Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 TBC1D5-204ENST00000414349 687 ntTSL 310.98□□□□□ -0.651e-7■■■■■ 49.2
PCBP2Q15366 TBC1D5-208ENST00000428355 757 ntTSL 39.96□□□□□ -0.821e-7■■■■■ 49.2
PCBP2Q15366 TBC1D5-215ENST00000443499 681 ntTSL 59.96□□□□□ -0.821e-7■■■■■ 49.2
PCBP2Q15366 TBC1D5-202ENST00000412981 592 ntTSL 39.58□□□□□ -0.881e-7■■■■■ 49.2
PCBP2Q15366 TBC1D5-229ENST00000497531 672 ntTSL 39.48□□□□□ -0.891e-7■■■■■ 49.2
PCBP2Q15366 TBC1D5-205ENST00000415814 852 ntTSL 39.29□□□□□ -0.921e-7■■■■■ 49.2
PCBP2Q15366 TBC1D5-211ENST00000430169 492 ntTSL 39.02□□□□□ -0.971e-7■■■■■ 49.2
PCBP2Q15366 TBC1D5-219ENST00000446818 3124 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.051e-7■■■■■ 49.2
PCBP2Q15366 TBC1D5-209ENST00000429383 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.061e-7■■■■■ 49.2
PCBP2Q15366 TBC1D5-220ENST00000446863 557 ntTSL 48□□□□□ -1.131e-7■■■■■ 49.2
PCBP2Q15366 TBC1D5-230ENST00000507877 578 ntTSL 46.88□□□□□ -1.311e-7■■■■■ 49.2
PCBP2Q15366 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.471e-7■■■■■ 49.2
PCBP2Q15366 TBC1D5-214ENST00000443386 561 ntTSL 45.82□□□□□ -1.481e-7■■■■■ 49.2
PCBP2Q15366 TBC1D5-217ENST00000444756 545 ntTSL 45.66□□□□□ -1.51e-7■■■■■ 49.2
PCBP2Q15366 TBC1D5-213ENST00000434420 386 ntTSL 43.84□□□□□ -1.791e-7■■■■■ 49.2
PCBP2Q15366 INTS11-227ENST00000525603 738 ntTSL 313.3□□□□□ -0.284e-7■■■■■ 49.2
PCBP2Q15366 PCCA-205ENST00000424527 447 ntTSL 35.53□□□□□ -1.521e-9■■■■■ 49.2
PCBP2Q15366 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.967e-9■■■■■ 49.2
PCBP2Q15366 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.861e-6■■■■■ 49.2
PCBP2Q15366 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.271e-8■■■■■ 49.2
PCBP2Q15366 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.371e-8■■■■■ 49.2
PCBP2Q15366 SMARCA2-227ENST00000634760 5847 ntTSL 520.18■□□□□ 0.822e-11■■■■■ 49.2
PCBP2Q15366 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.112e-11■■■■■ 49.2
PCBP2Q15366 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.172e-11■■■■■ 49.2
PCBP2Q15366 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.252e-11■■■■■ 49.2
PCBP2Q15366 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.262e-11■■■■■ 49.2
PCBP2Q15366 SMARCA2-209ENST00000382203 5867 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.532e-11■■■■■ 49.2
PCBP2Q15366 SMARCA2-234ENST00000635129 582 ntTSL 39.05□□□□□ -0.962e-11■■■■■ 49.2
PCBP2Q15366 SMARCA2-246ENST00000635739 4272 ntTSL 58.16□□□□□ -1.12e-11■■■■■ 49.2
PCBP2Q15366 SMARCA2-236ENST00000635185 683 ntTSL 57.4□□□□□ -1.222e-11■■■■■ 49.2
PCBP2Q15366 ATP8B3-208ENST00000587160 933 ntTSL 518.61■□□□□ 0.573e-14■■■■■ 49.2
PCBP2Q15366 ATP8B3-205ENST00000531925 5237 ntTSL 217.12■□□□□ 0.333e-14■■■■■ 49.2
PCBP2Q15366 PEPD-212ENST00000593163 1045 ntTSL 216.86■□□□□ 0.293e-14■■■■■ 49.2
PCBP2Q15366 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.173e-14■■■■■ 49.2
