Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5G1

PCDHGB3, Protocadherin gamma-B3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHGB3Q9Y5G1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PCDHGB3Q9Y5G1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCDHGB3Q9Y5G1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCDHGB3Q9Y5G1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCDHGB3Q9Y5G1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCDHGB3Q9Y5G1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PCDHGB3Q9Y5G1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PCDHGB3Q9Y5G1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PCDHGB3Q9Y5G1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCDHGB3Q9Y5G1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCDHGB3Q9Y5G1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCDHGB3Q9Y5G1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCDHGB3Q9Y5G1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCDHGB3Q9Y5G1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCDHGB3Q9Y5G1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCDHGB3Q9Y5G1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCDHGB3Q9Y5G1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PCDHGB3Q9Y5G1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCDHGB3Q9Y5G1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCDHGB3Q9Y5G1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCDHGB3Q9Y5G1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCDHGB3Q9Y5G1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCDHGB3Q9Y5G1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCDHGB3Q9Y5G1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCDHGB3Q9Y5G1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCDHGB3Q9Y5G1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCDHGB3Q9Y5G1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCDHGB3Q9Y5G1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCDHGB3Q9Y5G1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCDHGB3Q9Y5G1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCDHGB3Q9Y5G1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCDHGB3Q9Y5G1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PCDHGB3Q9Y5G1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PCDHGB3Q9Y5G1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PCDHGB3Q9Y5G1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PCDHGB3Q9Y5G1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PCDHGB3Q9Y5G1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PCDHGB3Q9Y5G1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PCDHGB3Q9Y5G1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PCDHGB3Q9Y5G1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PCDHGB3Q9Y5G1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PCDHGB3Q9Y5G1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCDHGB3Q9Y5G1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCDHGB3Q9Y5G1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCDHGB3Q9Y5G1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCDHGB3Q9Y5G1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCDHGB3Q9Y5G1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PCDHGB3Q9Y5G1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PCDHGB3Q9Y5G1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PCDHGB3Q9Y5G1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PCDHGB3Q9Y5G1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCDHGB3Q9Y5G1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCDHGB3Q9Y5G1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCDHGB3Q9Y5G1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCDHGB3Q9Y5G1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCDHGB3Q9Y5G1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCDHGB3Q9Y5G1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCDHGB3Q9Y5G1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCDHGB3Q9Y5G1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCDHGB3Q9Y5G1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCDHGB3Q9Y5G1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCDHGB3Q9Y5G1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCDHGB3Q9Y5G1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PCDHGB3Q9Y5G1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCDHGB3Q9Y5G1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCDHGB3Q9Y5G1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCDHGB3Q9Y5G1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCDHGB3Q9Y5G1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCDHGB3Q9Y5G1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCDHGB3Q9Y5G1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PCDHGB3Q9Y5G1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PCDHGB3Q9Y5G1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PCDHGB3Q9Y5G1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PCDHGB3Q9Y5G1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PCDHGB3Q9Y5G1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PCDHGB3Q9Y5G1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PCDHGB3Q9Y5G1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PCDHGB3Q9Y5G1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PCDHGB3Q9Y5G1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PCDHGB3Q9Y5G1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PCDHGB3Q9Y5G1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PCDHGB3Q9Y5G1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PCDHGB3Q9Y5G1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PCDHGB3Q9Y5G1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PCDHGB3Q9Y5G1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PCDHGB3Q9Y5G1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PCDHGB3Q9Y5G1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCDHGB3Q9Y5G1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PCDHGB3Q9Y5G1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PCDHGB3Q9Y5G1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PCDHGB3Q9Y5G1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PCDHGB3Q9Y5G1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PCDHGB3Q9Y5G1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCDHGB3Q9Y5G1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCDHGB3Q9Y5G1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCDHGB3Q9Y5G1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCDHGB3Q9Y5G1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCDHGB3Q9Y5G1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCDHGB3Q9Y5G1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCDHGB3Q9Y5G1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 183.8 ms