Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 SPTBN1-203ENST00000389980 2164 ntTSL 1 (best)12.26□□□□□ -0.451e-16■□□□□ 8.1
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PRPF4O43172 ARPC2-214ENST00000480062 508 ntTSL 224.17■■□□□ 1.463e-7■□□□□ 8.1
PRPF4O43172 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.453e-7■□□□□ 8.1
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PRPF4O43172 SORBS3-206ENST00000519127 209 ntTSL 217.56■□□□□ 0.43e-7■□□□□ 8.1
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PRPF4O43172 PPP1R10-204ENST00000473954 470 ntTSL 33.82□□□□□ -1.81e-8■□□□□ 8.1
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PRPF4O43172 TNFRSF14-207ENST00000451778 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 314.6□□□□□ -0.071e-7■□□□□ 8.1
PRPF4O43172 LTBP4-234ENST00000612845 527 ntTSL 414.31□□□□□ -0.125e-6■□□□□ 8.1
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PRPF4O43172 TMEM94-231ENST00000584694 528 ntTSL 514.09□□□□□ -0.155e-6■□□□□ 8.1
PRPF4O43172 FLOT1-207ENST00000454845 629 ntTSL 314.06□□□□□ -0.165e-6■□□□□ 8.1
PRPF4O43172 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.171e-7■□□□□ 8.1
PRPF4O43172 SF3A2-206ENST00000592314 885 ntTSL 513.98□□□□□ -0.175e-6■□□□□ 8.1
PRPF4O43172 TNFRSF14-216ENST00000496064 1480 ntTSL 213.96□□□□□ -0.171e-7■□□□□ 8.1
PRPF4O43172 TNFRSF14-204ENST00000434817 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 313.95□□□□□ -0.181e-7■□□□□ 8.1
PRPF4O43172 MCF2L-220ENST00000464800 720 ntTSL 213.91□□□□□ -0.185e-6■□□□□ 8.1
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PRPF4O43172 SNHG12-209ENST00000481368 1588 ntTSL 1 (best)13.64□□□□□ -0.231e-7■□□□□ 8.1
PRPF4O43172 ACAD11-204ENST00000481970 1891 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.261e-7■□□□□ 8.1
PRPF4O43172 SNHG12-202ENST00000461832 675 ntTSL 213.21□□□□□ -0.291e-7■□□□□ 8.1
PRPF4O43172 ARRB1-203ENST00000524400 593 ntTSL 413.11□□□□□ -0.311e-7■□□□□ 8.1
PRPF4O43172 SPATS2L-205ENST00000409151 1979 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.335e-6■□□□□ 8.1
PRPF4O43172 FLOT1-205ENST00000438162 888 ntTSL 512.94□□□□□ -0.345e-6■□□□□ 8.1
PRPF4O43172 LINC00482-202ENST00000577000 461 ntTSL 312.88□□□□□ -0.355e-6■□□□□ 8.1
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