RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368456.1

PYGO2-201, Transcript of pygopus family PHD finger 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PYGO2, Length 1,306 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYGO2-201ENST00000368456 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.79■■■■■ 6.36
PYGO2-201ENST00000368456 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa48.66■■■■■ 5.38
PYGO2-201ENST00000368456 ABCC9O60706 1549 aa47.9■■■■■ 5.26
PYGO2-201ENST00000368456 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.91■■■■■ 4.94
PYGO2-201ENST00000368456 NACADO15069 1562 aa45.87■■■■■ 4.93
PYGO2-201ENST00000368456 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.77■■■■■ 4.92
PYGO2-201ENST00000368456 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.59■■■■■ 4.89
PYGO2-201ENST00000368456 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.58■■■■■ 4.89
PYGO2-201ENST00000368456 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.32■■■■■ 4.85
PYGO2-201ENST00000368456 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.9■■■■■ 4.78
PYGO2-201ENST00000368456 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.79■■■■■ 4.76
PYGO2-201ENST00000368456 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.69■■■■■ 4.74
PYGO2-201ENST00000368456 SCRIBQ14160 1630 aa44.41■■■■■ 4.7
PYGO2-201ENST00000368456 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.36■■■■■ 4.69
PYGO2-201ENST00000368456 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.07■■■■■ 4.65
PYGO2-201ENST00000368456 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.44■■■■■ 4.55
PYGO2-201ENST00000368456 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.31■■■■■ 4.52
PYGO2-201ENST00000368456 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.05■■■■■ 4.48
PYGO2-201ENST00000368456 SMARCA4P51532 1647 aa42.49■■■■■ 4.39
PYGO2-201ENST00000368456 NCAPD3P42695 1498 aa42.42■■■■■ 4.38
PYGO2-201ENST00000368456 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.4■■■■■ 4.38
PYGO2-201ENST00000368456 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.4■■■■■ 4.38
PYGO2-201ENST00000368456 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.24■■■■■ 4.35
PYGO2-201ENST00000368456 SMARCA2P51531 1590 aa42.22■■■■■ 4.35
PYGO2-201ENST00000368456 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.14■■■■■ 4.34
PYGO2-201ENST00000368456 HMGXB3Q12766 1538 aa42.1■■■■■ 4.33
PYGO2-201ENST00000368456 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.93■■■■■ 4.3
PYGO2-201ENST00000368456 WIZO95785 1651 aa41.72■■■■■ 4.27
PYGO2-201ENST00000368456 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.71■■■■■ 4.27
PYGO2-201ENST00000368456 NESP48681 1621 aa41.45■■■■■ 4.23
PYGO2-201ENST00000368456 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.24■■■■■ 4.19
PYGO2-201ENST00000368456 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.22■■■■■ 4.19
PYGO2-201ENST00000368456 ERCC6Q03468 1493 aa41.19■■■■■ 4.18
PYGO2-201ENST00000368456 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.14■■■■■ 4.18
PYGO2-201ENST00000368456 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.96■■■■■ 4.15
PYGO2-201ENST00000368456 CUX2O14529 1486 aa40.91■■■■■ 4.14
PYGO2-201ENST00000368456 CFTRP13569 1480 aa40.87■■■■■ 4.13
PYGO2-201ENST00000368456 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.84■■■■■ 4.13
PYGO2-201ENST00000368456 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.83■■■■■ 4.13
PYGO2-201ENST00000368456 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.8■■■■■ 4.12
PYGO2-201ENST00000368456 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.63■■■■■ 4.1
PYGO2-201ENST00000368456 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.55■■■■■ 4.08
PYGO2-201ENST00000368456 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.54■■■■■ 4.08
PYGO2-201ENST00000368456 WDR62O43379 1518 aa40.46■■■■■ 4.07
PYGO2-201ENST00000368456 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.4■■■■■ 4.06
PYGO2-201ENST00000368456 PRDM2Q13029 1718 aa40.33■■■■■ 4.05
PYGO2-201ENST00000368456 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.29■■■■■ 4.04
PYGO2-201ENST00000368456 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.02■■■■■ 4
PYGO2-201ENST00000368456 TOPBP1Q92547 1522 aa39.97■■■■□ 3.99
PYGO2-201ENST00000368456 ABCC8Q09428 1581 aa39.88■■■■□ 3.98
PYGO2-201ENST00000368456 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.85■■■■□ 3.97
PYGO2-201ENST00000368456 IFT140Q96RY7 1462 aa39.73■■■■□ 3.95
PYGO2-201ENST00000368456 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.65■■■■□ 3.94
PYGO2-201ENST00000368456 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.63■■■■□ 3.93
PYGO2-201ENST00000368456 CUX1P39880 1505 aa39.62■■■■□ 3.93
PYGO2-201ENST00000368456 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.56■■■■□ 3.92
PYGO2-201ENST00000368456 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.49■■■■□ 3.91
PYGO2-201ENST00000368456 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.48■■■■□ 3.91
PYGO2-201ENST00000368456 SOGA1O94964 1423 aa39.46■■■■□ 3.91
PYGO2-201ENST00000368456 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.39■■■■□ 3.91e-10■■■■■ 33
PYGO2-201ENST00000368456 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.38■■■■□ 3.89
PYGO2-201ENST00000368456 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.29■■■■□ 3.88
PYGO2-201ENST00000368456 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.24■■■■□ 3.87
PYGO2-201ENST00000368456 OSCARQ8IYS5 282 aa39.21■■■■□ 3.87
PYGO2-201ENST00000368456 SYNJ1O43426 1573 aa39.17■■■■□ 3.86
PYGO2-201ENST00000368456 TOP2BQ02880 1626 aa39.17■■■■□ 3.86
PYGO2-201ENST00000368456 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.15■■■■□ 3.86
PYGO2-201ENST00000368456 WDR97A6NE52 1622 aa39.14■■■■□ 3.86
PYGO2-201ENST00000368456 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.11■■■■□ 3.85
PYGO2-201ENST00000368456 GRIN2BQ13224 1484 aa38.99■■■■□ 3.83
PYGO2-201ENST00000368456 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.97■■■■□ 3.83
PYGO2-201ENST00000368456 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.96■■■■□ 3.83
PYGO2-201ENST00000368456 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.94■■■■□ 3.82
PYGO2-201ENST00000368456 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.89■■■■□ 3.82
PYGO2-201ENST00000368456 CHD1O14646 1710 aa38.88■■■■□ 3.82
PYGO2-201ENST00000368456 FBLN2P98095 1184 aa38.85■■■■□ 3.81
PYGO2-201ENST00000368456 PBRM1Q86U86 1689 aa38.81■■■■□ 3.8
PYGO2-201ENST00000368456 SYNJ2O15056 1496 aa38.75■■■■□ 3.79
PYGO2-201ENST00000368456 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.74■■■■□ 3.79
PYGO2-201ENST00000368456 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.59■■■■□ 3.77
PYGO2-201ENST00000368456 ARHGEF11O15085 1522 aa38.58■■■■□ 3.77
PYGO2-201ENST00000368456 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa38.57■■■■□ 3.77
PYGO2-201ENST00000368456 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.57■■■■□ 3.77
PYGO2-201ENST00000368456 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.57■■■■□ 3.77
PYGO2-201ENST00000368456 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.57■■■■□ 3.76
PYGO2-201ENST00000368456 ADAMTS12P58397 1594 aa38.56■■■■□ 3.76
PYGO2-201ENST00000368456 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.52■■■■□ 3.76
PYGO2-201ENST00000368456 GRIN2AQ12879 1464 aa38.5■■■■□ 3.75
PYGO2-201ENST00000368456 TRIM41Q8WV44 630 aa38.48■■■■□ 3.75
PYGO2-201ENST00000368456 IGF1RP08069 1367 aa38.42■■■■□ 3.74
PYGO2-201ENST00000368456 KIF27Q86VH2 1401 aa38.42■■■■□ 3.74
PYGO2-201ENST00000368456 NUP160Q12769 1436 aa38.39■■■■□ 3.74
PYGO2-201ENST00000368456 CEP170Q5SW79 1584 aa38.33■■■■□ 3.73
PYGO2-201ENST00000368456 ARAP1Q96P48 1450 aa38.29■■■■□ 3.72
PYGO2-201ENST00000368456 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.25■■■■□ 3.71
PYGO2-201ENST00000368456 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.14■■■■□ 3.7
PYGO2-201ENST00000368456 CUL7Q14999 1698 aa38.13■■■■□ 3.69
PYGO2-201ENST00000368456 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.11■■■■□ 3.69
PYGO2-201ENST00000368456 SHROOM2Q13796 1616 aa38.08■■■■□ 3.69
PYGO2-201ENST00000368456 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.07■■■■□ 3.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 201.5 ms