RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569745.5

CCNDBP1-215, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 1,356 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-215ENST00000569745 NISCHQ9Y2I1 1504 aa40.14■■■■■ 4.02
CCNDBP1-215ENST00000569745 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa35.69■■■■□ 3.3
CCNDBP1-215ENST00000569745 ABCC9O60706 1549 aa35.33■■■■□ 3.25
CCNDBP1-215ENST00000569745 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.82■■■■□ 3
CCNDBP1-215ENST00000569745 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.8■■■■□ 3
CCNDBP1-215ENST00000569745 NACADO15069 1562 aa33.72■■■□□ 2.99
CCNDBP1-215ENST00000569745 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.43■■■□□ 2.94
CCNDBP1-215ENST00000569745 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.34■■■□□ 2.93
CCNDBP1-215ENST00000569745 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.18■■■□□ 2.9
CCNDBP1-215ENST00000569745 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP33.05■■■□□ 2.88
CCNDBP1-215ENST00000569745 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.9■■■□□ 2.86
CCNDBP1-215ENST00000569745 BICRAQ9NZM4 1560 aa32.77■■■□□ 2.84
CCNDBP1-215ENST00000569745 DNAJC5BQ9UF47 199 aa32.76■■■□□ 2.83
CCNDBP1-215ENST00000569745 SCRIBQ14160 1630 aa32.59■■■□□ 2.81
CCNDBP1-215ENST00000569745 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.43■■■□□ 2.78
CCNDBP1-215ENST00000569745 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.96■■■□□ 2.71
CCNDBP1-215ENST00000569745 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.89■■■□□ 2.7
CCNDBP1-215ENST00000569745 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.78■■■□□ 2.68
CCNDBP1-215ENST00000569745 NCAPD3P42695 1498 aa31.17■■■□□ 2.58
CCNDBP1-215ENST00000569745 SMARCA4P51532 1647 aa31.14■■■□□ 2.58
CCNDBP1-215ENST00000569745 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.12■■■□□ 2.57
CCNDBP1-215ENST00000569745 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.11■■■□□ 2.57
CCNDBP1-215ENST00000569745 SMARCA2P51531 1590 aa31.03■■■□□ 2.56
CCNDBP1-215ENST00000569745 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.92■■■□□ 2.54
CCNDBP1-215ENST00000569745 HMGXB3Q12766 1538 aa30.91■■■□□ 2.54
CCNDBP1-215ENST00000569745 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.86■■■□□ 2.53
CCNDBP1-215ENST00000569745 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.84■■■□□ 2.53
CCNDBP1-215ENST00000569745 WIZO95785 1651 aa30.53■■■□□ 2.48
CCNDBP1-215ENST00000569745 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.51■■■□□ 2.47
CCNDBP1-215ENST00000569745 ERCC6Q03468 1493 aa30.48■■■□□ 2.47
CCNDBP1-215ENST00000569745 NESP48681 1621 aa30.47■■■□□ 2.47
CCNDBP1-215ENST00000569745 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.33■■■□□ 2.45
CCNDBP1-215ENST00000569745 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.27■■■□□ 2.44
CCNDBP1-215ENST00000569745 CUX2O14529 1486 aa30.24■■■□□ 2.43
CCNDBP1-215ENST00000569745 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.22■■■□□ 2.43
CCNDBP1-215ENST00000569745 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.2■■■□□ 2.42
CCNDBP1-215ENST00000569745 CFTRP13569 1480 aa29.99■■■□□ 2.39
CCNDBP1-215ENST00000569745 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.99■■■□□ 2.39
CCNDBP1-215ENST00000569745 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
CCNDBP1-215ENST00000569745 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.91■■■□□ 2.38
CCNDBP1-215ENST00000569745 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.9■■■□□ 2.38
CCNDBP1-215ENST00000569745 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.88■■■□□ 2.37
CCNDBP1-215ENST00000569745 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.87■■■□□ 2.37
CCNDBP1-215ENST00000569745 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.85■■■□□ 2.37
CCNDBP1-215ENST00000569745 WDR62O43379 1518 aa29.74■■■□□ 2.35
CCNDBP1-215ENST00000569745 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.6■■■□□ 2.33
CCNDBP1-215ENST00000569745 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.58■■■□□ 2.33
CCNDBP1-215ENST00000569745 PRDM2Q13029 1718 aa29.53■■■□□ 2.32
CCNDBP1-215ENST00000569745 ABCC8Q09428 1581 aa29.37■■■□□ 2.29
CCNDBP1-215ENST00000569745 TOPBP1Q92547 1522 aa29.35■■■□□ 2.29
CCNDBP1-215ENST00000569745 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.26■■■□□ 2.27
CCNDBP1-215ENST00000569745 IFT140Q96RY7 1462 aa29.26■■■□□ 2.27
CCNDBP1-215ENST00000569745 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.14■■■□□ 2.26
CCNDBP1-215ENST00000569745 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.09■■■□□ 2.25
CCNDBP1-215ENST00000569745 OSCARQ8IYS5 282 aa29.06■■■□□ 2.24
CCNDBP1-215ENST00000569745 SOGA1O94964 1423 aa29.02■■■□□ 2.24
CCNDBP1-215ENST00000569745 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
CCNDBP1-215ENST00000569745 CUX1P39880 1505 aa29■■■□□ 2.23
CCNDBP1-215ENST00000569745 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.98■■■□□ 2.23
CCNDBP1-215ENST00000569745 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.98■■■□□ 2.232e-6■■□□□ 13.6
CCNDBP1-215ENST00000569745 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.97■■■□□ 2.23
CCNDBP1-215ENST00000569745 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
CCNDBP1-215ENST00000569745 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
CCNDBP1-215ENST00000569745 TRIM41Q8WV44 630 aa28.78■■■□□ 2.2
CCNDBP1-215ENST00000569745 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.77■■■□□ 2.2
CCNDBP1-215ENST00000569745 FBLN2P98095 1184 aa28.75■■■□□ 2.19
CCNDBP1-215ENST00000569745 WDR97A6NE52 1622 aa28.75■■■□□ 2.19
CCNDBP1-215ENST00000569745 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.68■■■□□ 2.18
CCNDBP1-215ENST00000569745 GRIN2BQ13224 1484 aa28.68■■■□□ 2.18
CCNDBP1-215ENST00000569745 TOP2BQ02880 1626 aa28.67■■■□□ 2.18
CCNDBP1-215ENST00000569745 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.66■■■□□ 2.18
CCNDBP1-215ENST00000569745 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.65■■■□□ 2.18
CCNDBP1-215ENST00000569745 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.63■■■□□ 2.17
CCNDBP1-215ENST00000569745 SYNJ1O43426 1573 aa28.63■■■□□ 2.17
CCNDBP1-215ENST00000569745 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.62■■■□□ 2.17
CCNDBP1-215ENST00000569745 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
CCNDBP1-215ENST00000569745 CHD1O14646 1710 aa28.58■■■□□ 2.17
CCNDBP1-215ENST00000569745 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.52■■■□□ 2.16
CCNDBP1-215ENST00000569745 SYNJ2O15056 1496 aa28.52■■■□□ 2.16
CCNDBP1-215ENST00000569745 ARHGEF11O15085 1522 aa28.46■■■□□ 2.15
CCNDBP1-215ENST00000569745 PBRM1Q86U86 1689 aa28.46■■■□□ 2.15
CCNDBP1-215ENST00000569745 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa28.45■■■□□ 2.15
CCNDBP1-215ENST00000569745 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa28.45■■■□□ 2.15
CCNDBP1-215ENST00000569745 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa28.45■■■□□ 2.15
CCNDBP1-215ENST00000569745 CYB5RLQ6IPT4 315 aa28.34■■■□□ 2.13
CCNDBP1-215ENST00000569745 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.34■■■□□ 2.13
CCNDBP1-215ENST00000569745 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.32■■■□□ 2.12
CCNDBP1-215ENST00000569745 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.32■■■□□ 2.12
CCNDBP1-215ENST00000569745 GRIN2AQ12879 1464 aa28.29■■■□□ 2.12
CCNDBP1-215ENST00000569745 ADAMTS12P58397 1594 aa28.27■■■□□ 2.12
CCNDBP1-215ENST00000569745 ARAP1Q96P48 1450 aa28.21■■■□□ 2.11
CCNDBP1-215ENST00000569745 KIF27Q86VH2 1401 aa28.2■■■□□ 2.1
CCNDBP1-215ENST00000569745 NUP160Q12769 1436 aa28.18■■■□□ 2.1
CCNDBP1-215ENST00000569745 IGF1RP08069 1367 aa28.16■■■□□ 2.1
CCNDBP1-215ENST00000569745 CEP170Q5SW79 1584 aa28.12■■■□□ 2.09
CCNDBP1-215ENST00000569745 JPH4Q96JJ6 628 aa27.99■■■□□ 2.07
CCNDBP1-215ENST00000569745 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.98■■■□□ 2.07
CCNDBP1-215ENST00000569745 CUL7Q14999 1698 aa27.95■■■□□ 2.07
CCNDBP1-215ENST00000569745 ERCC6L2Q5T890 1561 aa27.93■■■□□ 2.06
CCNDBP1-215ENST00000569745 SHROOM2Q13796 1616 aa27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14 ms