Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV9

PFDN2, Prefoldin subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN2Q9UHV9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PFDN2Q9UHV9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PFDN2Q9UHV9 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PFDN2Q9UHV9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PFDN2Q9UHV9 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PFDN2Q9UHV9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PFDN2Q9UHV9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PFDN2Q9UHV9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PFDN2Q9UHV9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PFDN2Q9UHV9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PFDN2Q9UHV9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PFDN2Q9UHV9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PFDN2Q9UHV9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PFDN2Q9UHV9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PFDN2Q9UHV9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PFDN2Q9UHV9 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PFDN2Q9UHV9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PFDN2Q9UHV9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PFDN2Q9UHV9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PFDN2Q9UHV9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PFDN2Q9UHV9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PFDN2Q9UHV9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PFDN2Q9UHV9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PFDN2Q9UHV9 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PFDN2Q9UHV9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PFDN2Q9UHV9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PFDN2Q9UHV9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PFDN2Q9UHV9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PFDN2Q9UHV9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PFDN2Q9UHV9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PFDN2Q9UHV9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PFDN2Q9UHV9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PFDN2Q9UHV9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PFDN2Q9UHV9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PFDN2Q9UHV9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PFDN2Q9UHV9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PFDN2Q9UHV9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PFDN2Q9UHV9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PFDN2Q9UHV9 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PFDN2Q9UHV9 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PFDN2Q9UHV9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PFDN2Q9UHV9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PFDN2Q9UHV9 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PFDN2Q9UHV9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PFDN2Q9UHV9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PFDN2Q9UHV9 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PFDN2Q9UHV9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PFDN2Q9UHV9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PFDN2Q9UHV9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PFDN2Q9UHV9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PFDN2Q9UHV9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PFDN2Q9UHV9 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PFDN2Q9UHV9 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PFDN2Q9UHV9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PFDN2Q9UHV9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PFDN2Q9UHV9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PFDN2Q9UHV9 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PFDN2Q9UHV9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PFDN2Q9UHV9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PFDN2Q9UHV9 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PFDN2Q9UHV9 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PFDN2Q9UHV9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PFDN2Q9UHV9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PFDN2Q9UHV9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PFDN2Q9UHV9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PFDN2Q9UHV9 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PFDN2Q9UHV9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PFDN2Q9UHV9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PFDN2Q9UHV9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PFDN2Q9UHV9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PFDN2Q9UHV9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PFDN2Q9UHV9 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PFDN2Q9UHV9 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PFDN2Q9UHV9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PFDN2Q9UHV9 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PFDN2Q9UHV9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PFDN2Q9UHV9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PFDN2Q9UHV9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PFDN2Q9UHV9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PFDN2Q9UHV9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PFDN2Q9UHV9 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PFDN2Q9UHV9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PFDN2Q9UHV9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PFDN2Q9UHV9 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PFDN2Q9UHV9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PFDN2Q9UHV9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PFDN2Q9UHV9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PFDN2Q9UHV9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PFDN2Q9UHV9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PFDN2Q9UHV9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PFDN2Q9UHV9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PFDN2Q9UHV9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PFDN2Q9UHV9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PFDN2Q9UHV9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PFDN2Q9UHV9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PFDN2Q9UHV9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PFDN2Q9UHV9 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PFDN2Q9UHV9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PFDN2Q9UHV9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PFDN2Q9UHV9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87 ms