Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWS1

PARPBP, PCNA-interacting partner, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARPBPQ9NWS1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PARPBPQ9NWS1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PARPBPQ9NWS1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PARPBPQ9NWS1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PARPBPQ9NWS1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PARPBPQ9NWS1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PARPBPQ9NWS1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PARPBPQ9NWS1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PARPBPQ9NWS1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PARPBPQ9NWS1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PARPBPQ9NWS1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PARPBPQ9NWS1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PARPBPQ9NWS1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PARPBPQ9NWS1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PARPBPQ9NWS1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PARPBPQ9NWS1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PARPBPQ9NWS1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PARPBPQ9NWS1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PARPBPQ9NWS1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PARPBPQ9NWS1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PARPBPQ9NWS1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PARPBPQ9NWS1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PARPBPQ9NWS1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PARPBPQ9NWS1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PARPBPQ9NWS1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PARPBPQ9NWS1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PARPBPQ9NWS1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PARPBPQ9NWS1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PARPBPQ9NWS1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PARPBPQ9NWS1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PARPBPQ9NWS1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PARPBPQ9NWS1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PARPBPQ9NWS1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PARPBPQ9NWS1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PARPBPQ9NWS1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PARPBPQ9NWS1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PARPBPQ9NWS1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PARPBPQ9NWS1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PARPBPQ9NWS1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PARPBPQ9NWS1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PARPBPQ9NWS1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PARPBPQ9NWS1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PARPBPQ9NWS1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PARPBPQ9NWS1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PARPBPQ9NWS1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PARPBPQ9NWS1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PARPBPQ9NWS1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PARPBPQ9NWS1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PARPBPQ9NWS1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PARPBPQ9NWS1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PARPBPQ9NWS1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PARPBPQ9NWS1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PARPBPQ9NWS1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PARPBPQ9NWS1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PARPBPQ9NWS1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PARPBPQ9NWS1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PARPBPQ9NWS1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PARPBPQ9NWS1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PARPBPQ9NWS1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PARPBPQ9NWS1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PARPBPQ9NWS1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PARPBPQ9NWS1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PARPBPQ9NWS1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PARPBPQ9NWS1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PARPBPQ9NWS1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PARPBPQ9NWS1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PARPBPQ9NWS1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PARPBPQ9NWS1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PARPBPQ9NWS1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PARPBPQ9NWS1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PARPBPQ9NWS1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PARPBPQ9NWS1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PARPBPQ9NWS1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PARPBPQ9NWS1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PARPBPQ9NWS1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PARPBPQ9NWS1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PARPBPQ9NWS1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PARPBPQ9NWS1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PARPBPQ9NWS1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PARPBPQ9NWS1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PARPBPQ9NWS1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PARPBPQ9NWS1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PARPBPQ9NWS1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PARPBPQ9NWS1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PARPBPQ9NWS1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PARPBPQ9NWS1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PARPBPQ9NWS1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PARPBPQ9NWS1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PARPBPQ9NWS1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PARPBPQ9NWS1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PARPBPQ9NWS1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PARPBPQ9NWS1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PARPBPQ9NWS1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PARPBPQ9NWS1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PARPBPQ9NWS1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PARPBPQ9NWS1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PARPBPQ9NWS1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PARPBPQ9NWS1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PARPBPQ9NWS1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PARPBPQ9NWS1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms