Protein–RNA interactions for Protein: P17658

KCNA6, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 6, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA6P17658 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
KCNA6P17658 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
KCNA6P17658 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
KCNA6P17658 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
KCNA6P17658 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
KCNA6P17658 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
KCNA6P17658 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
KCNA6P17658 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
KCNA6P17658 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
KCNA6P17658 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
KCNA6P17658 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
KCNA6P17658 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
KCNA6P17658 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
KCNA6P17658 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
KCNA6P17658 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
KCNA6P17658 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
KCNA6P17658 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
KCNA6P17658 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
KCNA6P17658 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
KCNA6P17658 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
KCNA6P17658 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
KCNA6P17658 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
KCNA6P17658 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
KCNA6P17658 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
KCNA6P17658 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
KCNA6P17658 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
KCNA6P17658 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
KCNA6P17658 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
KCNA6P17658 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
KCNA6P17658 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
KCNA6P17658 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
KCNA6P17658 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
KCNA6P17658 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
KCNA6P17658 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
KCNA6P17658 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
KCNA6P17658 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
KCNA6P17658 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC33.4■■■□□ 2.94
KCNA6P17658 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
KCNA6P17658 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
KCNA6P17658 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
KCNA6P17658 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
KCNA6P17658 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
KCNA6P17658 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
KCNA6P17658 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
KCNA6P17658 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
KCNA6P17658 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
KCNA6P17658 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
KCNA6P17658 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
KCNA6P17658 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
KCNA6P17658 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
KCNA6P17658 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
KCNA6P17658 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
KCNA6P17658 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
KCNA6P17658 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
KCNA6P17658 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
KCNA6P17658 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
KCNA6P17658 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
KCNA6P17658 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
KCNA6P17658 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
KCNA6P17658 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
KCNA6P17658 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
KCNA6P17658 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
KCNA6P17658 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
KCNA6P17658 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
KCNA6P17658 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
KCNA6P17658 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
KCNA6P17658 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
KCNA6P17658 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
KCNA6P17658 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
KCNA6P17658 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
KCNA6P17658 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
KCNA6P17658 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
KCNA6P17658 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
KCNA6P17658 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
KCNA6P17658 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
KCNA6P17658 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
KCNA6P17658 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
KCNA6P17658 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
KCNA6P17658 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
KCNA6P17658 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
KCNA6P17658 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
KCNA6P17658 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
KCNA6P17658 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
KCNA6P17658 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
KCNA6P17658 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
KCNA6P17658 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
KCNA6P17658 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
KCNA6P17658 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
KCNA6P17658 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
KCNA6P17658 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
KCNA6P17658 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC33.27■■■□□ 2.92
KCNA6P17658 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
KCNA6P17658 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
KCNA6P17658 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
KCNA6P17658 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
KCNA6P17658 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
KCNA6P17658 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
KCNA6P17658 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
KCNA6P17658 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
KCNA6P17658 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms