09■■■■■ 4.33
SERGEF-219ENST00000532265 WIZO95785 1651 aa42.09■■■■■ 4.33
SERGEF-219ENST00000532265 ERCC6Q03468 1493 aa42.03■■■■■ 4.32
SERGEF-219ENST00000532265 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.85■■■■■ 4.29
SERGEF-219ENST00000532265 CUX2O14529 1486 aa41.81■■■■■ 4.28
SERGEF-219ENST00000532265 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.81■■■■■ 4.28
SERGEF-219ENST00000532265 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.62■■■■■ 4.25
SERGEF-219ENST00000532265 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.62■■■■■ 4.25
SERGEF-219ENST00000532265 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.57■■■■■ 4.25
SERGEF-219ENST00000532265 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.56■■■■■ 4.24
SERGEF-219ENST00000532265 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.51■■■■■ 4.24
SERGEF-219ENST00000532265 CFTRP13569 1480 aa41.24■■■■■ 4.19
SERGEF-219ENST00000532265 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.19■■■■■ 4.18
SERGEF-219ENST00000532265 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.14■■■■■ 4.18
SERGEF-219ENST00000532265 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.13■■■■■ 4.17
SERGEF-219ENST00000532265 WDR62O43379 1518 aa41.13■■■■■ 4.17
SERGEF-219ENST00000532265 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.12■■■■■ 4.17
SERGEF-219ENST00000532265 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.06■■■■■ 4.16
SERGEF-219ENST00000532265 PRDM2Q13029 1718 aa40.98■■■■■ 4.15
SERGEF-219ENST00000532265 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.81■■■■■ 4.12
SERGEF-219ENST00000532265 TOPBP1Q92547 1522 aa40.43■■■■■ 4.06
SERGEF-219ENST00000532265 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.34■■■■■ 4.05
SERGEF-219ENST00000532265 ABCC8Q09428 1581 aa40.29■■■■■ 4.04
SERGEF-219ENST00000532265 IFT140Q96RY7 1462 aa40.27■■■■■ 4.04
SERGEF-219ENST00000532265 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.23■■■■■ 4.03
SERGEF-219ENST00000532265 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.21■■■■■ 4.03
SERGEF-219ENST00000532265 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.09■■■■■ 4.01
SERGEF-219ENST00000532265 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.06■■■■■ 4
SERGEF-219ENST00000532265 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.06■■■■■ 4
SERGEF-219ENST00000532265 CUX1P39880 1505 aa39.95■■■■□ 3.99
SERGEF-219ENST00000532265 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.89■■■■□ 3.98
SERGEF-219ENST00000532265 OSCARQ8IYS5 282 aa39.88■■■■□ 3.97
SERGEF-219ENST00000532265 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.88■■■■□ 3.97
SERGEF-219ENST00000532265 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.88■■■■□ 3.97
SERGEF-219ENST00000532265 SOGA1O94964 1423 aa39.81■■■■□ 3.96
SERGEF-219ENST00000532265 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.68■■■■□ 3.94
SERGEF-219ENST00000532265 CHD1O14646 1710 aa39.68■■■■□ 3.94
SERGEF-219ENST00000532265 WDR97A6NE52 1622 aa39.67■■■■□ 3.94
SERGEF-219ENST00000532265 TRIM41Q8WV44 630 aa39.54■■■■□ 3.92
SERGEF-219ENST00000532265 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.5■■■■□ 3.91
SERGEF-219ENST00000532265 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.48■■■■□ 3.91
SERGEF-219ENST00000532265 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.48■■■■□ 3.91
SERGEF-219ENST00000532265 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.48■■■■□ 3.91
SERGEF-219ENST00000532265 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.47■■■■□ 3.91
SERGEF-219ENST00000532265 SYNJ1O43426 1573 aa39.46■■■■□ 3.91
SERGEF-219ENST00000532265 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.45■■■■□ 3.91
SERGEF-219ENST00000532265 TOP2BQ02880 1626 aa39.44■■■■□ 3.9
SERGEF-219ENST00000532265 PBRM1Q86U86 1689 aa39.43■■■■□ 3.9
SERGEF-219ENST00000532265 GRIN2BQ13224 1484 aa39.43■■■■□ 3.9
SERGEF-219ENST00000532265 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.41■■■■□ 3.9
SERGEF-219ENST00000532265 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.41■■■■□ 3.9
SERGEF-219ENST00000532265 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.39■■■■□ 3.9
SERGEF-219ENST00000532265 FBLN2P98095 1184 aa39.39■■■■□ 3.9
SERGEF-219ENST00000532265 ARHGEF11O15085 1522 aa39.39■■■■□ 3.9
SERGEF-219ENST00000532265 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.37■■■■□ 3.89
SERGEF-219ENST00000532265 SYNJ2O15056 1496 aa39.25■■■■□ 3.87
SERGEF-219ENST00000532265 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.21■■■■□ 3.87
SERGEF-219ENST00000532265 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.19■■■■□ 3.86
SERGEF-219ENST00000532265 ADAMTS12P58397 1594 aa39.07■■■■□ 3.84
SERGEF-219ENST00000532265 ARAP1Q96P48 1450 aa39.05■■■■□ 3.84
SERGEF-219ENST00000532265 GRIN2AQ12879 1464 aa38.96■■■■□ 3.83
SERGEF-219ENST00000532265 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.95■■■■□ 3.83
SERGEF-219ENST00000532265 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.94■■■■□ 3.82
SERGEF-219ENST00000532265 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.88■■■■□ 3.81
SERGEF-219ENST00000532265 CEP170Q5SW79 1584 aa38.86■■■■□ 3.81
SERGEF-219ENST00000532265 NUP160Q12769 1436 aa38.81■■■■□ 3.8
SERGEF-219ENST00000532265 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.66■■■■□ 3.78
SERGEF-219ENST00000532265 SHROOM2Q13796 1616 aa38.64■■■■□ 3.78
SERGEF-219ENST00000532265 KIF27Q86VH2 1401 aa38.59■■■■□ 3.77
SERGEF-219ENST00000532265 IGF1RP08069 1367 aa38.53■■■■□ 3.76
SERGEF-219ENST00000532265 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.52■■■■□ 3.76
SERGEF-219ENST00000532265 CUL7Q14999 1698 aa38.51■■■■□ 3.76
SERGEF-219ENST00000532265 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP38.35■■■■□ 3.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 91.1 ms