Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC85BQ15834 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC85BQ15834 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC85BQ15834 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC85BQ15834 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC85BQ15834 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC85BQ15834 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC85BQ15834 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC85BQ15834 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC85BQ15834 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC85BQ15834 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC85BQ15834 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC85BQ15834 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC85BQ15834 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC85BQ15834 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC85BQ15834 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC85BQ15834 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC85BQ15834 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC85BQ15834 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC85BQ15834 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC85BQ15834 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC85BQ15834 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCDC85BQ15834 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCDC85BQ15834 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC85BQ15834 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC85BQ15834 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCDC85BQ15834 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC85BQ15834 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC85BQ15834 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC85BQ15834 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC85BQ15834 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC85BQ15834 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC85BQ15834 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC85BQ15834 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC85BQ15834 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC85BQ15834 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC85BQ15834 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC85BQ15834 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC85BQ15834 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC85BQ15834 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC85BQ15834 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC85BQ15834 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC85BQ15834 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC85BQ15834 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC85BQ15834 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC85BQ15834 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC85BQ15834 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC85BQ15834 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC85BQ15834 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC85BQ15834 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC85BQ15834 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC85BQ15834 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC85BQ15834 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC85BQ15834 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC85BQ15834 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC85BQ15834 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC85BQ15834 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC85BQ15834 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC85BQ15834 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC85BQ15834 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC85BQ15834 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC85BQ15834 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC85BQ15834 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC85BQ15834 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC85BQ15834 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC85BQ15834 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC85BQ15834 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC85BQ15834 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC85BQ15834 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC85BQ15834 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC85BQ15834 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC85BQ15834 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC85BQ15834 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC85BQ15834 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC85BQ15834 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC85BQ15834 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC85BQ15834 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC85BQ15834 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC85BQ15834 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC85BQ15834 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC85BQ15834 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC85BQ15834 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC85BQ15834 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC85BQ15834 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC85BQ15834 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC85BQ15834 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC85BQ15834 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC85BQ15834 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC85BQ15834 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC85BQ15834 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC85BQ15834 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC85BQ15834 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC85BQ15834 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC85BQ15834 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC85BQ15834 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC85BQ15834 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC85BQ15834 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC85BQ15834 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC85BQ15834 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC85BQ15834 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
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