PCBP2Q15366 PEPD-204ENST00000588328 581 ntTSL 312.72□□□□□ -0.373e-14■■■■■ 49.2
PCBP2Q15366 ATP8B3-202ENST00000525591 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.473e-14■■■■■ 49.2
PCBP2Q15366 ATP8B3-203ENST00000526092 2759 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.673e-14■■■■■ 49.2
PCBP2Q15366 PEPD-213ENST00000609145 570 ntTSL 210.59□□□□□ -0.713e-14■■■■■ 49.2
PCBP2Q15366 PEPD-205ENST00000588719 484 ntTSL 38.81□□□□□ -13e-14■■■■■ 49.2
PCBP2Q15366 PEPD-208ENST00000590731 557 ntTSL 46.95□□□□□ -1.33e-14■■■■■ 49.2
PCBP2Q15366 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.592e-7■■■■■ 49.1
PCBP2Q15366 SLC47A1-207ENST00000573009 1317 ntTSL 217.37■□□□□ 0.372e-7■■■■■ 49.1
PCBP2Q15366 SLC47A1-205ENST00000497548 1900 ntTSL 217.08■□□□□ 0.322e-7■■■■■ 49.1
PCBP2Q15366 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.312e-7■■■■■ 49.1
PCBP2Q15366 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.082e-7■■■■■ 49.1
PCBP2Q15366 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.232e-7■■■■■ 49.1
PCBP2Q15366 SLC47A1-201ENST00000270570 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.372e-7■■■■■ 49.1
PCBP2Q15366 SLC47A1-211ENST00000575377 1362 ntTSL 212.63□□□□□ -0.392e-7■■■■■ 49.1
PCBP2Q15366 SLC47A1-204ENST00000495425 1066 ntTSL 212.49□□□□□ -0.412e-7■■■■■ 49.1
PCBP2Q15366 MAGI1-205ENST00000464060 2247 ntTSL 1 (best)23.28■■□□□ 1.321e-6■■■■■ 49.1
PCBP2Q15366 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.211e-6■■■■■ 49.1
PCBP2Q15366 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.091e-6■■■■■ 49.1
PCBP2Q15366 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.021e-6■■■■■ 49.1
PCBP2Q15366 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.11e-6■■■■■ 49.1
PCBP2Q15366 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.162e-6■■■■■ 49.1
PCBP2Q15366 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.262e-6■■■■■ 49.1
PCBP2Q15366 DICER1-204ENST00000527414 6179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.182e-7■■■■■ 49.1
PCBP2Q15366 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.662e-7■■■■■ 49.1
PCBP2Q15366 SRRM2-220ENST00000574593 1440 ntTSL 314.77□□□□□ -0.043e-8■■■■■ 49
PCBP2Q15366 SCAMP5-217ENST00000568119 557 ntTSL 418.81■□□□□ 0.63e-12■■■■■ 49
PCBP2Q15366 ZC3HC1-210ENST00000483827 760 ntTSL 513.86□□□□□ -0.194e-10■■■■■ 49
PCBP2Q15366 ZC3HC1-203ENST00000360708 1676 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.414e-10■■■■■ 49
PCBP2Q15366 ZC3HC1-209ENST00000481503 1741 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.544e-10■■■■■ 49
PCBP2Q15366 ZC3HC1-202ENST00000358303 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.594e-10■■■■■ 49
PCBP2Q15366 ZC3HC1-201ENST00000311873 2017 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.624e-10■■■■■ 49
PCBP2Q15366 ZC3HC1-204ENST00000467642 1934 ntTSL 29.33□□□□□ -0.924e-10■■■■■ 49
