Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRAPPC1Q9Y5R8 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC1Q9Y5R8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC1Q9Y5R8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC1Q9Y5R8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC1Q9Y5R8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC1Q9Y5R8 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC1Q9Y5R8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC1Q9Y5R8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC1Q9Y5R8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC1Q9Y5R8 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC1Q9Y5R8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAPPC1Q9Y5R8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAPPC1Q9Y5R8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC1Q9Y5R8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC1Q9Y5R8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC1Q9Y5R8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC1Q9Y5R8 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC1Q9Y5R8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC1Q9Y5R8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
TRAPPC1Q9Y5R8 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC1Q9Y5R8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC1Q9Y5R8 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC1Q9Y5R8 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC1Q9Y5R8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAPPC1Q9Y5R8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAPPC1Q9Y5R8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAPPC1Q9Y5R8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAPPC1Q9Y5R8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAPPC1Q9Y5R8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAPPC1Q9Y5R8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAPPC1Q9Y5R8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC1Q9Y5R8 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC1Q9Y5R8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC1Q9Y5R8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC1Q9Y5R8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAPPC1Q9Y5R8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAPPC1Q9Y5R8 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAPPC1Q9Y5R8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAPPC1Q9Y5R8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC1Q9Y5R8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC1Q9Y5R8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC1Q9Y5R8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC1Q9Y5R8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TRAPPC1Q9Y5R8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC1Q9Y5R8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC1Q9Y5R8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC1Q9Y5R8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC1Q9Y5R8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC1Q9Y5R8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC1Q9Y5R8 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC1Q9Y5R8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC1Q9Y5R8 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC1Q9Y5R8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC1Q9Y5R8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC1Q9Y5R8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC1Q9Y5R8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC1Q9Y5R8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC1Q9Y5R8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC1Q9Y5R8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC1Q9Y5R8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC1Q9Y5R8 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC1Q9Y5R8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC1Q9Y5R8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC1Q9Y5R8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC1Q9Y5R8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC1Q9Y5R8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC1Q9Y5R8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC1Q9Y5R8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC1Q9Y5R8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC1Q9Y5R8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC1Q9Y5R8 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC1Q9Y5R8 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC1Q9Y5R8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC1Q9Y5R8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC1Q9Y5R8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC1Q9Y5R8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC1Q9Y5R8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC1Q9Y5R8 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC1Q9Y5R8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC1Q9Y5R8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC1Q9Y5R8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC1Q9Y5R8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC1Q9Y5R8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC1Q9Y5R8 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRAPPC1Q9Y5R8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRAPPC1Q9Y5R8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC1Q9Y5R8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC1Q9Y5R8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC1Q9Y5R8 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC1Q9Y5R8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC1Q9Y5R8 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC1Q9Y5R8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC1Q9Y5R8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC1Q9Y5R8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.33■■□□□ 1
TRAPPC1Q9Y5R8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC1Q9Y5R8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC1Q9Y5R8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms