RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000500800.2

SMARCA5-AS1-201, SMARCA5 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMARCA5-AS1, Length 945 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.21■■■■■ 6.43
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.27■■■■■ 5.48
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 ABCC9O60706 1549 aa48.28■■■■■ 5.32
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.42■■■■■ 5.02
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 NACADO15069 1562 aa46.32■■■■■ 5.01
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.07■■■■■ 4.97
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.01■■■■■ 4.96
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.95■■■■■ 4.95
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.72■■■■■ 4.91
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.47■■■■■ 4.87
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.05■■■■■ 4.8
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.04■■■■■ 4.8
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 SCRIBQ14160 1630 aa44.84■■■■■ 4.77
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.57■■■■■ 4.73
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.52■■■■■ 4.72
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.85■■■■■ 4.61
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.73■■■■■ 4.59
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.43■■■■■ 4.54
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 SMARCA4P51532 1647 aa42.92■■■■■ 4.46
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.82■■■■■ 4.44
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 NCAPD3P42695 1498 aa42.73■■■■■ 4.43
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.7■■■■■ 4.43
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 SMARCA2P51531 1590 aa42.66■■■■■ 4.42
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.54■■■■■ 4.4
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.52■■■■■ 4.4
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 HMGXB3Q12766 1538 aa42.52■■■■■ 4.4
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.32■■■■■ 4.37
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 WIZO95785 1651 aa42.09■■■■■ 4.33
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.95■■■■■ 4.31
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 NESP48681 1621 aa41.74■■■■■ 4.27
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.67■■■■■ 4.26
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.63■■■■■ 4.25
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 ERCC6Q03468 1493 aa41.62■■■■■ 4.25
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.44■■■■■ 4.22
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 CUX2O14529 1486 aa41.34■■■■■ 4.21
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.33■■■■■ 4.21
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.32■■■■■ 4.2
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.22■■■■■ 4.19
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 CFTRP13569 1480 aa41.17■■■■■ 4.18
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.1■■■■■ 4.17
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.96■■■■■ 4.15
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 PRDM2Q13029 1718 aa40.96■■■■■ 4.15
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.94■■■■■ 4.14
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.94■■■■■ 4.14
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 WDR62O43379 1518 aa40.84■■■■■ 4.13
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.62■■■■■ 4.09
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.59■■■■■ 4.09
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 TOPBP1Q92547 1522 aa40.31■■■■■ 4.04
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 ABCC8Q09428 1581 aa40.31■■■■■ 4.04
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.29■■■■■ 4.04
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.26■■■■■ 4.04
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 IFT140Q96RY7 1462 aa40.1■■■■■ 4.01
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.94■■■■□ 3.98
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.93■■■■□ 3.98
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 CUX1P39880 1505 aa39.92■■■■□ 3.98
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.92■■■■□ 3.98
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.81■■■■□ 3.96
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.8■■■■□ 3.96
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.75■■■■□ 3.95
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 SOGA1O94964 1423 aa39.74■■■■□ 3.95
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.65■■■■□ 3.94
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 WDR97A6NE52 1622 aa39.62■■■■□ 3.93
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.58■■■■□ 3.93
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 TOP2BQ02880 1626 aa39.55■■■■□ 3.92
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.55■■■■□ 3.92
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.53■■■■□ 3.92
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 OSCARQ8IYS5 282 aa39.52■■■■□ 3.92
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 SYNJ1O43426 1573 aa39.5■■■■□ 3.91
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.44■■■■□ 3.9
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 CHD1O14646 1710 aa39.38■■■■□ 3.89
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 GRIN2BQ13224 1484 aa39.33■■■■□ 3.89
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.32■■■■□ 3.89
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 PBRM1Q86U86 1689 aa39.31■■■■□ 3.88
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.3■■■■□ 3.88
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.3■■■■□ 3.88
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.27■■■■□ 3.88
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 FBLN2P98095 1184 aa39.15■■■■□ 3.86
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 SYNJ2O15056 1496 aa39.11■■■■□ 3.85
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.05■■■■□ 3.84
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa38.99■■■■□ 3.83
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.99■■■■□ 3.83
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.99■■■■□ 3.83
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.97■■■■□ 3.83
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 ADAMTS12P58397 1594 aa38.95■■■■□ 3.83
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 ARHGEF11O15085 1522 aa38.93■■■■□ 3.82
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.92■■■■□ 3.82
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.84■■■■□ 3.81
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 GRIN2AQ12879 1464 aa38.83■■■■□ 3.81
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 TRIM41Q8WV44 630 aa38.78■■■■□ 3.8
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 KIF27Q86VH2 1401 aa38.74■■■■□ 3.79
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 NUP160Q12769 1436 aa38.68■■■■□ 3.78
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 CEP170Q5SW79 1584 aa38.66■■■■□ 3.78
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 IGF1RP08069 1367 aa38.61■■■■□ 3.77
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 ARAP1Q96P48 1450 aa38.6■■■■□ 3.77
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 CUL7Q14999 1698 aa38.59■■■■□ 3.77
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.5■■■■□ 3.75
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 SHROOM2Q13796 1616 aa38.47■■■■□ 3.75
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.38■■■■□ 3.74
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.37■■■■□ 3.73
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.34■■■■□ 3.73
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