PCBP2Q15366 ZC3HC1-206ENST00000471022 978 ntTSL 59.11□□□□□ -0.954e-10■■■■■ 49
PCBP2Q15366 ZC3HC1-207ENST00000477578 850 ntTSL 29.08□□□□□ -0.964e-10■■■■■ 49
PCBP2Q15366 PUM1-208ENST00000471894 812 ntTSL 310.23□□□□□ -0.772e-18■■■■■ 48.9
PCBP2Q15366 PUM1-210ENST00000490546 707 ntTSL 410.03□□□□□ -0.82e-18■■■■■ 48.9
PCBP2Q15366 PUM1-223ENST00000532678 793 ntTSL 47.64□□□□□ -1.192e-18■■■■■ 48.9
PCBP2Q15366 ASS1-208ENST00000470849 652 ntTSL 215.78■□□□□ 0.122e-7■■■■■ 48.9
PCBP2Q15366 ASS1-202ENST00000372386 667 ntTSL 313.39□□□□□ -0.272e-7■■■■■ 48.9
PCBP2Q15366 ASS1-210ENST00000493984 687 ntTSL 512.87□□□□□ -0.352e-7■■■■■ 48.9
PCBP2Q15366 ASS1-209ENST00000492400 444 ntTSL 310.8□□□□□ -0.682e-7■■■■■ 48.9
PCBP2Q15366 RNF44-207ENST00000513029 1647 ntTSL 217.5■□□□□ 0.396e-7■■■■■ 48.9
PCBP2Q15366 PTK2-230ENST00000521250 592 ntTSL 49.23□□□□□ -0.935e-7■■■■■ 48.8
PCBP2Q15366 PTK2-236ENST00000521981 552 ntTSL 58.91□□□□□ -0.985e-7■■■■■ 48.8
PCBP2Q15366 PTK2-238ENST00000521986 2393 ntTSL 28.29□□□□□ -1.085e-7■■■■■ 48.8
PCBP2Q15366 PTK2-246ENST00000523539 3236 ntTSL 26.92□□□□□ -1.35e-7■■■■■ 48.8
PCBP2Q15366 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.274e-6■■■■■ 48.8
PCBP2Q15366 CSNK2A1-206ENST00000608066 577 ntTSL 414.34□□□□□ -0.114e-6■■■■■ 48.8
PCBP2Q15366 CSNK2A1-209ENST00000609606 589 ntTSL 214.34□□□□□ -0.114e-6■■■■■ 48.8
PCBP2Q15366 CSNK2A1-205ENST00000460062 552 ntTSL 414.34□□□□□ -0.114e-6■■■■■ 48.8
PCBP2Q15366 CSNK2A1-202ENST00000349736 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.924e-6■■■■■ 48.8
PCBP2Q15366 CSNK2A1-201ENST00000217244 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.064e-6■■■■■ 48.8
PCBP2Q15366 CSNK2A1-204ENST00000400227 1499 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.344e-6■■■■■ 48.8
PCBP2Q15366 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.481e-12■■■■■ 48.8
PCBP2Q15366 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.621e-12■■■■■ 48.8
PCBP2Q15366 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.442e-6■■■■■ 48.8
PCBP2Q15366 BCL3-202ENST00000403534 1714 ntTSL 217.2■□□□□ 0.342e-18■■■■■ 48.8
PCBP2Q15366 BCL3-203ENST00000444487 923 ntTSL 516.95■□□□□ 0.32e-18■■■■■ 48.8
PCBP2Q15366 SLC2A9-206ENST00000505104 1659 ntTSL 1 (best)16.75■□□□□ 0.273e-8■■■■■ 48.8
PCBP2Q15366 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.13e-8■■■■■ 48.8
PCBP2Q15366 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.073e-8■■■■■ 48.8
PCBP2Q15366 SLC2A9-208ENST00000506583 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.363e-8■■■■■ 48.8
PCBP2Q15366 RNF44-205ENST00000508478 662 ntTSL 315.76■□□□□ 0.117e-11■■■■■ 48.8
PCBP2Q15366 GRINA-206ENST00000530898 558 ntTSL 214.71□□□□□ -0.052e-16■■■■■ 48.8
PCBP2Q15366 CHD9-209ENST00000564255 2896 ntTSL 53.41□□□□□ -1.861e-19■■■■■ 48.7
PCBP2Q15366 CHD9-216ENST00000565803 3625 ntTSL 53.39□□□□□ -1.871e-19■■■■■ 48.7
Retrieved 100 of 29,421 protein–RNA pairs in 305 ms