RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437078.6

RABGEF1-210, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 4,319 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-210ENST00000437078 NISCHQ9Y2I1 1504 aa26.84■■□□□ 1.89
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RABGEF1-210ENST00000437078 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.42■■□□□ 1.5
RABGEF1-210ENST00000437078 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
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RABGEF1-210ENST00000437078 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
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RABGEF1-210ENST00000437078 ABCC9O60706 1549 aa22.37■■□□□ 1.17
RABGEF1-210ENST00000437078 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa22.27■■□□□ 1.16
RABGEF1-210ENST00000437078 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa22.22■■□□□ 1.15
RABGEF1-210ENST00000437078 PCGF6Q9BYE7 350 aa22.21■■□□□ 1.15
RABGEF1-210ENST00000437078 TRIM41Q8WV44 630 aa22.03■■□□□ 1.12
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RABGEF1-210ENST00000437078 SCRIBQ14160 1630 aa21.93■■□□□ 1.1
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RABGEF1-210ENST00000437078 MYO15BQ96JP2 1530 aa21.85■■□□□ 1.09
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RABGEF1-210ENST00000437078 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.86
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RABGEF1-210ENST00000437078 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP20.39■□□□□ 0.85
RABGEF1-210ENST00000437078 CEP162Q5TB80 1403 aa20.37■□□□□ 0.85
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RABGEF1-210ENST00000437078 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa19.99■□□□□ 0.79
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RABGEF1-210ENST00000437078 CEP164Q9UPV0 1460 aa19.95■□□□□ 0.78
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RABGEF1-210ENST00000437078 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa19.51■□□□□ 0.71
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RABGEF1-210ENST00000437078 FANCD2Q9BXW9 1451 aa19.5■□□□□ 0.71
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