RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563065.5

CCNDBP1-204, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 1,450 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-204ENST00000563065 NISCHQ9Y2I1 1504 aa42■■■■■ 4.31
CCNDBP1-204ENST00000563065 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa37.12■■■■□ 3.53
CCNDBP1-204ENST00000563065 ABCC9O60706 1549 aa36.34■■■■□ 3.41
CCNDBP1-204ENST00000563065 DCAF8L2P0C7V8 631 aa35.19■■■■□ 3.22
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP35■■■■□ 3.19
CCNDBP1-204ENST00000563065 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.9■■■■□ 3.18
CCNDBP1-204ENST00000563065 NACADO15069 1562 aa34.9■■■■□ 3.18
CCNDBP1-204ENST00000563065 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.7■■■■□ 3.15
CCNDBP1-204ENST00000563065 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.66■■■■□ 3.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.16■■■■□ 3.06
CCNDBP1-204ENST00000563065 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34.07■■■■□ 3.05
CCNDBP1-204ENST00000563065 SCRIBQ14160 1630 aa34.05■■■■□ 3.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.92■■■■□ 3.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.47■■■□□ 2.95
CCNDBP1-204ENST00000563065 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.28■■■□□ 2.92
CCNDBP1-204ENST00000563065 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.98■■■□□ 2.87
CCNDBP1-204ENST00000563065 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.82■■■□□ 2.84
CCNDBP1-204ENST00000563065 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.79■■■□□ 2.84
CCNDBP1-204ENST00000563065 SMARCA4P51532 1647 aa32.52■■■□□ 2.8
CCNDBP1-204ENST00000563065 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.48■■■□□ 2.79
CCNDBP1-204ENST00000563065 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.43■■■□□ 2.78
CCNDBP1-204ENST00000563065 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.33■■■□□ 2.77
CCNDBP1-204ENST00000563065 NCAPD3P42695 1498 aa32.25■■■□□ 2.75
CCNDBP1-204ENST00000563065 SMARCA2P51531 1590 aa32.22■■■□□ 2.75
CCNDBP1-204ENST00000563065 PEG3Q9GZU2 1588 aa32.15■■■□□ 2.74
CCNDBP1-204ENST00000563065 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.13■■■□□ 2.73
CCNDBP1-204ENST00000563065 WIZO95785 1651 aa32.08■■■□□ 2.73
CCNDBP1-204ENST00000563065 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP32.05■■■□□ 2.72
CCNDBP1-204ENST00000563065 HMGXB3Q12766 1538 aa32.05■■■□□ 2.72
CCNDBP1-204ENST00000563065 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.68■■■□□ 2.66
CCNDBP1-204ENST00000563065 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.59■■■□□ 2.65
CCNDBP1-204ENST00000563065 NESP48681 1621 aa31.52■■■□□ 2.64
CCNDBP1-204ENST00000563065 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.39■■■□□ 2.62
CCNDBP1-204ENST00000563065 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.36■■■□□ 2.61
CCNDBP1-204ENST00000563065 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.32■■■□□ 2.6
CCNDBP1-204ENST00000563065 ERCC6Q03468 1493 aa31.24■■■□□ 2.59
CCNDBP1-204ENST00000563065 CFTRP13569 1480 aa31.19■■■□□ 2.58
CCNDBP1-204ENST00000563065 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.15■■■□□ 2.58
CCNDBP1-204ENST00000563065 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.07■■■□□ 2.56
CCNDBP1-204ENST00000563065 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.99■■■□□ 2.55
CCNDBP1-204ENST00000563065 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.9■■■□□ 2.54
CCNDBP1-204ENST00000563065 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.89■■■□□ 2.54
CCNDBP1-204ENST00000563065 PRDM2Q13029 1718 aa30.87■■■□□ 2.53
CCNDBP1-204ENST00000563065 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.81■■■□□ 2.52
CCNDBP1-204ENST00000563065 CUX2O14529 1486 aa30.76■■■□□ 2.52
CCNDBP1-204ENST00000563065 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.7■■■□□ 2.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 WDR62O43379 1518 aa30.69■■■□□ 2.5
CCNDBP1-204ENST00000563065 TOPBP1Q92547 1522 aa30.52■■■□□ 2.48
CCNDBP1-204ENST00000563065 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.46■■■□□ 2.47
