Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1A2

PPP4R1L, Putative serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R1LQ9P1A2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PPP4R1LQ9P1A2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPP4R1LQ9P1A2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PPP4R1LQ9P1A2 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PPP4R1LQ9P1A2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PPP4R1LQ9P1A2 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PPP4R1LQ9P1A2 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPP4R1LQ9P1A2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PPP4R1LQ9P1A2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PPP4R1LQ9P1A2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PPP4R1LQ9P1A2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PPP4R1LQ9P1A2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PPP4R1LQ9P1A2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PPP4R1LQ9P1A2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PPP4R1LQ9P1A2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PPP4R1LQ9P1A2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PPP4R1LQ9P1A2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PPP4R1LQ9P1A2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PPP4R1LQ9P1A2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PPP4R1LQ9P1A2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PPP4R1LQ9P1A2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PPP4R1LQ9P1A2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPP4R1LQ9P1A2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPP4R1LQ9P1A2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPP4R1LQ9P1A2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PPP4R1LQ9P1A2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PPP4R1LQ9P1A2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PPP4R1LQ9P1A2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PPP4R1LQ9P1A2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PPP4R1LQ9P1A2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PPP4R1LQ9P1A2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPP4R1LQ9P1A2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPP4R1LQ9P1A2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPP4R1LQ9P1A2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPP4R1LQ9P1A2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPP4R1LQ9P1A2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPP4R1LQ9P1A2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPP4R1LQ9P1A2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPP4R1LQ9P1A2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPP4R1LQ9P1A2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPP4R1LQ9P1A2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPP4R1LQ9P1A2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPP4R1LQ9P1A2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPP4R1LQ9P1A2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PPP4R1LQ9P1A2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPP4R1LQ9P1A2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPP4R1LQ9P1A2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPP4R1LQ9P1A2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPP4R1LQ9P1A2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPP4R1LQ9P1A2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PPP4R1LQ9P1A2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PPP4R1LQ9P1A2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PPP4R1LQ9P1A2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPP4R1LQ9P1A2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPP4R1LQ9P1A2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPP4R1LQ9P1A2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPP4R1LQ9P1A2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPP4R1LQ9P1A2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPP4R1LQ9P1A2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPP4R1LQ9P1A2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPP4R1LQ9P1A2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPP4R1LQ9P1A2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPP4R1LQ9P1A2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPP4R1LQ9P1A2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPP4R1LQ9P1A2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP4R1LQ9P1A2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPP4R1LQ9P1A2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPP4R1LQ9P1A2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPP4R1LQ9P1A2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPP4R1LQ9P1A2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPP4R1LQ9P1A2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPP4R1LQ9P1A2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPP4R1LQ9P1A2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPP4R1LQ9P1A2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPP4R1LQ9P1A2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPP4R1LQ9P1A2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPP4R1LQ9P1A2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPP4R1LQ9P1A2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PPP4R1LQ9P1A2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PPP4R1LQ9P1A2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPP4R1LQ9P1A2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPP4R1LQ9P1A2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPP4R1LQ9P1A2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPP4R1LQ9P1A2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPP4R1LQ9P1A2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPP4R1LQ9P1A2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPP4R1LQ9P1A2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPP4R1LQ9P1A2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPP4R1LQ9P1A2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPP4R1LQ9P1A2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPP4R1LQ9P1A2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPP4R1LQ9P1A2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPP4R1LQ9P1A2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPP4R1LQ9P1A2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPP4R1LQ9P1A2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPP4R1LQ9P1A2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPP4R1LQ9P1A2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPP4R1LQ9P1A2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPP4R1LQ9P1A2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP4R1LQ9P1A2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms