Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RABGEF1Q9UJ41 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RABGEF1Q9UJ41 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RABGEF1Q9UJ41 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RABGEF1Q9UJ41 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RABGEF1Q9UJ41 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RABGEF1Q9UJ41 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RABGEF1Q9UJ41 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RABGEF1Q9UJ41 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
RABGEF1Q9UJ41 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RABGEF1Q9UJ41 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RABGEF1Q9UJ41 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RABGEF1Q9UJ41 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RABGEF1Q9UJ41 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RABGEF1Q9UJ41 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RABGEF1Q9UJ41 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RABGEF1Q9UJ41 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RABGEF1Q9UJ41 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RABGEF1Q9UJ41 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RABGEF1Q9UJ41 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RABGEF1Q9UJ41 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RABGEF1Q9UJ41 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RABGEF1Q9UJ41 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RABGEF1Q9UJ41 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RABGEF1Q9UJ41 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RABGEF1Q9UJ41 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
RABGEF1Q9UJ41 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RABGEF1Q9UJ41 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RABGEF1Q9UJ41 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RABGEF1Q9UJ41 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
RABGEF1Q9UJ41 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RABGEF1Q9UJ41 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RABGEF1Q9UJ41 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RABGEF1Q9UJ41 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RABGEF1Q9UJ41 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RABGEF1Q9UJ41 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RABGEF1Q9UJ41 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RABGEF1Q9UJ41 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RABGEF1Q9UJ41 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RABGEF1Q9UJ41 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RABGEF1Q9UJ41 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RABGEF1Q9UJ41 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RABGEF1Q9UJ41 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RABGEF1Q9UJ41 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RABGEF1Q9UJ41 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RABGEF1Q9UJ41 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RABGEF1Q9UJ41 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RABGEF1Q9UJ41 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RABGEF1Q9UJ41 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RABGEF1Q9UJ41 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RABGEF1Q9UJ41 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RABGEF1Q9UJ41 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RABGEF1Q9UJ41 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RABGEF1Q9UJ41 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RABGEF1Q9UJ41 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RABGEF1Q9UJ41 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RABGEF1Q9UJ41 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RABGEF1Q9UJ41 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RABGEF1Q9UJ41 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RABGEF1Q9UJ41 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RABGEF1Q9UJ41 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RABGEF1Q9UJ41 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RABGEF1Q9UJ41 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RABGEF1Q9UJ41 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RABGEF1Q9UJ41 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RABGEF1Q9UJ41 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RABGEF1Q9UJ41 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RABGEF1Q9UJ41 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RABGEF1Q9UJ41 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RABGEF1Q9UJ41 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RABGEF1Q9UJ41 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RABGEF1Q9UJ41 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RABGEF1Q9UJ41 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RABGEF1Q9UJ41 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RABGEF1Q9UJ41 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
RABGEF1Q9UJ41 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RABGEF1Q9UJ41 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RABGEF1Q9UJ41 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RABGEF1Q9UJ41 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RABGEF1Q9UJ41 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RABGEF1Q9UJ41 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RABGEF1Q9UJ41 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RABGEF1Q9UJ41 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RABGEF1Q9UJ41 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RABGEF1Q9UJ41 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RABGEF1Q9UJ41 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RABGEF1Q9UJ41 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RABGEF1Q9UJ41 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RABGEF1Q9UJ41 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
RABGEF1Q9UJ41 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RABGEF1Q9UJ41 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RABGEF1Q9UJ41 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RABGEF1Q9UJ41 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RABGEF1Q9UJ41 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RABGEF1Q9UJ41 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RABGEF1Q9UJ41 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RABGEF1Q9UJ41 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RABGEF1Q9UJ41 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RABGEF1Q9UJ41 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RABGEF1Q9UJ41 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
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