CCNDBP1-204ENST00000563065 ABCC8Q09428 1581 aa30.44■■■□□ 2.46
CCNDBP1-204ENST00000563065 CUX1P39880 1505 aa30.39■■■□□ 2.46
CCNDBP1-204ENST00000563065 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.28■■■□□ 2.44
CCNDBP1-204ENST00000563065 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.25■■■□□ 2.43
CCNDBP1-204ENST00000563065 FGD5Q6ZNL6 1462 aa30.24■■■□□ 2.43
CCNDBP1-204ENST00000563065 IFT140Q96RY7 1462 aa30.24■■■□□ 2.43
CCNDBP1-204ENST00000563065 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.22■■■□□ 2.43
CCNDBP1-204ENST00000563065 SYNJ1O43426 1573 aa30.19■■■□□ 2.42
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.19■■■□□ 2.42
CCNDBP1-204ENST00000563065 SOGA1O94964 1423 aa30.18■■■□□ 2.42
CCNDBP1-204ENST00000563065 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30.15■■■□□ 2.42
CCNDBP1-204ENST00000563065 TOP2BQ02880 1626 aa30.13■■■□□ 2.41
CCNDBP1-204ENST00000563065 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.1■■■□□ 2.41
CCNDBP1-204ENST00000563065 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.05■■■□□ 2.42e-6■■□□□ 13.6
CCNDBP1-204ENST00000563065 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
CCNDBP1-204ENST00000563065 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.98■■■□□ 2.39
CCNDBP1-204ENST00000563065 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.92■■■□□ 2.38
CCNDBP1-204ENST00000563065 WDR97A6NE52 1622 aa29.91■■■□□ 2.38
CCNDBP1-204ENST00000563065 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.81■■■□□ 2.36
CCNDBP1-204ENST00000563065 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.77■■■□□ 2.36
CCNDBP1-204ENST00000563065 GRIN2BQ13224 1484 aa29.75■■■□□ 2.35
CCNDBP1-204ENST00000563065 TRIM41Q8WV44 630 aa29.75■■■□□ 2.35
CCNDBP1-204ENST00000563065 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.72■■■□□ 2.35
CCNDBP1-204ENST00000563065 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.71■■■□□ 2.35
CCNDBP1-204ENST00000563065 FBLN2P98095 1184 aa29.69■■■□□ 2.34
CCNDBP1-204ENST00000563065 PBRM1Q86U86 1689 aa29.69■■■□□ 2.34
CCNDBP1-204ENST00000563065 OSCARQ8IYS5 282 aa29.64■■■□□ 2.34
CCNDBP1-204ENST00000563065 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.62■■■□□ 2.33
CCNDBP1-204ENST00000563065 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.59■■■□□ 2.33
CCNDBP1-204ENST00000563065 KIF27Q86VH2 1401 aa29.58■■■□□ 2.33
CCNDBP1-204ENST00000563065 CHD1O14646 1710 aa29.58■■■□□ 2.33
CCNDBP1-204ENST00000563065 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.56■■■□□ 2.32
CCNDBP1-204ENST00000563065 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.54■■■□□ 2.32
CCNDBP1-204ENST00000563065 SYNJ2O15056 1496 aa29.53■■■□□ 2.32
CCNDBP1-204ENST00000563065 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.52■■■□□ 2.32
CCNDBP1-204ENST00000563065 IGF1RP08069 1367 aa29.51■■■□□ 2.32
CCNDBP1-204ENST00000563065 ADAMTS12P58397 1594 aa29.47■■■□□ 2.31
CCNDBP1-204ENST00000563065 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.45■■■□□ 2.31
CCNDBP1-204ENST00000563065 GRIN2AQ12879 1464 aa29.38■■■□□ 2.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa29.32■■■□□ 2.28
CCNDBP1-204ENST00000563065 CUL7Q14999 1698 aa29.28■■■□□ 2.28
CCNDBP1-204ENST00000563065 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.25■■■□□ 2.27
CCNDBP1-204ENST00000563065 CEP170Q5SW79 1584 aa29.24■■■□□ 2.27
CCNDBP1-204ENST00000563065 NUP160Q12769 1436 aa29.24■■■□□ 2.27
CCNDBP1-204ENST00000563065 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP29.23■■■□□ 2.27
CCNDBP1-204ENST00000563065 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29.17■■■□□ 2.26
CCNDBP1-204ENST00000563065 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.13■■■□□ 2.25
CCNDBP1-204ENST00000563065 ARHGEF11O15085 1522 aa29.12■■■□□ 2.25
CCNDBP1-204ENST00000563065 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.1■■■□□ 2.25
CCNDBP1-204ENST00000563065 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.1■■■□□ 2.25
CCNDBP1-204ENST00000563065 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.1■■■□□ 2.25
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