Protein–RNA interactions for Protein: Q9H204

MED28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED28Q9H204 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MED28Q9H204 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MED28Q9H204 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MED28Q9H204 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MED28Q9H204 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MED28Q9H204 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MED28Q9H204 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MED28Q9H204 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MED28Q9H204 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MED28Q9H204 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MED28Q9H204 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MED28Q9H204 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MED28Q9H204 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MED28Q9H204 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MED28Q9H204 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MED28Q9H204 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MED28Q9H204 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MED28Q9H204 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MED28Q9H204 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MED28Q9H204 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MED28Q9H204 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MED28Q9H204 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MED28Q9H204 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MED28Q9H204 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MED28Q9H204 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MED28Q9H204 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MED28Q9H204 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MED28Q9H204 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MED28Q9H204 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MED28Q9H204 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MED28Q9H204 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MED28Q9H204 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MED28Q9H204 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MED28Q9H204 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MED28Q9H204 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MED28Q9H204 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MED28Q9H204 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MED28Q9H204 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MED28Q9H204 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MED28Q9H204 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MED28Q9H204 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MED28Q9H204 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MED28Q9H204 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MED28Q9H204 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MED28Q9H204 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MED28Q9H204 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MED28Q9H204 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MED28Q9H204 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MED28Q9H204 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MED28Q9H204 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MED28Q9H204 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MED28Q9H204 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MED28Q9H204 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MED28Q9H204 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MED28Q9H204 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MED28Q9H204 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MED28Q9H204 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MED28Q9H204 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MED28Q9H204 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MED28Q9H204 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MED28Q9H204 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MED28Q9H204 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MED28Q9H204 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MED28Q9H204 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MED28Q9H204 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MED28Q9H204 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MED28Q9H204 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MED28Q9H204 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MED28Q9H204 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MED28Q9H204 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MED28Q9H204 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MED28Q9H204 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MED28Q9H204 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MED28Q9H204 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MED28Q9H204 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MED28Q9H204 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MED28Q9H204 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MED28Q9H204 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MED28Q9H204 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MED28Q9H204 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MED28Q9H204 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MED28Q9H204 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MED28Q9H204 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MED28Q9H204 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MED28Q9H204 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MED28Q9H204 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MED28Q9H204 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MED28Q9H204 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MED28Q9H204 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MED28Q9H204 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MED28Q9H204 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
MED28Q9H204 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MED28Q9H204 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MED28Q9H204 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MED28Q9H204 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MED28Q9H204 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
MED28Q9H204 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MED28Q9H204 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MED28Q9H204 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MED28Q9H204 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms