Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
GRIN2AQ12879 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.76■■■■□ 3.79
GRIN2AQ12879 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
GRIN2AQ12879 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC38.75■■■■□ 3.79
GRIN2AQ12879 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
GRIN2AQ12879 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC38.75■■■■□ 3.79
GRIN2AQ12879 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
GRIN2AQ12879 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
GRIN2AQ12879 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
GRIN2AQ12879 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
GRIN2AQ12879 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.73■■■■□ 3.79
GRIN2AQ12879 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
GRIN2AQ12879 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.72■■■■□ 3.79
GRIN2AQ12879 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
GRIN2AQ12879 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
GRIN2AQ12879 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
GRIN2AQ12879 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
GRIN2AQ12879 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
GRIN2AQ12879 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
GRIN2AQ12879 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC38.7■■■■□ 3.79
GRIN2AQ12879 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
GRIN2AQ12879 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
GRIN2AQ12879 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
GRIN2AQ12879 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC38.7■■■■□ 3.79
GRIN2AQ12879 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
GRIN2AQ12879 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
GRIN2AQ12879 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC38.69■■■■□ 3.78
GRIN2AQ12879 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
GRIN2AQ12879 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
GRIN2AQ12879 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
GRIN2AQ12879 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
GRIN2AQ12879 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC38.67■■■■□ 3.78
GRIN2AQ12879 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC38.66■■■■□ 3.78
GRIN2AQ12879 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC38.66■■■■□ 3.78
GRIN2AQ12879 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC38.66■■■■□ 3.78
GRIN2AQ12879 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
GRIN2AQ12879 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
GRIN2AQ12879 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
GRIN2AQ12879 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
GRIN2AQ12879 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.65■■■■□ 3.78
GRIN2AQ12879 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
GRIN2AQ12879 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
GRIN2AQ12879 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC38.64■■■■□ 3.78
GRIN2AQ12879 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
GRIN2AQ12879 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
GRIN2AQ12879 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC38.64■■■■□ 3.78
GRIN2AQ12879 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.78
GRIN2AQ12879 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
GRIN2AQ12879 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
GRIN2AQ12879 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC38.62■■■■□ 3.77
GRIN2AQ12879 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
GRIN2AQ12879 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC38.62■■■■□ 3.77
GRIN2AQ12879 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC38.62■■■■□ 3.77
GRIN2AQ12879 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
GRIN2AQ12879 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
GRIN2AQ12879 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
GRIN2AQ12879 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
GRIN2AQ12879 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
GRIN2AQ12879 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
GRIN2AQ12879 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
GRIN2AQ12879 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
GRIN2AQ12879 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
GRIN2AQ12879 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
GRIN2AQ12879 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
GRIN2AQ12879 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
GRIN2AQ12879 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.76
GRIN2AQ12879 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC38.56■■■■□ 3.76
GRIN2AQ12879 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.56■■■■□ 3.76
GRIN2AQ12879 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
GRIN2AQ12879 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC38.55■■■■□ 3.76
GRIN2AQ12879 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
GRIN2AQ12879 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
GRIN2AQ12879 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
GRIN2AQ12879 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC38.54■■■■□ 3.76
GRIN2AQ12879 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
GRIN2AQ12879 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
GRIN2AQ12879 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
GRIN2AQ12879 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
GRIN2AQ12879 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
GRIN2AQ12879 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
GRIN2AQ12879 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
GRIN2AQ12879 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
GRIN2AQ12879 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
GRIN2AQ12879 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
GRIN2AQ12879 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC38.52■■■■□ 3.76
GRIN2AQ12879 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
GRIN2AQ12879 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC38.52■■■■□ 3.76
GRIN2AQ12879 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
GRIN2AQ12879 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC38.51■■■■□ 3.76
GRIN2AQ12879 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.75
GRIN2AQ12879 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
GRIN2AQ12879 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC38.5■■■■□ 3.75
GRIN2AQ12879 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC38.5■■■■□ 3.75
GRIN2AQ12879 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
GRIN2AQ12879 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC38.49■■■■□ 3.75
GRIN2AQ12879 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.49■■■■□ 3.75
GRIN2AQ12879 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
GRIN2AQ12879 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
GRIN2AQ12879 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC38.47■■■■□ 3.75
GRIN2AQ12879 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC38.47■■■■□ 3.75
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