Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E1

PCDHB9, Protocadherin beta-9, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB9Q9Y5E1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PCDHB9Q9Y5E1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PCDHB9Q9Y5E1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PCDHB9Q9Y5E1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PCDHB9Q9Y5E1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PCDHB9Q9Y5E1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PCDHB9Q9Y5E1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PCDHB9Q9Y5E1 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PCDHB9Q9Y5E1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PCDHB9Q9Y5E1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PCDHB9Q9Y5E1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PCDHB9Q9Y5E1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PCDHB9Q9Y5E1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PCDHB9Q9Y5E1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PCDHB9Q9Y5E1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PCDHB9Q9Y5E1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
PCDHB9Q9Y5E1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PCDHB9Q9Y5E1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PCDHB9Q9Y5E1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PCDHB9Q9Y5E1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PCDHB9Q9Y5E1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PCDHB9Q9Y5E1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PCDHB9Q9Y5E1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PCDHB9Q9Y5E1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PCDHB9Q9Y5E1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PCDHB9Q9Y5E1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PCDHB9Q9Y5E1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PCDHB9Q9Y5E1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
PCDHB9Q9Y5E1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PCDHB9Q9Y5E1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PCDHB9Q9Y5E1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PCDHB9Q9Y5E1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PCDHB9Q9Y5E1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PCDHB9Q9Y5E1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PCDHB9Q9Y5E1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PCDHB9Q9Y5E1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PCDHB9Q9Y5E1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PCDHB9Q9Y5E1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PCDHB9Q9Y5E1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PCDHB9Q9Y5E1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PCDHB9Q9Y5E1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PCDHB9Q9Y5E1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PCDHB9Q9Y5E1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PCDHB9Q9Y5E1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PCDHB9Q9Y5E1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PCDHB9Q9Y5E1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PCDHB9Q9Y5E1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PCDHB9Q9Y5E1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
PCDHB9Q9Y5E1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PCDHB9Q9Y5E1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PCDHB9Q9Y5E1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.2
PCDHB9Q9Y5E1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PCDHB9Q9Y5E1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PCDHB9Q9Y5E1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PCDHB9Q9Y5E1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PCDHB9Q9Y5E1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PCDHB9Q9Y5E1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PCDHB9Q9Y5E1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PCDHB9Q9Y5E1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PCDHB9Q9Y5E1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PCDHB9Q9Y5E1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PCDHB9Q9Y5E1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PCDHB9Q9Y5E1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PCDHB9Q9Y5E1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PCDHB9Q9Y5E1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PCDHB9Q9Y5E1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
PCDHB9Q9Y5E1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PCDHB9Q9Y5E1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PCDHB9Q9Y5E1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PCDHB9Q9Y5E1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PCDHB9Q9Y5E1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PCDHB9Q9Y5E1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PCDHB9Q9Y5E1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PCDHB9Q9Y5E1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PCDHB9Q9Y5E1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PCDHB9Q9Y5E1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PCDHB9Q9Y5E1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PCDHB9Q9Y5E1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PCDHB9Q9Y5E1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PCDHB9Q9Y5E1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PCDHB9Q9Y5E1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
PCDHB9Q9Y5E1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PCDHB9Q9Y5E1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PCDHB9Q9Y5E1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PCDHB9Q9Y5E1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PCDHB9Q9Y5E1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PCDHB9Q9Y5E1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PCDHB9Q9Y5E1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PCDHB9Q9Y5E1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PCDHB9Q9Y5E1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PCDHB9Q9Y5E1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PCDHB9Q9Y5E1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PCDHB9Q9Y5E1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PCDHB9Q9Y5E1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PCDHB9Q9Y5E1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PCDHB9Q9Y5E1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PCDHB9Q9Y5E1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PCDHB9Q9Y5E1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PCDHB9Q9Y5E1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PCDHB9Q9Y5E1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.2 ms