Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
XCL2Q9UBD3 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
XCL2Q9UBD3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
XCL2Q9UBD3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
XCL2Q9UBD3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
XCL2Q9UBD3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
XCL2Q9UBD3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
XCL2Q9UBD3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
XCL2Q9UBD3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
XCL2Q9UBD3 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
XCL2Q9UBD3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
XCL2Q9UBD3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
XCL2Q9UBD3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
XCL2Q9UBD3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
XCL2Q9UBD3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
XCL2Q9UBD3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
XCL2Q9UBD3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
XCL2Q9UBD3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
XCL2Q9UBD3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
XCL2Q9UBD3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
XCL2Q9UBD3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
XCL2Q9UBD3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
XCL2Q9UBD3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
XCL2Q9UBD3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
XCL2Q9UBD3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
XCL2Q9UBD3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
XCL2Q9UBD3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
XCL2Q9UBD3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
XCL2Q9UBD3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
XCL2Q9UBD3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
XCL2Q9UBD3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
XCL2Q9UBD3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
XCL2Q9UBD3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
XCL2Q9UBD3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
XCL2Q9UBD3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
XCL2Q9UBD3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
XCL2Q9UBD3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
XCL2Q9UBD3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
XCL2Q9UBD3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
XCL2Q9UBD3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
XCL2Q9UBD3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
XCL2Q9UBD3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
XCL2Q9UBD3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
XCL2Q9UBD3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
XCL2Q9UBD3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
XCL2Q9UBD3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
XCL2Q9UBD3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
XCL2Q9UBD3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
XCL2Q9UBD3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
XCL2Q9UBD3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
XCL2Q9UBD3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
XCL2Q9UBD3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
XCL2Q9UBD3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
XCL2Q9UBD3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
XCL2Q9UBD3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
XCL2Q9UBD3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
XCL2Q9UBD3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
XCL2Q9UBD3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
XCL2Q9UBD3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
XCL2Q9UBD3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
XCL2Q9UBD3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
XCL2Q9UBD3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
XCL2Q9UBD3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
XCL2Q9UBD3 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
XCL2Q9UBD3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
XCL2Q9UBD3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
XCL2Q9UBD3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
XCL2Q9UBD3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
XCL2Q9UBD3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
XCL2Q9UBD3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
XCL2Q9UBD3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
XCL2Q9UBD3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
XCL2Q9UBD3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
XCL2Q9UBD3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
XCL2Q9UBD3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
XCL2Q9UBD3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
XCL2Q9UBD3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
XCL2Q9UBD3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
XCL2Q9UBD3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
XCL2Q9UBD3 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
XCL2Q9UBD3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
XCL2Q9UBD3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
XCL2Q9UBD3 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
XCL2Q9UBD3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
XCL2Q9UBD3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
XCL2Q9UBD3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
XCL2Q9UBD3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
XCL2Q9UBD3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
XCL2Q9UBD3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
XCL2Q9UBD3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
XCL2Q9UBD3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
XCL2Q9UBD3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
XCL2Q9UBD3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
XCL2Q9UBD3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
XCL2Q9UBD3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
XCL2Q9UBD3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
XCL2Q9UBD3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
XCL2Q9UBD3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
XCL2Q9UBD3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
XCL2Q9UBD3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms