RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000396039.1

PARD6B-202, Transcript of par-6 family cell polarity regulator beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PARD6B, Length 522 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARD6B-202ENST00000396039 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.34■■■■■ 6.45
PARD6B-202ENST00000396039 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.82■■■■■ 5.57
PARD6B-202ENST00000396039 ABCC9O60706 1549 aa49.5■■■■■ 5.52
PARD6B-202ENST00000396039 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.34■■■■■ 5.17
PARD6B-202ENST00000396039 NACADO15069 1562 aa47.03■■■■■ 5.12
PARD6B-202ENST00000396039 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.51■■■■■ 5.04
PARD6B-202ENST00000396039 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.44■■■■■ 5.03
PARD6B-202ENST00000396039 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.24■■■■■ 4.99
PARD6B-202ENST00000396039 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.22■■■■■ 4.99
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PARD6B-202ENST00000396039 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.83■■■■■ 4.93
PARD6B-202ENST00000396039 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.82■■■■■ 4.93
PARD6B-202ENST00000396039 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.45■■■■■ 4.87
PARD6B-202ENST00000396039 SCRIBQ14160 1630 aa45.21■■■■■ 4.83
PARD6B-202ENST00000396039 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.82■■■■■ 4.77
PARD6B-202ENST00000396039 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.74■■■■■ 4.75
PARD6B-202ENST00000396039 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.66■■■■■ 4.74
PARD6B-202ENST00000396039 NCAPD3P42695 1498 aa43.32■■■■■ 4.53
PARD6B-202ENST00000396039 SMARCA4P51532 1647 aa43.2■■■■■ 4.51
PARD6B-202ENST00000396039 SMARCA2P51531 1590 aa43.18■■■■■ 4.5
PARD6B-202ENST00000396039 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.16■■■■■ 4.5
PARD6B-202ENST00000396039 HMGXB3Q12766 1538 aa43.1■■■■■ 4.49
PARD6B-202ENST00000396039 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.03■■■■■ 4.48
PARD6B-202ENST00000396039 ERCC6Q03468 1493 aa42.85■■■■■ 4.45
PARD6B-202ENST00000396039 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.83■■■■■ 4.45
PARD6B-202ENST00000396039 CUX2O14529 1486 aa42.82■■■■■ 4.45
PARD6B-202ENST00000396039 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.81■■■■■ 4.44
PARD6B-202ENST00000396039 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.57■■■■■ 4.41
PARD6B-202ENST00000396039 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.56■■■■■ 4.4
PARD6B-202ENST00000396039 NESP48681 1621 aa42.5■■■■■ 4.39
PARD6B-202ENST00000396039 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.44■■■■■ 4.38
PARD6B-202ENST00000396039 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.22■■■■■ 4.35
PARD6B-202ENST00000396039 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.14■■■■■ 4.34
PARD6B-202ENST00000396039 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.11■■■■■ 4.33
PARD6B-202ENST00000396039 WIZO95785 1651 aa42.09■■■■■ 4.33
PARD6B-202ENST00000396039 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.98■■■■■ 4.31
PARD6B-202ENST00000396039 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.75■■■■■ 4.27
PARD6B-202ENST00000396039 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.69■■■■■ 4.27
PARD6B-202ENST00000396039 WDR62O43379 1518 aa41.67■■■■■ 4.26
PARD6B-202ENST00000396039 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.65■■■■■ 4.26
PARD6B-202ENST00000396039 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.61■■■■■ 4.25
PARD6B-202ENST00000396039 CFTRP13569 1480 aa41.53■■■■■ 4.24
PARD6B-202ENST00000396039 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.52■■■■■ 4.24
PARD6B-202ENST00000396039 PRDM2Q13029 1718 aa41.34■■■■■ 4.21
PARD6B-202ENST00000396039 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.13■■■■■ 4.17
PARD6B-202ENST00000396039 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.07■■■■■ 4.16
PARD6B-202ENST00000396039 ABCC8Q09428 1581 aa40.79■■■■■ 4.12
PARD6B-202ENST00000396039 IFT140Q96RY7 1462 aa40.78■■■■■ 4.12
PARD6B-202ENST00000396039 OSCARQ8IYS5 282 aa40.76■■■■■ 4.12
PARD6B-202ENST00000396039 TOPBP1Q92547 1522 aa40.74■■■■■ 4.11
PARD6B-202ENST00000396039 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.66■■■■■ 4.1
PARD6B-202ENST00000396039 TRIM41Q8WV44 630 aa40.66■■■■■ 4.1
PARD6B-202ENST00000396039 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.57■■■■■ 4.08
PARD6B-202ENST00000396039 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.48■■■■■ 4.07
PARD6B-202ENST00000396039 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.39■■■■■ 4.06
PARD6B-202ENST00000396039 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.32■■■■■ 4.04
PARD6B-202ENST00000396039 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.27■■■■■ 4.04
PARD6B-202ENST00000396039 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.27■■■■■ 4.04
PARD6B-202ENST00000396039 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.27■■■■■ 4.04
PARD6B-202ENST00000396039 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.2■■■■■ 4.031e-8■■■□□ 17.7
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PARD6B-202ENST00000396039 WDR97A6NE52 1622 aa40.18■■■■■ 4.02
PARD6B-202ENST00000396039 ARHGEF11O15085 1522 aa40.13■■■■■ 4.01
PARD6B-202ENST00000396039 SOGA1O94964 1423 aa40.12■■■■■ 4.01
PARD6B-202ENST00000396039 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.07■■■■■ 4.01
PARD6B-202ENST00000396039 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.07■■■■■ 4
PARD6B-202ENST00000396039 CUX1P39880 1505 aa40.01■■■■■ 4
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PARD6B-202ENST00000396039 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.88■■■■□ 3.97
PARD6B-202ENST00000396039 GRIN2BQ13224 1484 aa39.82■■■■□ 3.97
PARD6B-202ENST00000396039 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.78■■■■□ 3.96
PARD6B-202ENST00000396039 SYNJ1O43426 1573 aa39.76■■■■□ 3.96
PARD6B-202ENST00000396039 PBRM1Q86U86 1689 aa39.74■■■■□ 3.95
PARD6B-202ENST00000396039 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.72■■■■□ 3.95
PARD6B-202ENST00000396039 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.71■■■■□ 3.95
PARD6B-202ENST00000396039 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.7■■■■□ 3.95
PARD6B-202ENST00000396039 SYNJ2O15056 1496 aa39.69■■■■□ 3.94
PARD6B-202ENST00000396039 ARAP1Q96P48 1450 aa39.69■■■■□ 3.94
PARD6B-202ENST00000396039 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.67■■■■□ 3.94
PARD6B-202ENST00000396039 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.66■■■■□ 3.94
PARD6B-202ENST00000396039 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.63■■■■□ 3.93
PARD6B-202ENST00000396039 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.51■■■■□ 3.92
PARD6B-202ENST00000396039 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.51■■■■□ 3.92
PARD6B-202ENST00000396039 TOP2BQ02880 1626 aa39.48■■■■□ 3.91
PARD6B-202ENST00000396039 ADAMTS12P58397 1594 aa39.32■■■■□ 3.88
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PARD6B-202ENST00000396039 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.22■■■■□ 3.87
PARD6B-202ENST00000396039 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.19■■■■□ 3.86
PARD6B-202ENST00000396039 NUP160Q12769 1436 aa39.15■■■■□ 3.86
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PARD6B-202ENST00000396039 SHROOM2Q13796 1616 aa39.04■■■■□ 3.84
PARD6B-202ENST00000396039 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.95■■■■□ 3.83
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PARD6B-202ENST00000396039 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP38.73■■■■□ 3.79
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PARD6B-202ENST00000396039 KIF27Q86VH2 1401 aa38.7■■■■□ 3.79
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