Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
LRP2BPQ9P2M1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
LRP2BPQ9P2M1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
LRP2BPQ9P2M1 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
LRP2BPQ9P2M1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
LRP2BPQ9P2M1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
LRP2BPQ9P2M1 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
LRP2BPQ9P2M1 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
LRP2BPQ9P2M1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
LRP2BPQ9P2M1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.19
LRP2BPQ9P2M1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
LRP2BPQ9P2M1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
LRP2BPQ9P2M1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
LRP2BPQ9P2M1 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
LRP2BPQ9P2M1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
LRP2BPQ9P2M1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
LRP2BPQ9P2M1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
LRP2BPQ9P2M1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
LRP2BPQ9P2M1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
LRP2BPQ9P2M1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
LRP2BPQ9P2M1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
LRP2BPQ9P2M1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
LRP2BPQ9P2M1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
LRP2BPQ9P2M1 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
LRP2BPQ9P2M1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
LRP2BPQ9P2M1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.8■■■■□ 3.16
LRP2BPQ9P2M1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
LRP2BPQ9P2M1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
LRP2BPQ9P2M1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
LRP2BPQ9P2M1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
LRP2BPQ9P2M1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
LRP2BPQ9P2M1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
LRP2BPQ9P2M1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
LRP2BPQ9P2M1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
LRP2BPQ9P2M1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
LRP2BPQ9P2M1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
LRP2BPQ9P2M1 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
LRP2BPQ9P2M1 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
LRP2BPQ9P2M1 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
LRP2BPQ9P2M1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
LRP2BPQ9P2M1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
LRP2BPQ9P2M1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
LRP2BPQ9P2M1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
LRP2BPQ9P2M1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
LRP2BPQ9P2M1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
LRP2BPQ9P2M1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
LRP2BPQ9P2M1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
LRP2BPQ9P2M1 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC34.5■■■■□ 3.11
LRP2BPQ9P2M1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
LRP2BPQ9P2M1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
LRP2BPQ9P2M1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
LRP2BPQ9P2M1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
LRP2BPQ9P2M1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
LRP2BPQ9P2M1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
LRP2BPQ9P2M1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
LRP2BPQ9P2M1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC34.33■■■■□ 3.09
LRP2BPQ9P2M1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
LRP2BPQ9P2M1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC34.32■■■■□ 3.08
LRP2BPQ9P2M1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
LRP2BPQ9P2M1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
LRP2BPQ9P2M1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
LRP2BPQ9P2M1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
LRP2BPQ9P2M1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
LRP2BPQ9P2M1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
LRP2BPQ9P2M1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
LRP2BPQ9P2M1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
LRP2BPQ9P2M1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
LRP2BPQ9P2M1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
LRP2BPQ9P2M1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
LRP2BPQ9P2M1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
LRP2BPQ9P2M1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
LRP2BPQ9P2M1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
LRP2BPQ9P2M1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
LRP2BPQ9P2M1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
LRP2BPQ9P2M1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
LRP2BPQ9P2M1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
LRP2BPQ9P2M1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
LRP2BPQ9P2M1 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
LRP2BPQ9P2M1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC34.1■■■■□ 3.05
LRP2BPQ9P2M1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
LRP2BPQ9P2M1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
LRP2BPQ9P2M1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
LRP2BPQ9P2M1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
LRP2BPQ9P2M1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
LRP2BPQ9P2M1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
LRP2BPQ9P2M1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
LRP2BPQ9P2M1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
LRP2BPQ9P2M1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
LRP2BPQ9P2M1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
LRP2BPQ9P2M1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
LRP2BPQ9P2M1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
LRP2BPQ9P2M1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
LRP2BPQ9P2M1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
LRP2BPQ9P2M1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
LRP2BPQ9P2M1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
LRP2BPQ9P2M1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
LRP2BPQ9P2M1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
LRP2BPQ9P2M1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
LRP2BPQ9P2M1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
LRP2BPQ9P2M1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms