Protein–RNA interactions for Protein: P17658

KCNA6, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 6, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA6P17658 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC49.53■■■■■ 5.52
KCNA6P17658 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC49.4■■■■■ 5.5
KCNA6P17658 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC48.93■■■■■ 5.42
KCNA6P17658 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.32■■■■■ 5.33
KCNA6P17658 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.7■■■■■ 5.23
KCNA6P17658 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.34■■■■■ 5.17
KCNA6P17658 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.28■■■■■ 5.16
KCNA6P17658 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.22■■■■■ 5.15
KCNA6P17658 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC47.14■■■■■ 5.14
KCNA6P17658 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC47.09■■■■■ 5.13
KCNA6P17658 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.85■■■■■ 5.09
KCNA6P17658 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC46.76■■■■■ 5.08
KCNA6P17658 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.75■■■■■ 5.07
KCNA6P17658 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC46.71■■■■■ 5.07
KCNA6P17658 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC46.71■■■■■ 5.07
KCNA6P17658 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.55■■■■■ 5.04
KCNA6P17658 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.02■■■■■ 4.96
KCNA6P17658 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.97■■■■■ 4.95
KCNA6P17658 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.94■■■■■ 4.95
KCNA6P17658 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.81■■■■■ 4.92
KCNA6P17658 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.79■■■■■ 4.92
KCNA6P17658 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC45.79■■■■■ 4.92
KCNA6P17658 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC45.74■■■■■ 4.91
KCNA6P17658 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.72■■■■■ 4.91
KCNA6P17658 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45.65■■■■■ 4.9
KCNA6P17658 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.56■■■■■ 4.88
KCNA6P17658 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC45.48■■■■■ 4.87
KCNA6P17658 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC45.34■■■■■ 4.85
KCNA6P17658 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC45.28■■■■■ 4.84
KCNA6P17658 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.22■■■■■ 4.83
KCNA6P17658 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC45.08■■■■■ 4.81
KCNA6P17658 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.78
KCNA6P17658 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC44.74■■■■■ 4.75
KCNA6P17658 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC44.73■■■■■ 4.75
KCNA6P17658 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC44.73■■■■■ 4.75
KCNA6P17658 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
KCNA6P17658 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC44.65■■■■■ 4.74
KCNA6P17658 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC44.47■■■■■ 4.71
KCNA6P17658 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC44.25■■■■■ 4.67
KCNA6P17658 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC44.18■■■■■ 4.66
KCNA6P17658 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
KCNA6P17658 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.04■■■■■ 4.64
KCNA6P17658 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
KCNA6P17658 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC43.88■■■■■ 4.61
KCNA6P17658 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
KCNA6P17658 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC43.84■■■■■ 4.61
KCNA6P17658 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
KCNA6P17658 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC43.81■■■■■ 4.6
KCNA6P17658 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
KCNA6P17658 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.58
KCNA6P17658 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.57
KCNA6P17658 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC43.6■■■■■ 4.57
KCNA6P17658 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC43.58■■■■■ 4.57
KCNA6P17658 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC43.54■■■■■ 4.56
KCNA6P17658 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC43.53■■■■■ 4.56
KCNA6P17658 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
KCNA6P17658 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
KCNA6P17658 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC43.44■■■■■ 4.54
KCNA6P17658 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC43.38■■■■■ 4.53
KCNA6P17658 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
KCNA6P17658 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
KCNA6P17658 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.31■■■■■ 4.52
KCNA6P17658 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
KCNA6P17658 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.27■■■■■ 4.52
KCNA6P17658 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC43.14■■■■■ 4.5
KCNA6P17658 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC43.13■■■■■ 4.49
KCNA6P17658 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
KCNA6P17658 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
KCNA6P17658 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
KCNA6P17658 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
KCNA6P17658 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC43■■■■■ 4.47
KCNA6P17658 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
KCNA6P17658 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC42.89■■■■■ 4.46
KCNA6P17658 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
KCNA6P17658 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC42.79■■■■■ 4.44
KCNA6P17658 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
KCNA6P17658 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC42.77■■■■■ 4.44
KCNA6P17658 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC42.75■■■■■ 4.43
KCNA6P17658 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
KCNA6P17658 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
KCNA6P17658 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
KCNA6P17658 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
KCNA6P17658 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
KCNA6P17658 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC42.67■■■■■ 4.42
KCNA6P17658 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.62■■■■■ 4.41
KCNA6P17658 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
KCNA6P17658 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC42.6■■■■■ 4.41
KCNA6P17658 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC42.59■■■■■ 4.41
KCNA6P17658 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
KCNA6P17658 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC42.52■■■■■ 4.4
KCNA6P17658 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC42.48■■■■■ 4.39
KCNA6P17658 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC42.46■■■■■ 4.39
KCNA6P17658 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
KCNA6P17658 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC42.45■■■■■ 4.39
KCNA6P17658 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
KCNA6P17658 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
KCNA6P17658 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.42■■■■■ 4.38
KCNA6P17658 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC42.42■■■■■ 4.38
KCNA6P17658 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC42.42■■■■■ 4.38
KCNA6P17658 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 313 ms