Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DKK2Q9UBU2 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DKK2Q9UBU2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DKK2Q9UBU2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DKK2Q9UBU2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DKK2Q9UBU2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DKK2Q9UBU2 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
DKK2Q9UBU2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DKK2Q9UBU2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DKK2Q9UBU2 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DKK2Q9UBU2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DKK2Q9UBU2 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DKK2Q9UBU2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
DKK2Q9UBU2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DKK2Q9UBU2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DKK2Q9UBU2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DKK2Q9UBU2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DKK2Q9UBU2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DKK2Q9UBU2 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DKK2Q9UBU2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
DKK2Q9UBU2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DKK2Q9UBU2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DKK2Q9UBU2 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DKK2Q9UBU2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DKK2Q9UBU2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DKK2Q9UBU2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DKK2Q9UBU2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DKK2Q9UBU2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DKK2Q9UBU2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DKK2Q9UBU2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DKK2Q9UBU2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DKK2Q9UBU2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DKK2Q9UBU2 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DKK2Q9UBU2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DKK2Q9UBU2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DKK2Q9UBU2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
DKK2Q9UBU2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DKK2Q9UBU2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DKK2Q9UBU2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DKK2Q9UBU2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DKK2Q9UBU2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DKK2Q9UBU2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DKK2Q9UBU2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
DKK2Q9UBU2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DKK2Q9UBU2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DKK2Q9UBU2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DKK2Q9UBU2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DKK2Q9UBU2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DKK2Q9UBU2 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DKK2Q9UBU2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DKK2Q9UBU2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DKK2Q9UBU2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DKK2Q9UBU2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DKK2Q9UBU2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DKK2Q9UBU2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DKK2Q9UBU2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DKK2Q9UBU2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
DKK2Q9UBU2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
DKK2Q9UBU2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
DKK2Q9UBU2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
DKK2Q9UBU2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
DKK2Q9UBU2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DKK2Q9UBU2 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DKK2Q9UBU2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DKK2Q9UBU2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DKK2Q9UBU2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DKK2Q9UBU2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DKK2Q9UBU2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DKK2Q9UBU2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DKK2Q9UBU2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DKK2Q9UBU2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DKK2Q9UBU2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DKK2Q9UBU2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DKK2Q9UBU2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DKK2Q9UBU2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DKK2Q9UBU2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DKK2Q9UBU2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DKK2Q9UBU2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DKK2Q9UBU2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DKK2Q9UBU2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DKK2Q9UBU2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DKK2Q9UBU2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
DKK2Q9UBU2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DKK2Q9UBU2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DKK2Q9UBU2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DKK2Q9UBU2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DKK2Q9UBU2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DKK2Q9UBU2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DKK2Q9UBU2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DKK2Q9UBU2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DKK2Q9UBU2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DKK2Q9UBU2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DKK2Q9UBU2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DKK2Q9UBU2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DKK2Q9UBU2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DKK2Q9UBU2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DKK2Q9UBU2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DKK2Q9UBU2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DKK2Q9UBU2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DKK2Q9UBU2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms