RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566515.5

CCNDBP1-208, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 1,634 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-208ENST00000566515 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.43■■■■■ 5.66
CCNDBP1-208ENST00000566515 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.71■■■■■ 4.75
CCNDBP1-208ENST00000566515 ABCC9O60706 1549 aa43.58■■■■■ 4.57
CCNDBP1-208ENST00000566515 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.14■■■■■ 4.34
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.05■■■■■ 4.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 NACADO15069 1562 aa41.97■■■■■ 4.31
CCNDBP1-208ENST00000566515 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.97■■■■■ 4.31
CCNDBP1-208ENST00000566515 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.74■■■■■ 4.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.68■■■■■ 4.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.11■■■■■ 4.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 SCRIBQ14160 1630 aa40.89■■■■■ 4.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.78■■■■■ 4.12
CCNDBP1-208ENST00000566515 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.72■■■■■ 4.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.19■■■■■ 4.02
CCNDBP1-208ENST00000566515 DNAJC5BQ9UF47 199 aa39.79■■■■□ 3.96
CCNDBP1-208ENST00000566515 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.62■■■■□ 3.93
CCNDBP1-208ENST00000566515 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.41■■■■□ 3.9
CCNDBP1-208ENST00000566515 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.31■■■■□ 3.88
CCNDBP1-208ENST00000566515 SMARCA4P51532 1647 aa39.09■■■■□ 3.85
CCNDBP1-208ENST00000566515 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.06■■■■□ 3.84
CCNDBP1-208ENST00000566515 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.91■■■■□ 3.82
CCNDBP1-208ENST00000566515 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.8■■■■□ 3.8
CCNDBP1-208ENST00000566515 SMARCA2P51531 1590 aa38.75■■■■□ 3.79
CCNDBP1-208ENST00000566515 NCAPD3P42695 1498 aa38.72■■■■□ 3.79
CCNDBP1-208ENST00000566515 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.66■■■■□ 3.78
CCNDBP1-208ENST00000566515 HMGXB3Q12766 1538 aa38.55■■■■□ 3.76
CCNDBP1-208ENST00000566515 WIZO95785 1651 aa38.53■■■■□ 3.76
CCNDBP1-208ENST00000566515 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.53■■■■□ 3.76
CCNDBP1-208ENST00000566515 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.5■■■■□ 3.75
CCNDBP1-208ENST00000566515 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.07■■■■□ 3.69
CCNDBP1-208ENST00000566515 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.83■■■■□ 3.65
CCNDBP1-208ENST00000566515 NESP48681 1621 aa37.79■■■■□ 3.64
CCNDBP1-208ENST00000566515 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.67■■■■□ 3.62
CCNDBP1-208ENST00000566515 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.66■■■■□ 3.62
CCNDBP1-208ENST00000566515 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.62■■■■□ 3.61
CCNDBP1-208ENST00000566515 ERCC6Q03468 1493 aa37.51■■■■□ 3.6
CCNDBP1-208ENST00000566515 CFTRP13569 1480 aa37.44■■■■□ 3.58
CCNDBP1-208ENST00000566515 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.4■■■■□ 3.58
CCNDBP1-208ENST00000566515 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.36■■■■□ 3.57
CCNDBP1-208ENST00000566515 PRDM2Q13029 1718 aa37.23■■■■□ 3.55
CCNDBP1-208ENST00000566515 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.21■■■■□ 3.55
CCNDBP1-208ENST00000566515 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.13■■■■□ 3.53
CCNDBP1-208ENST00000566515 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.12■■■■□ 3.53
CCNDBP1-208ENST00000566515 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.01■■■■□ 3.52
CCNDBP1-208ENST00000566515 CUX2O14529 1486 aa36.96■■■■□ 3.51
CCNDBP1-208ENST00000566515 WDR62O43379 1518 aa36.88■■■■□ 3.49
CCNDBP1-208ENST00000566515 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.83■■■■□ 3.49
CCNDBP1-208ENST00000566515 TOPBP1Q92547 1522 aa36.65■■■■□ 3.46
CCNDBP1-208ENST00000566515 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.61■■■■□ 3.45
CCNDBP1-208ENST00000566515 ABCC8Q09428 1581 aa36.6■■■■□ 3.45
CCNDBP1-208ENST00000566515 CUX1P39880 1505 aa36.48■■■■□ 3.43
CCNDBP1-208ENST00000566515 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.35■■■■□ 3.41
CCNDBP1-208ENST00000566515 IFT140Q96RY7 1462 aa36.32■■■■□ 3.4
CCNDBP1-208ENST00000566515 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.32■■■■□ 3.4
CCNDBP1-208ENST00000566515 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.31■■■■□ 3.4
CCNDBP1-208ENST00000566515 SYNJ1O43426 1573 aa36.25■■■■□ 3.39
CCNDBP1-208ENST00000566515 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.24■■■■□ 3.39
CCNDBP1-208ENST00000566515 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.22■■■■□ 3.39
CCNDBP1-208ENST00000566515 TOP2BQ02880 1626 aa36.22■■■■□ 3.39
CCNDBP1-208ENST00000566515 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.21■■■■□ 3.39
CCNDBP1-208ENST00000566515 SOGA1O94964 1423 aa36.21■■■■□ 3.39
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.2■■■■□ 3.39
CCNDBP1-208ENST00000566515 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.05■■■■□ 3.36
CCNDBP1-208ENST00000566515 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.03■■■■□ 3.362e-6■■□□□ 13.6
CCNDBP1-208ENST00000566515 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.01■■■■□ 3.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 WDR97A6NE52 1622 aa36■■■■□ 3.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.94■■■■□ 3.34
CCNDBP1-208ENST00000566515 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.79■■■■□ 3.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.79■■■■□ 3.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 GRIN2BQ13224 1484 aa35.74■■■■□ 3.31
CCNDBP1-208ENST00000566515 PBRM1Q86U86 1689 aa35.73■■■■□ 3.31
CCNDBP1-208ENST00000566515 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.68■■■■□ 3.3
CCNDBP1-208ENST00000566515 TRIM41Q8WV44 630 aa35.68■■■■□ 3.3
CCNDBP1-208ENST00000566515 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.6■■■■□ 3.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 CHD1O14646 1710 aa35.58■■■■□ 3.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa35.58■■■■□ 3.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 FBLN2P98095 1184 aa35.57■■■■□ 3.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 OSCARQ8IYS5 282 aa35.54■■■■□ 3.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 KIF27Q86VH2 1401 aa35.53■■■■□ 3.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.51■■■■□ 3.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.47■■■■□ 3.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 SYNJ2O15056 1496 aa35.47■■■■□ 3.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 ADAMTS12P58397 1594 aa35.43■■■■□ 3.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 CHIC1Q5VXU3 224 aa35.42■■■■□ 3.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 IGF1RP08069 1367 aa35.37■■■■□ 3.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.37■■■■□ 3.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.36■■■■□ 3.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 GRIN2AQ12879 1464 aa35.29■■■■□ 3.24
CCNDBP1-208ENST00000566515 CUL7Q14999 1698 aa35.25■■■■□ 3.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.17■■■■□ 3.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.14■■■■□ 3.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 CEP170Q5SW79 1584 aa35.12■■■■□ 3.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 NUP160Q12769 1436 aa35.1■■■■□ 3.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP34.99■■■■□ 3.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa34.98■■■■□ 3.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 EEA1Q15075 1411 aa34.97■■■■□ 3.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 CSRNP3Q8WYN3 585 aa34.96■■■■□ 3.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34.96■■■■□ 3.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.96■■■■□ 3.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.96■■■■□ 3.19
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