Protein–RNA interactions for Protein: P43146

DCC, Netrin receptor DCC, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCCP43146 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
DCCP43146 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
DCCP43146 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
DCCP43146 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
DCCP43146 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
DCCP43146 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
DCCP43146 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
DCCP43146 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
DCCP43146 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
DCCP43146 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
DCCP43146 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
DCCP43146 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
DCCP43146 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
DCCP43146 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
DCCP43146 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
DCCP43146 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
DCCP43146 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
DCCP43146 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
DCCP43146 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
DCCP43146 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
DCCP43146 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
DCCP43146 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
DCCP43146 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
DCCP43146 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
DCCP43146 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
DCCP43146 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
DCCP43146 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
DCCP43146 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
DCCP43146 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
DCCP43146 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
DCCP43146 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
DCCP43146 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
DCCP43146 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
DCCP43146 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
DCCP43146 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
DCCP43146 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
DCCP43146 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
DCCP43146 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
DCCP43146 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
DCCP43146 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
DCCP43146 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
DCCP43146 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
DCCP43146 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
DCCP43146 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
DCCP43146 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
DCCP43146 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
DCCP43146 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
DCCP43146 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
DCCP43146 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
DCCP43146 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
DCCP43146 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
DCCP43146 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
DCCP43146 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
DCCP43146 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.84
DCCP43146 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
DCCP43146 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
DCCP43146 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
DCCP43146 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
DCCP43146 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
DCCP43146 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
DCCP43146 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
DCCP43146 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
DCCP43146 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
DCCP43146 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
DCCP43146 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
DCCP43146 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
DCCP43146 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
DCCP43146 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
DCCP43146 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
DCCP43146 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
DCCP43146 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
DCCP43146 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
DCCP43146 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
DCCP43146 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
DCCP43146 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
DCCP43146 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
DCCP43146 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
DCCP43146 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
DCCP43146 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
DCCP43146 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
DCCP43146 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
DCCP43146 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
DCCP43146 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
DCCP43146 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
DCCP43146 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
DCCP43146 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
DCCP43146 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
DCCP43146 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
DCCP43146 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
DCCP43146 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
DCCP43146 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
DCCP43146 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
DCCP43146 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
DCCP43146 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC32.68■■■□□ 2.82
DCCP43146 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
DCCP43146 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
DCCP43146 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
DCCP43146 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
DCCP43146 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
DCCP43146 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms