Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK05

GDF2, Growth/differentiation factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF2Q9UK05 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GDF2Q9UK05 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GDF2Q9UK05 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GDF2Q9UK05 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GDF2Q9UK05 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GDF2Q9UK05 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GDF2Q9UK05 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GDF2Q9UK05 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GDF2Q9UK05 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GDF2Q9UK05 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GDF2Q9UK05 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GDF2Q9UK05 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GDF2Q9UK05 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GDF2Q9UK05 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GDF2Q9UK05 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GDF2Q9UK05 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GDF2Q9UK05 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GDF2Q9UK05 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GDF2Q9UK05 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GDF2Q9UK05 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GDF2Q9UK05 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GDF2Q9UK05 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GDF2Q9UK05 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GDF2Q9UK05 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GDF2Q9UK05 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GDF2Q9UK05 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GDF2Q9UK05 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GDF2Q9UK05 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GDF2Q9UK05 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GDF2Q9UK05 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GDF2Q9UK05 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GDF2Q9UK05 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GDF2Q9UK05 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GDF2Q9UK05 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GDF2Q9UK05 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GDF2Q9UK05 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GDF2Q9UK05 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GDF2Q9UK05 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GDF2Q9UK05 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GDF2Q9UK05 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GDF2Q9UK05 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GDF2Q9UK05 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GDF2Q9UK05 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GDF2Q9UK05 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GDF2Q9UK05 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GDF2Q9UK05 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GDF2Q9UK05 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GDF2Q9UK05 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GDF2Q9UK05 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GDF2Q9UK05 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GDF2Q9UK05 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GDF2Q9UK05 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GDF2Q9UK05 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GDF2Q9UK05 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GDF2Q9UK05 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GDF2Q9UK05 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GDF2Q9UK05 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GDF2Q9UK05 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GDF2Q9UK05 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GDF2Q9UK05 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GDF2Q9UK05 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GDF2Q9UK05 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GDF2Q9UK05 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GDF2Q9UK05 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GDF2Q9UK05 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GDF2Q9UK05 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GDF2Q9UK05 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GDF2Q9UK05 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GDF2Q9UK05 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GDF2Q9UK05 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GDF2Q9UK05 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GDF2Q9UK05 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GDF2Q9UK05 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GDF2Q9UK05 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GDF2Q9UK05 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GDF2Q9UK05 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GDF2Q9UK05 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GDF2Q9UK05 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GDF2Q9UK05 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GDF2Q9UK05 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GDF2Q9UK05 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GDF2Q9UK05 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GDF2Q9UK05 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GDF2Q9UK05 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GDF2Q9UK05 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GDF2Q9UK05 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GDF2Q9UK05 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GDF2Q9UK05 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GDF2Q9UK05 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GDF2Q9UK05 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GDF2Q9UK05 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GDF2Q9UK05 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GDF2Q9UK05 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GDF2Q9UK05 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GDF2Q9UK05 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GDF2Q9UK05 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GDF2Q9UK05 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GDF2Q9UK05 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GDF2Q9UK05 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GDF2Q9UK05 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms