Protein–RNA interactions for Protein: U3KQK5

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQK5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
U3KQK5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
U3KQK5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
U3KQK5 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
U3KQK5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
U3KQK5 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
U3KQK5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
U3KQK5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
U3KQK5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
U3KQK5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
U3KQK5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
U3KQK5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
U3KQK5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
U3KQK5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
U3KQK5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
U3KQK5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
U3KQK5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
U3KQK5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
U3KQK5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
U3KQK5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
U3KQK5 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
U3KQK5 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
U3KQK5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
U3KQK5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
U3KQK5 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
U3KQK5 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
U3KQK5 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
U3KQK5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
U3KQK5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
U3KQK5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
U3KQK5 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
U3KQK5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
U3KQK5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
U3KQK5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
U3KQK5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
U3KQK5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
U3KQK5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
U3KQK5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
U3KQK5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
U3KQK5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
U3KQK5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
U3KQK5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
U3KQK5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
U3KQK5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
U3KQK5 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
U3KQK5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
U3KQK5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
U3KQK5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
U3KQK5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
U3KQK5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
U3KQK5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
U3KQK5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
U3KQK5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
U3KQK5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
U3KQK5 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
U3KQK5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
U3KQK5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
U3KQK5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
U3KQK5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
U3KQK5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
U3KQK5 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
U3KQK5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
U3KQK5 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
U3KQK5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
U3KQK5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
U3KQK5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
U3KQK5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
U3KQK5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
U3KQK5 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
U3KQK5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
U3KQK5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
U3KQK5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
U3KQK5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
U3KQK5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
U3KQK5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
U3KQK5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
U3KQK5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
U3KQK5 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
U3KQK5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
U3KQK5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
U3KQK5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
U3KQK5 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
U3KQK5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
U3KQK5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
U3KQK5 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
U3KQK5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
U3KQK5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.3■■□□□ 1
U3KQK5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
U3KQK5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
U3KQK5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
U3KQK5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
U3KQK5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
U3KQK5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
U3KQK5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
U3KQK5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
U3KQK5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
U3KQK5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
U3KQK5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
U3KQK5 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
U3KQK5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108 ms