Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KIAA1549Q9HCM3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KIAA1549Q9HCM3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KIAA1549Q9HCM3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KIAA1549Q9HCM3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KIAA1549Q9HCM3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
KIAA1549Q9HCM3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KIAA1549Q9HCM3 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KIAA1549Q9HCM3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KIAA1549Q9HCM3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KIAA1549Q9HCM3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KIAA1549Q9HCM3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KIAA1549Q9HCM3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KIAA1549Q9HCM3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KIAA1549Q9HCM3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KIAA1549Q9HCM3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KIAA1549Q9HCM3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KIAA1549Q9HCM3 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KIAA1549Q9HCM3 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KIAA1549Q9HCM3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KIAA1549Q9HCM3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KIAA1549Q9HCM3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
KIAA1549Q9HCM3 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
KIAA1549Q9HCM3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KIAA1549Q9HCM3 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KIAA1549Q9HCM3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
KIAA1549Q9HCM3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KIAA1549Q9HCM3 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KIAA1549Q9HCM3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KIAA1549Q9HCM3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KIAA1549Q9HCM3 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KIAA1549Q9HCM3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KIAA1549Q9HCM3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KIAA1549Q9HCM3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
KIAA1549Q9HCM3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KIAA1549Q9HCM3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KIAA1549Q9HCM3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KIAA1549Q9HCM3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KIAA1549Q9HCM3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KIAA1549Q9HCM3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KIAA1549Q9HCM3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KIAA1549Q9HCM3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KIAA1549Q9HCM3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KIAA1549Q9HCM3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KIAA1549Q9HCM3 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KIAA1549Q9HCM3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KIAA1549Q9HCM3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KIAA1549Q9HCM3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KIAA1549Q9HCM3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KIAA1549Q9HCM3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KIAA1549Q9HCM3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KIAA1549Q9HCM3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KIAA1549Q9HCM3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KIAA1549Q9HCM3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KIAA1549Q9HCM3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KIAA1549Q9HCM3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KIAA1549Q9HCM3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KIAA1549Q9HCM3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KIAA1549Q9HCM3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KIAA1549Q9HCM3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KIAA1549Q9HCM3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
KIAA1549Q9HCM3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KIAA1549Q9HCM3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KIAA1549Q9HCM3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KIAA1549Q9HCM3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KIAA1549Q9HCM3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KIAA1549Q9HCM3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KIAA1549Q9HCM3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
KIAA1549Q9HCM3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KIAA1549Q9HCM3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KIAA1549Q9HCM3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KIAA1549Q9HCM3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KIAA1549Q9HCM3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KIAA1549Q9HCM3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KIAA1549Q9HCM3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KIAA1549Q9HCM3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
KIAA1549Q9HCM3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
KIAA1549Q9HCM3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KIAA1549Q9HCM3 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KIAA1549Q9HCM3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KIAA1549Q9HCM3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KIAA1549Q9HCM3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KIAA1549Q9HCM3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KIAA1549Q9HCM3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
KIAA1549Q9HCM3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KIAA1549Q9HCM3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KIAA1549Q9HCM3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KIAA1549Q9HCM3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KIAA1549Q9HCM3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KIAA1549Q9HCM3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KIAA1549Q9HCM3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KIAA1549Q9HCM3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KIAA1549Q9HCM3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
KIAA1549Q9HCM3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KIAA1549Q9HCM3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KIAA1549Q9HCM3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KIAA1549Q9HCM3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KIAA1549Q9HCM3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KIAA1549Q9HCM3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KIAA1549Q9HCM3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms